| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,601,785 | Δ1 bp :: IS186 (–) +5 bp | coding (585‑589/618 nt) | hyfA → | hydrogenase 4 component A |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514273 = | NA (NA) | 24 (0.620) | 23/276 | 0.7 | 100% | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2601785 = | 0 (0.000) | coding (585/618 nt) | hyfA | hydrogenase 4 component A | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 29 (0.740) | 25/278 | 0.6 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2601789 | 0 (0.000) | coding (589/618 nt) | hyfA | hydrogenase 4 component A | |||||
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2514418‑2514273‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGC > NC_000913/2601785‑2601925 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:441022/1‑143 CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAGTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCCCGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:199727/1‑143 CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAGTACCCCAACCCTTAAGTTGGCGCTTATGGG > 1:127023/1‑143 tGGCAGTGCGTGCCGAGGTAGCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATAGAGGCCAGAGTTGCTGACCAGTTATCGTGAGCGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGGAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 2:129760/142‑1 CGGCATTACGTGCCGCAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 1:34422/143‑1 ggaATTGCGTCCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATTGGCCAGATTTGCTGACCAGTTATCGTGTGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAt < 2:111971/140‑2 TTACGTGTCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCATTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATC < 2:133134/143‑1 cgcAGTAGCCAGTTCTGCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCC < 1:79765/140‑1 CGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTGCCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCC < 1:231259/143‑1 CAGTTCGTGGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAG < 1:289979/143‑1 GTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGA < 2:697065/143‑1 TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAA > 2:646066/1‑143 GGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTCGCGCTTATGGGAGGATCCCGTTTCCGTCAATGAGGGGCGACGgt > 1:264499/1‑141 CCACTATGGGCCAGACTCGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGA < 1:112114/143‑1 CCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCCGGAGCAACGCTAATGGACGGCCTGCAA > 2:259580/1‑143 CTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACC > 1:531386/1‑143 TTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAGTACCACAACCCTTAAGATAGCGCTTATGGGAGGATGCCCTTTCCCTCACGCAGGAGCAACGCGAAGGGAGGCCCTGGAATGATTAACACGGTGGCT > 2:34195/1‑143 TCGTGAGACTAATTCAGCGGCACGTTGAATCCTATCAGGCGTAATACCCCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGAT < 2:450625/143‑1 GTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTC > 1:653735/1‑143 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTAAGGAGTGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATCCCCTGCCATTATTACCCTGCTCGCTGATTCTCCAT > 2:351357/1‑143 cggggCGTTGAATCGTATCTGGCGTAATACCACATTCGTGTAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCTCTTTCCATCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTATCCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTA < 2:23623/138‑1 GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCACTTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGT > 2:486706/1‑143 ATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCG < 1:482794/143‑1 TCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTT < 1:668557/143‑1 CGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACT < 1:437047/143‑1 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTC > 2:243052/1‑143 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACA < 1:88934/143‑1 TAGCGCGGATGGGAGGAGCCCCCTTCCCTCGCTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAGCCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATT < 2:452622/143‑1 CTTATGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGCCAGACTGGCTCTTCAGCT > 2:592644/1‑143 TGGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCGATCTGTTTGCTAGTGTGGCTTCGGTGGTTGGACGCGGTCTGGACAGAATGGCTATTAAACTTACC > 1:20013/1‑143 GGGAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGCTGCCTGGCAAGTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCG < 1:721083/143‑1 GAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTTTGGACAGGCTGTTTATTAAGCTTTCTGGC > 2:665423/1‑143 GAGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGC < 1:339977/143‑1 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2514418‑2514273‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaGGATCCCCTTTCCCTCACTCAGGAGCAACGCTAATGGATGCCCTGCAATTATTAACCTGGTCGCTGATTCTCTATCTGTTTGCTAGTCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGC > NC_000913/2601785‑2601925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |