Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 1196271 1211449 15179 13 [12] [12] 13 [icd]–[icdC] [icd],ymfD,ymfE,lit,intE,xisE,ymfH,ymfI,ymfJ,ymfK,ymfT,ymfL,ymfM,oweE,ymfN,aaaE,ymfR,beeE,jayE,ymfQ,ycfK,tfaP,tfaE,stfE,pinE,mcrA,[icdC]

CTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTA  >  NC_000913/1211406‑1211592
                                            |                                                                                                                                              
tgagatgaTGCTGCGCCATAGGGGTTGGACTGAAGCGGCTGAGCTGATGGTTAAAGGGATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAAATTATGACTTCGAGAGTGTGATGGAAGGCGCTAAGGTGCTGAAATGTTGACAGt                                              >  2:576019/8‑143 (MQ=255)
          ctggGCCATATGGGTTGGAATGAAGCGGATGACCTGATTGTTAAAGGGATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACAGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGc                                    <  1:394045/143‑1 (MQ=18)
          ctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGc                                    <  2:270534/143‑1 (MQ=255)
              gcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatc                                >  2:587969/1‑143 (MQ=255)
                tatagGGGGTCGACGGAAGCGGCTGACCGGATTGTGAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCGGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcat                              <  2:363145/142‑1 (MQ=18)
                    tGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCGGAGTGTTACAGGTATGGGAGGCGCGATCAATGCCAAGACCGTAACCGCTGCCGTCGGACGTGTGATGGAAGGCGCGAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaa                          <  2:11874/143‑1 (MQ=17)
                      gcttGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaaaa                        <  2:700201/141‑1 (MQ=255)
                                    ggCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTcc          >  1:619056/1‑143 (MQ=255)
                                     gCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTTGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCa         <  1:155145/143‑1 (MQ=255)
                                        gACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt      >  1:131532/1‑143 (MQ=255)
                                           cTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGtt   >  2:68997/1‑143 (MQ=255)
                                           cTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTGTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGtt   >  1:103827/1‑143 (MQ=255)
                                            tGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTa  >  1:727524/1‑143 (MQ=255)
                                            |                                                                                                                                              
CTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTA  >  NC_000913/1211406‑1211592

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: