Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 4,113,475 | G→A | 7.3% | L61L (TTG→TTA) ‡ | uspD → | universal stress protein D |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,113,475 | 0 | G | A | 7.3% | 200.2 / 5.7 | 78 | L61L (TTG→TTA) ‡ | uspD | universal stress protein D |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/25); new base A (3/3); total (50/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.24e-01 |
GAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTCT > NC_000913/4113335‑4113617 | gaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCTCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttgtt > 1:572455/1‑143 (MQ=255) gaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCGCCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttgtt < 1:793441/143‑1 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACGTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTga > 2:675646/1‑143 (MQ=255) tcTTGCTCGTCAATAGAGCCCGGGAGCTCGCCGGACATAATGCCGCTCCCCTGACGTTAATTCATATTGATGATCGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAACAATTGAAGAAt < 2:606190/142‑1 (MQ=255) cTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATa > 1:451920/1‑143 (MQ=255) tACGGGTGAAGAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAACAATTGAAGAATatc < 1:698940/143‑3 (MQ=255) aCTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGCTAATTCATATTGAAGATGGCTTAAGCGAGATCTATCCGGGCATCTACTTCCCTGCAAAAGACGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGt > 2:340491/1‑143 (MQ=255) cgtgcgcaTAAAGCCCTTGACCTCGCCAGACATAATGACGCGCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTACGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTc < 2:575833/136‑1 (MQ=255) tGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTGTCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAACAATTGAAGAATatcttc < 1:745411/143‑6 (MQ=255) tGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGACGATATTCTTCAATTGTTGAGGAATAAGTCg > 1:760315/1‑143 (MQ=255) tGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCCACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGCAGAATCACTCggct > 1:144504/1‑141 (MQ=255) gAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAGTAAGTGGGATa > 1:109385/1‑143 (MQ=255) gAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAACACTAAGTCGGATa > 2:163212/1‑143 (MQ=255) gAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTCAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGCTa > 1:331162/1‑143 (MQ=255) aaTAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAACATATTCTCCAATTGTTGCAGAATAAGTCGGATaa > 2:608195/1‑143 (MQ=255) agataggccTGGAGCTCGTCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAAc < 2:402517/136‑1 (MQ=255) aGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTACTTCATATTGATGATGGCCTAAGAGCGTTGTATATGGGTATCTACTTCCATGCAACAGAAGATATTCTTCAATTATTGAAGAACAAGTCGGAAAACaacc > 2:353771/1‑141 (MQ=255) gCCCTGGATCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCt < 1:69360/143‑1 (MQ=255) cccTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTg > 1:94838/1‑143 (MQ=255) ccTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCAGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGt > 2:792348/1‑143 (MQ=255) cTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGta > 2:491968/1‑143 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGATGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATGGTTGAAGACTAAGTCGGATAACAAGATGtat > 2:840826/1‑143 (MQ=255) ggAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGtata > 1:523151/1‑143 (MQ=255) cTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATGTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATCGTTGAAGAATAAGTCGGATAAGAAGCTGTATaaaat > 2:51953/1‑141 (MQ=255) cTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTGCCTGCCCCAGAAGATATTCTTCAATTGTTGCAGAATAAGTCGGTTAACACGCTGTATaaaat > 2:58074/1‑141 (MQ=255) tCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTg > 1:239496/1‑143 (MQ=255) cGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATACTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGa < 1:434193/143‑1 (MQ=255) gtcAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATACAGATTGATGAGGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGAc < 1:5907/141‑1 (MQ=255) gCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTAGAAGAATAAGACGGATAACAAACTGTATAAAATGAc > 2:465480/1‑143 (MQ=255) cAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGACTAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACgc > 1:275707/1‑142 (MQ=255) aCATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGcaaa > 1:72964/1‑143 (MQ=255) aCATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGagaa > 1:276435/1‑143 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATGTATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAata < 1:304567/143‑1 (MQ=255) aaTGTCGCTCACCTTACGTTAATTCATATTGTTGATGGCTGAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCGGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAatat < 2:187732/143‑1 (MQ=255) aaTGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAatat < 2:458163/143‑1 (MQ=255) aTGACGCTCACCTGACTTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATAtt < 2:125516/143‑1 (MQ=255) aTGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCCACAGAAGATATTCTTCACTTGTTGAAGAATAAGCCCGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATAtt > 2:623503/1‑143 (MQ=255) aTGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGTAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATAtt < 2:711206/143‑1 (MQ=255) gCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCACTg > 2:559915/1‑143 (MQ=255) ctctCCTGACGTTAATTCCTATTGATCATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATgg < 1:709277/143‑1 (MQ=255) ggaCCTGAGGGTAATTCATAGTGATGATGGCTTAAGAGAGGTGTATCCGGGGATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATGCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTGGGAGAACAAGGTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGc < 1:870984/141‑1 (MQ=255) cACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGcc > 2:167262/1‑143 (MQ=255) cACCGGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGcc < 1:536538/143‑1 (MQ=255) cTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACCTCCCTGCAACAGCAGATATTCTCCATTCGAAAGAAAATAAGTCGGATAACAAGCTGTAGAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGaa < 2:628711/143‑1 (MQ=255) aCGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGAc > 1:711185/1‑143 (MQ=255) cGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAATAGGAGATATGCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAACCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGccacacaca > 2:820492/1‑136 (MQ=255) tAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAACCCGACGAAAAATATTCAATGGCAGAAGACaa‑aa > 2:141252/1‑143 (MQ=255) tCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAGAAATATTAAAGGGCCGAAGACAA‑AAATga > 2:705660/1‑142 (MQ=255) tCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGc > 2:841528/1‑143 (MQ=255) tatTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTGTCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTa > 1:403924/1‑143 (MQ=255) tatTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAAAAGAAGATATTCTTCAATAGTTGAAGAATAAGTCGGATAAAAAGCTGTAGAAACTGACGAAAAAAATCCAAATGACGAAGGAAA‑AACTGCATa > 2:588892/1‑143 (MQ=255) ttGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTCCTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGAATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTAtt > 1:549202/1‑143 (MQ=255) ttGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCACTTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTAtt < 2:715149/143‑1 (MQ=255) ttGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAACAACCTTCAATGGCCGAAGACAC‑AACTGCGCAtt > 1:158189/1‑143 (MQ=255) tgatgGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAAc > 1:511257/1‑143 (MQ=255) gatgGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGACcg < 1:559915/143‑1 (MQ=255) cTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCTGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACAGCGTATAGAACGCAgaa > 2:11719/1‑142 (MQ=255) ttAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGCTATTCTTCAATTTTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATGGAAGGCGgaca > 2:583318/1‑141 (MQ=255) cGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCGACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATGAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAAAGCGGAGAAATGc > 2:128597/1‑143 (MQ=255) cGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGc < 1:482232/143‑1 (MQ=255) cgctGTACCCGTGTATCTACCTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAATCTGTATAACCTGACGCACAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCg < 1:263760/140‑1 (MQ=255) aGTTGTATCCGGGTATCCACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAACATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCg < 1:848015/143‑1 (MQ=255) ttGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATAGTTGATGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACCA‑AACTGCGTATTGACAGCGGAAAAACGCCGGa > 2:883734/1‑143 (MQ=255) gggTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACCGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACActgc > 1:575913/1‑143 (MQ=255) ggTATGTACTTTCCTGCAACAGAAGAGATTCTTCAATTGTGGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACActgct < 2:625407/143‑1 (MQ=255) cTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAA‑ACAACACCGGCGGTTTGCGCGCGAAGCACTGCCGGAAGCACTGCTGGaga > 1:197589/1‑141 (MQ=255) aCTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAAtt > 1:813867/1‑143 (MQ=255) cTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTa < 1:167262/143‑1 (MQ=255) ttCCCTGCAACAGAAGATACTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTAt < 1:17741/143‑1 (MQ=255) ccttGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAATAATTAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGc < 2:474017/140‑1 (MQ=255) ccTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCa > 1:298002/1‑143 (MQ=255) cTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCaa > 1:861271/1‑143 (MQ=255) cTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCAGAAGCACTGCTGGGAATTATGcgt > 1:682244/1‑141 (MQ=255) agaagaTATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAAAATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGCAAACACCGCTGGAAATTAAGCAAAAAGAGc > 2:683146/1‑143 (MQ=255) gaagaTATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCa < 1:657173/143‑1 (MQ=255) acttatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGCCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCTGAGGAATGCCGGGAACACTGCTGGAGCTTATGCAGAAAGCGCAGt > 1:240651/4‑143 (MQ=255) ttatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCACAAAGAGCAGTgg > 1:449107/2‑142 (MQ=255) ttaaTTGTTGAAGAATAAGTCTGATAACAAGCTGTATAAACGGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcctcc < 1:822266/141‑1 (MQ=255) aaTTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcctccct > 2:320508/1‑141 (MQ=255) aaTTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcctccat > 2:170262/1‑141 (MQ=255) tggttgAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGt < 2:173406/141‑1 (MQ=255) tgtggAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTc < 1:768371/143‑1 (MQ=255) gttgAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACGGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTCt < 1:463744/143‑1 (MQ=255) | GAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAA‑AACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTCT > NC_000913/4113335‑4113617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |