| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,323,426 | T→C | 11.2% | K309K (AAA→AAG) | phnD ← | phosphonate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,323,426 | 0 | T | C | 11.2% | 233.0 / 2.0 | 108 | K309K (AAA→AAG) | phnD | phosphonate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/44); new base C (15/2); total (61/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.27e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ACGCCTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAGCACCG > NC_000913/4323284‑4323568 | aCGCCTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGtt < 1:356191/143‑1 (MQ=255) gCCTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGtttt < 1:589477/143‑1 (MQ=255) ccTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGttttt < 1:271737/143‑1 (MQ=255) ccTGCACATTGGCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGttttt < 1:798107/143‑1 (MQ=255) ccTCCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGttttt < 1:99955/143‑1 (MQ=255) tGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGACTCTCGGTGGtttccgc > 2:420761/1‑139 (MQ=255) tGCACATTGTCGGAGGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGGTGTTGc > 1:191549/1‑143 (MQ=255) gCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGCATCTCGGTGGCTTTTGcc > 1:813278/1‑143 (MQ=255) aTTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCAGACCTCCGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCt > 1:246859/1‑143 (MQ=255) ttGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGTCCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCtt < 1:797215/143‑1 (MQ=255) gTCGGATAAGACGCCCCGGCGTCGCATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAAGTCTTTGCGTTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTGTTGCCACCTTGt > 2:581425/1‑143 (MQ=255) tccgATGCGACGCCGGGGCGTCTTATTCGTCCTATGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTc < 1:63282/140‑1 (MQ=255) tCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGCATCTCGGTGGTTTTTGACAGCTTGtg > 2:665279/1‑142 (MQ=255) tCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTc < 1:555311/143‑1 (MQ=255) tCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCTTTGCCAGCTTATc > 2:289777/1‑143 (MQ=255) gATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAAGCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTg > 1:235327/1‑143 (MQ=255) cGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCa < 1:6453/143‑1 (MQ=255) gACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGCATCTCGGTCGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCAt > 1:783661/1‑143 (MQ=255) gACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTcct > 1:52875/1‑141 (MQ=255) aCGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCAtt < 1:714177/143‑1 (MQ=255) gggCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTCGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGACTCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCCTTCAGTcc > 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cGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGTTGCCAGCTTGACCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCtttt > 2:22624/1‑143 (MQ=255) aCCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCa < 1:643098/143‑1 (MQ=255) cTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCTGCTTCTCCTTCTCGTTTATCTCAATATTGCTTTTCACg > 1:329288/1‑143 (MQ=255) tACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGTCAGCTTGTCATGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCgcgc > 2:392938/1‑143 (MQ=255) tACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCCCATTCAGTCCTTTATTGCTTATCACGc > 2:527970/1‑143 (MQ=255) aCGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGcc > 2:233952/1‑102 (MQ=255) gtcgtACGGCACCGCTCTCCTCGCCGACCCCATCGCGCTTAGCACGCCGGTCCGTCGGTCCCGGCCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCt < 2:737829/139‑1 (MQ=255) gATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCt > 1:80393/1‑143 (MQ=255) ctttACTGCACCGCGATACCCACCGGACTCATCGCGCTTCGCGCGTCGGTCAGGCGGTCCAGGTCCTCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTg < 2:29645/142‑1 (MQ=255) aTTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTg > 1:589169/1‑143 (MQ=255) tACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCTCTGCCAGATTGAACTGCTCATTCAGTCCTTTCTTGCTTTTGACGCCCTGctt > 2:246834/1‑141 (MQ=255) tGCCCCGGTTTACTCCCCGAACTCATCGCGCTTGGCGCGTTGTTGCGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCAtctc < 2:214293/143‑1 (MQ=255) tGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCAtcgc > 1:230585/1‑141 (MQ=255) cACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTCTGTCTGCTTGTCATGCTCATACAGGCCCTGATTGCGTTTCACGATCTGCATCCCtt > 2:72106/1‑143 (MQ=255) aCCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCttt > 2:843038/1‑143 (MQ=255) aCCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCttt < 1:133878/143‑1 (MQ=255) gCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTaaa < 1:620111/143‑1 (MQ=255) tttACTCACCGAACTCATCGCGCTGAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACa < 1:140255/143‑1 (MQ=255) aCTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGCATCTCGGGGGGTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCCGTCCTTTATTGCTTTTCCCGCCCTGCATCGCTTTAAAccggc > 1:172008/1‑139 (MQ=255) aCTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAgcg < 1:163822/143‑1 (MQ=255) aCCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATGTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCCGTCCTTTATTGCTTTTCTCGCCCTGCCTCTCTTTCAACAGCACGaa > 1:777575/1‑142 (MQ=255) aCCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTGCGGCCAGATTGGACAGCCAATTCAGTCCGTTATTGCGTTTACCGCCCTGCGTCTCTTTAAACAGCGCGAg > 2:644876/1‑143 (MQ=255) aCCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCTTTGCCACCTTGTCCAGCTCATTCAGCCCTCTATTGCTTTTCCCGCCCTTCATCTCTTTAAACAGCGCCAg > 2:294710/1‑143 (MQ=255) gagcTCATCGCGCTTAGCCCGCTGTTCCGGCGCTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTg < 2:471106/140‑1 (MQ=255) gAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCGCATTCAGTCCTTTATTGCTGTTCACGCCCTGCATCTCTTTCAACGGCGCGAGCTg > 1:104855/1‑143 (MQ=255) atctctTCGTGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTgg < 1:585737/141‑1 (MQ=255) aaCTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCTGTATCCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCTCGCCCTGGATACCTTTAAACAGCGCGACCTgg > 2:644304/1‑143 (MQ=255) cTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCGCTTTAACCAGCGCGAGCGGGCg > 1:514637/1‑143 (MQ=255) tCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTCTGTCAGCTTGTCCTGCACATTCAGTCCCTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTAGCGa > 2:270728/1‑143 (MQ=255) tCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGTTGCCAGCTTGTCCAGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTCCATCACTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGa > 2:147836/1‑143 (MQ=255) aTCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAAt > 1:252695/1‑143 (MQ=255) tCGCGCTGCGCCCGGTGTTCAGGCGGTCCAGGTCTTCCATCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAGCAGCGCGAGTTGGCGAATc < 2:826738/143‑1 (MQ=255) gcgcTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGGGAATCgg > 1:780905/1‑143 (MQ=255) gcgcTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCgg < 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gttCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGt < 1:854195/143‑1 (MQ=255) ttCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCCGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCGGCATCTCTTTACACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCCCCAGTGGCAGGTc > 1:199474/1‑143 (MQ=255) ttCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCCGCATCCTTGACATGCTCATTCAGTCCTTCATTGCTTTTCACGACCTGAATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCCGTTGCAggcc > 2:578641/1‑141 (MQ=255) tCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCg < 1:710304/143‑1 (MQ=255) aGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGGATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCt > 1:550476/1‑143 (MQ=255) gCGGTCTCGGTCGTCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCGGTACCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCGTTTCACGTCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTgg < 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ttgTCCTCCAGCTGCGCCTGAGTCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTCATTGCTTTTCACGCCCTGCCTCTCTTTAAACCGCGCGAGCTGGCGAATCGGCGCCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGcgcg < 2:416289/141‑1 (MQ=255) gggTCATCCAGCTGCGCCTGGATCTCGGTGGTCTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAGCAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGcgcg < 2:609749/142‑1 (MQ=255) ggTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGGTGGCAGCGCgg > 1:489340/1‑143 (MQ=255) ggTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGTAGCGCgg > 1:71686/1‑143 (MQ=255) ggTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCgg < 1:843038/143‑1 (MQ=255) tCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCCGCCTCATTAAAATGAAAATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGAGAGTCGGCCCCAGTTGCGGGTCGCTGGAAGAGCGGaa > 2:251834/1‑143 (MQ=255) tCAGCCAGCCGCGCGTGAAGCTCGGTCGCGTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGaa < 1:74582/143‑1 (MQ=255) ccAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCCCGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGgc > 1:697812/1‑143 (MQ=255) aGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGgcgc > 1:499259/1‑143 (MQ=255) tGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCgccca < 1:252268/143‑1 (MQ=255) cgcgcCTGAATCGCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCgccca < 1:502398/142‑1 (MQ=255) cgcCTGCGTCGCGGTGGTTTTTGCCTGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTGGATTGCTTTGCACGCCCTGCATCTCTTTAACCAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCgcccagc < 2:37260/143‑1 (MQ=255) cTGAATCTCGGTGGCTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCgcccagccca < 1:38874/143‑1 (MQ=255) tGACTCCCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGCCCTGCTCATTCCGTCCTTTCTGGCTTTTCCCGCCCTGCATCTCTTTAAACCGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGcccagcccag < 2:400268/143‑1 (MQ=255) tGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCGCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCGGGTCGCTGGCAGCGCGGAATGGCGcccagcgcag > 1:49384/1‑143 (MQ=255) tGAATCTCGGTGGGTTTTCCCCGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGcccagcccag < 1:251333/143‑1 (MQ=255) ctcGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGtt < 1:274975/143‑1 (MQ=255) ctcGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGtt < 1:818223/143‑1 (MQ=255) tcGGTGGTTGTTGTAAGATTGAACTAATCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCAGGCACTGCATCACTTTAAACAGCGCGAGCTTGAGAGTCCGCACCAGTTGCAGGTCGGTGGAGGCGCGGAATGGCGCCGAGTTCAggtcttc > 2:414644/1‑138 (MQ=255) gtggtCTTCGCCAGCTTGTCCTGCTCGTTCAGTCCTTTATGGCTTTCCACGCCGTGGATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAg < 2:840615/143‑1 (MQ=255) tggtTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGCGCTGGCGGATCGGCCCCAGTTGCAGGTCGCTGGAGGCGCGGAATGGCGCCGCGCCCAGGCGGTCCTGc > 2:120865/1‑143 (MQ=255) gttttttCCCAGCTTCGCCTGCTCATTCAGTCCTCTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAGCa < 1:114593/141‑1 (MQ=255) cgtTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAATCAGCGCGAGCTGGCGAGTCGGCAGCAGTTGCAGGGCGCCGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAGCa < 1:188808/142‑1 (MQ=255) ttttGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGAGCTTTCTGGCGCATCGACACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGCTCCAGCACCg > 2:820233/1‑143 (MQ=255) | ACGCCTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAGCACCG > NC_000913/4323284‑4323568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |