| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,774,207 | C→T | 6.0% | intergenic (+13/‑217) | mtlA → / → mtlD | mannitol‑specific PTS enzyme IICBA component/mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,774,207 | 0 | C | T | 6.0% | 173.1 / 3.1 | 67 | intergenic (+13/‑217) | mtlA/mtlD | mannitol‑specific PTS enzyme IICBA component/mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/24); new base T (2/2); total (41/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.60e-02 | |||||||||||
AACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCT > NC_000913/3774069‑3774345 | aacaacGAGCACATTCATGTTATCACCAGCCTGGCCAATGCACTGGGTGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCAGCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCtctc < 2:117592/143‑1 (MQ=255) ccacGACCACATGCAGGTGATCACCAGGCTGACCGTTGCCCTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCACCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAACCCCACCCTCTCca < 2:7606/141‑1 (MQ=255) caacGAGAACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGCACGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACAGCACCAGCGTGAATGAAGNGCTGGAACTACTGGCAGGTCGTAAGTAATCCACTCCTACCCTCTCca > 2:18658/1‑143 (MQ=255) aacGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCCGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCCCcac > 2:71435/1‑143 (MQ=255) acGAGCGCATTCAGGTTGTCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCAGCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAAGCCCACCCTCTCcaca < 2:201626/143‑1 (MQ=255) gCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACCCACCACCAGCGTCGATGAAGTGCTTGAACTGCTGGCAGGTCGTCAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATCga > 2:162938/1‑143 (MQ=255) gCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACACTCTCCACGTGga > 2:429047/1‑143 (MQ=255) aTTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATggcgcag > 2:217116/1‑138 (MQ=255) aTTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAg > 1:159977/1‑143 (MQ=255) aTTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTCGCAGGCCGTTTGTTTGCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAg > 1:194845/1‑143 (MQ=255) tCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGt > 2:415751/1‑143 (MQ=255) tCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGt > 2:401324/1‑143 (MQ=255) gTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTggga < 2:85669/143‑2 (MQ=255) cACCAGCCTGAGCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAAt < 1:266481/143‑1 (MQ=255) cACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGCGAAGGTGGGCTTAAt > 1:368706/1‑143 (MQ=255) cACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGCCAGCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAAt < 2:96378/143‑1 (MQ=255) cACCAGCCTGACCAATGCACGGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTgggattgga < 1:259363/143‑7 (MQ=38) aCCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGCGGGGTTAATGGCCGGATgc > 1:54275/1‑143 (MQ=255) aTGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGCGCTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCCCATGGAGGTGGTGGGGTGAATTGCCTGATGCGCtg > 1:314894/1‑142 (MQ=255) cattagatggtGAGTGCGTGATCGCGCGTCTGGCACACCCGACCAGCGTGGATGAAGTGCTTGAACTGCTGGCAGGTGGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGc < 2:180712/138‑1 (MQ=255) atgaGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTACGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGc > 1:30979/1‑143 (MQ=255) tcggTCAGCGCGCGTGTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTCGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACa < 2:293788/140‑1 (MQ=39) tCCGTCATCGAGCGGCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACa < 1:420752/143‑1 (MQ=255) tCCGGCATCGGGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGTGTTAATTGCCTGATTCGCTACGCTTATCAGGCCTAcc < 2:360329/143‑2 (MQ=255) cGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAgg > 1:331644/1‑143 (MQ=255) ggcagggAGCGTCTGGCCCACCGTCCCAGCGGGTCTGAAGGGCGGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGGAATCCAATCCCGCCCTGTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGa < 2:194689/137‑1 (MQ=25) gTCATGGCGCGTCGCGCACACAACACTAGCGTGGATGAAGGGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAGTCCCACCCTCTCCGCATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGa < 2:42384/143‑1 (MQ=38) tCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAggct > 1:388408/1‑141 (MQ=255) cATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATg < 1:113077/143‑1 (MQ=255) cGATCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGCGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACAGGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCAt < 1:130278/143‑1 (MQ=255) cGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCAt < 1:287579/143‑1 (MQ=255) aGCCTCTGGCACACACCCCCAGCGTGAACGAACGGCTGGAACTGCTGCCCCGTCGCAACTAATCCAATCCCACCCCCTCCACATGCAGAAGTTGGAGATAACTCCCTAATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATca < 2:33262/143‑1 (MQ=255) tCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCGGGCGTCCGGGATGCATCACCAt > 2:222266/1‑143 (MQ=255) gCACAGACCACCAGCGTGGATGAAGTGCGGGAACTGCTGGCAGGGCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgt < 1:280103/143‑1 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCGGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttg > 1:110279/1‑142 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCGGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttg < 2:110279/142‑1 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGCAGGTGGGGTTAATTAACTGATGCGATCAGATTTTCAGCCCGACAGGATGCATCACAATttgt > 1:318531/1‑143 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgt > 1:369248/1‑143 (MQ=255) acacacCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCAACCCTGTCCACATGGAGAAGGTGGGGCTAATTGCCTGACCCGCCCGGTCGGTCTGGGCTACAGGATGCATCACAACttgttg > 2:205261/1‑143 (MQ=255) gAAGTGCTGTAACTGCTGACAGGCCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGACGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAg < 1:268704/143‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAg < 2:159977/143‑1 (MQ=255) aGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGTAGGTGGGGTTAATTACCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGc > 1:128400/1‑143 (MQ=255) tGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATCTGTTGAGTTTGCACGTTCTTGTAGGCCg > 2:341912/1‑143 (MQ=255) gCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGACTTTGCACGTTCTTGTAGGCCgg > 1:76183/1‑143 (MQ=255) gCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCgg > 1:298719/1‑143 (MQ=255) tGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGAt > 2:356570/1‑143 (MQ=255) gAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACGTGGAGAAGGTGGGGTGAATTGCCTGAGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATGTGCACGTTCTCGTAGGCCggttga > 1:69630/1‑139 (MQ=38) tgcttGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGTTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGgcg < 2:193566/143‑1 (MQ=255) tgGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGAGAAGGCGCtt > 1:312309/1‑143 (MQ=255) ggCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGTTCTGGCTCTTa > 1:212508/1‑143 (MQ=255) aGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGTCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgc < 1:98609/143‑1 (MQ=255) gTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCCCATGGATATGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTCGGCCGGATAGGGCACTCAcgccg > 2:119965/1‑143 (MQ=37) tCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgccgc > 1:84850/1‑143 (MQ=255) tCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgccgc > 1:319329/1‑143 (MQ=255) gtgagtaaTCCGATCCCACCCTCTGCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTCGTTGAATGTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCAt < 2:148276/140‑1 (MQ=37) gtaagtaaTCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgccgcct > 2:10660/1‑141 (MQ=255) taaTCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGT‑‑GGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCcgccgc > 2:82239/1‑143 (MQ=255) aatccaatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATGTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGgcg < 1:42447/143‑1 (MQ=255) tccaatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCt > 1:283919/1‑143 (MQ=255) tccaatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCt > 2:55608/1‑143 (MQ=255) tccaatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATATGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCt > 2:53554/1‑143 (MQ=255) aatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGATGAAATTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGcc > 1:468303/1‑143 (MQ=255) aatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGGTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTGTCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAAGCCGGATAAGGCGCCTACGCCACATCCGGCGGTGcc > 2:124463/1‑143 (MQ=37) cgcccACCCGCTCGCGATGGAGAGTGTGGGGTTAGTTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGccc < 1:250425/141‑1 (MQ=21) cccACCTTCTCCATGTGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCCTCCGGCGCTGCCCct > 2:192064/1‑143 (MQ=25) ccACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCACGCCTACAGGATGCATCACAGTTTGTTGAATTTGCACGCTCTTGTAAGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGcccccc > 2:208823/1‑141 (MQ=255) cACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTCACGCCGCATCCGGCGCTGCCCctct > 2:323301/1‑143 (MQ=25) | AACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCT > NC_000913/3774069‑3774345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |