Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,892,006 | A→C | intergenic (‑108/‑208) | cysJ ← / → queD | sulfite reductase, flavoprotein subunit/6‑carboxy‑5,6,7,8‑tetrahydropterin synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,892,006 | 0 | A | C | 100.0% | 118.3 / NA | 42 | intergenic (‑108/‑208) | cysJ/queD | sulfite reductase, flavoprotein subunit/6‑carboxy‑5,6,7,8‑tetrahydropterin synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (19/23); total (19/23) |
CAACGCGGAAGGTGGGACCTGTGTCGTCATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGATAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCGATTTTGCGCAACAAA > NC_000913/2891869‑2892141 | cAACGCGGAAGGTGGGACCTGTGTCGTCATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTACAGACGGGCTAACg > 1:359690/1‑143 (MQ=255) aaCGCGGAAGGTGGGACCTGTGTCGTCATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGCAGCGAAGGTAAGGATAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGa > 2:115322/1‑143 (MQ=255) gTGGGACTTGTGTCGTCATGCGTCGTTAGGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGTGTCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACtaataa < 1:780770/143‑1 (MQ=255) tGGCACCTGTGTCGTCATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCTATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAAc < 1:621954/143‑1 (MQ=255) ggACCTGTGTCGTCATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTACTAACCa > 2:643851/1‑143 (MQ=255) aCCTGTGTCGTCATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGACCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGTGCTAGCGATAACTAATAACCaaa > 1:743411/1‑143 (MQ=255) gtgtCGTCATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCTCTGTTAGTGCTCATAGAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGa < 1:460034/143‑1 (MQ=255) gtcATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAAc < 2:45343/143‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCCCTAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCATACGGTGTAGATTAAAGAAAGGCTAGCGATAACAAATAAACAAATCGACTAACCt > 1:274186/1‑143 (MQ=255) ttCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGAGCAAACAGTAAAAATAAAAAACAGGCAAGCAATAACTAATAACCAAATCAACTAACCTGTTTTAGCAATAGt > 1:624816/1‑143 (MQ=255) tCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGTCCATAAATCAGAAGAGAAGTTAAGGTTAACGGGGAAAAAGGTGTGGAGTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTc < 1:630042/143‑1 (MQ=255) taattaaaGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGGGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTaa < 2:786054/138‑1 (MQ=255) gCAGAGCTGTTGCTGCGCCCGGGCAGCGGCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGGTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTaacaa < 2:519557/143‑1 (MQ=255) tttCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTATTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGa > 1:750279/1‑143 (MQ=255) ttCTGTGTCCTGTCTTCGCCCATAATATAGAAGAGAAGGTAAGATAAACGGGGGAAACGGTGGGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGAt < 1:333181/143‑1 (MQ=255) ttCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGAt > 1:461202/1‑143 (MQ=255) gcgcACTATCAGCGCGCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGGTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTaac < 2:118493/143‑1 (MQ=255) ctcTGCCAGCGTCCATAAAGCAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTCAATTAGAGAGGTGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATTGTCTTTAATAACAAAATAGATTaaccaa < 2:276991/141‑1 (MQ=255) tttggtcccATAAAACAGAAGGGAAGGTAAGTTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTaa < 2:267342/137‑1 (MQ=255) gcacATCAAACACAAGAGAAGGAAAGGTTTACGGGGCAAACGGTGTGGATTTAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGaaa < 2:760205/140‑1 (MQ=255) ccATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTTACGGGGCAAACGGTGTTGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTCGCAATCGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGaaaaa < 1:607234/143‑1 (MQ=255) aTAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTCACCTGTTTTAACAATAGTATATAACAAAAAAATAGATAAACAAACCTAATGAAAAACa > 1:70875/1‑143 (MQ=255) aTAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACa > 2:452738/1‑143 (MQ=255) aaaCAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCGAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAAACTGATTTAGCAATAGTCTTTGACAACCAAATAACTAAACCAACCTAACGAAAAACaaaa > 2:432695/1‑142 (MQ=255) aaaCAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACAGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTATAGAAAACGACTGAAACAACAAAATAGAGTAACCACACTACGGAAAAGCaaaa > 2:434079/1‑142 (MQ=255) agagaagGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTa < 1:764152/143‑1 (MQ=255) 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gtTAACGGTGCAAACGGTGTGGATTAAAGACTGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTaa < 1:373560/143‑1 (MQ=255) tAACGGGGCTAACCGTGTGGATTAAAGGCGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGa < 2:675781/143‑1 (MQ=255) ggCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAACGAATTGAGCAAATCATAAAGATcaaag > 2:749106/1‑141 (MQ=255) gCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCTATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCa < 1:810027/143‑1 (MQ=255) caaCGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATTACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGc < 1:548387/142‑1 (MQ=255) aaCGGTGTGGATTAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCGTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCg > 2:386619/1‑143 (MQ=255) tgtgGATTAAAGACGTGCTAGCGATAACTAATAATCAAATCTACTATCCTGTTTTAGTAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCGAtttt < 1:245871/143‑1 (MQ=255) gATTAAAGACGGGCTAGCGATGACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTTACTTCCTCATCGCCCAACCAAATTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCGATTTTgcgc > 1:410751/1‑143 (MQ=255) ttAAAGACGGGCTAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATAAACCAACCTAATGAAAAACGAAAGAATTTAGCCAATCATGAAGATCAAGCAGCGATTGTGCGcag > 2:278355/1‑142 (MQ=255) aGACGAGCTAGTGATAACTAATAACTTAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTAGAACAACAAAAAAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCGATTTTGCGCAACaaa < 1:650211/143‑1 (MQ=255) | CAACGCGGAAGGTGGGACCTGTGTCGTCATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCCCATAAAACAGAAGAGAAGGTAAGGTTAACGGGGCAAACGGTGTGGATTAAAGACGGGATAGCGATAACTAATAACCAAATCGACTAACCTGTTTTAGCAATAGTCTTTAACAACAAAATAGATTAACCAACCTAATGAAAAACAAATGAATTTAGCCAATCATTAAGATAAATCAGCGATTTTGCGCAACAAA > NC_000913/2891869‑2892141 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |