| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,184,543 | C→A | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB → | RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,184,543 | 0 | C | A | 94.9% | 208.7 / NA | 83 | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB | RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base A (35/40); total (38/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCA > NC_000913/4184403‑4184681 | tcgggCGGGTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGc < 1:400913/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGCTCGAAGATACGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCt > 1:559302/1‑143 (MQ=255) tGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTAGGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTg > 2:773753/1‑143 (MQ=255) tGGCGGTTAAACGCCGAATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTg < 1:502615/143‑1 (MQ=255) ggCGGTTAAACGCCGTATCCAACCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGACTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTgg > 2:730576/1‑143 (MQ=255) cgcgagcaaaCGGCGTATCCAGCCCGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCCAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGATAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTgg < 2:159331/136‑1 (MQ=255) gCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTCTTTTTGGGCAACAACCCGATCGTAGCGGTTGCTTTCGAGGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTggg < 1:830711/143‑1 (MQ=255) gCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATCGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTggg < 2:785176/143‑1 (MQ=255) gCGGTTAAACGACGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAAATCAACCCGATCGAAGATATGCATTACGATGAAAACGGTACGCAGGTAGATATCGTACTGAACCAGCTtgg > 2:659355/1‑143 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGAGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTAGGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCg > 2:1529/1‑143 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGAGAAAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGCAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTgggac > 2:415986/1‑141 (MQ=255) tAAACGCCGTATCTAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTAGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTGATAAGAGCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAc < 1:692677/143‑1 (MQ=255) tAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAATATGGGTGTAATTTCTAAGAGCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAc < 1:620317/143‑1 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGTTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCGTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGt < 1:620576/143‑1 (MQ=255) ccGTATCCAGCCTTGTGACAAGATTGCATGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTATAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTCCCGCTGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGtctc < 1:813848/143‑1 (MQ=255) ccGTATCCAGCCTGGTGACGAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGtctc < 2:563310/143‑1 (MQ=255) aTCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGTTCGTCACGGTAACAAGTGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTAt < 2:222532/143‑1 (MQ=255) gccAGCCTGTTGACAAGTTGGCATGTCGGCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATg < 2:255492/142‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATACCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACGATCTCGTATGAAc > 2:594221/1‑143 (MQ=255) aGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATAGGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGATGGGCGAACCGGCACGTATGAAc > 2:436160/1‑143 (MQ=255) aGCCTGGTGACAAGAAGGCAGGTGGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGAACAACACGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAAAGGTAAGCCGGTAGACATCGAACTGAACCAGATGGGCGTAGCGTCACGTATGaca > 2:283780/1‑141 (MQ=255) ccTTGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTATGATTATTTCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACAt < 1:538103/143‑1 (MQ=255) ccTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATTTCTTACGTTGTTTTTTTTTCTCCGGTAGACATCGTACTGAACTAGCGGGGCGTACCGTCTCGTATGAACAt > 2:316229/1‑143 (MQ=255) tGGTGACAAGATGGTAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAATCCGATTGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCg < 1:392528/143‑1 (MQ=255) tGGTAACAAGATGGCAGGTCCTGACAGGAACAAGTGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCGTACGATGAAAACGGTACCCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGTGTACCGTCTCGTATGAACATCg < 2:799525/143‑1 (MQ=255) tGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGCTATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTATCGTATGAACATCGGTc > 1:485743/1‑143 (MQ=255) accaGATGCCAGGTCGTGATGGTAACCAGGGTGTGATTTCTAAGATCAAGCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAGCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCTTCTCGTATGAACATCGGTCAg < 2:653865/140‑1 (MQ=255) cAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGa > 2:816806/1‑143 (MQ=255) cAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCGCGTATGAACATCGGTCAGa > 2:691716/1‑143 (MQ=255) aTGGCAGGTCGTCACGTTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCTTTCGAAGTTATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGGAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCt < 1:231355/143‑1 (MQ=255) tggagggTCGTTCCGGGAACTAGTGTGTAATTTGTACGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGAGCAAAACGCTACGCCGCTAGACATCGTACTGAACCAGCTGTGCGTTTCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTc < 2:515505/138‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTACGCGTAATCCGATCTAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGCACTGAACCAGCTAGGCGAACCGTCCCGTATGAACATCGGCCAGATCCTc > 2:813689/1‑143 (MQ=255) tGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGCCATCGCACTGACCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGAACAGatcatc > 1:326017/1‑143 (MQ=255) aGGTCTTCACTGTAACAATGTTTTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:261674/143‑1 (MQ=255) aGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCATTCTGCTCTATAGTAATCCTTATGGTGAGGTCCGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:557506/143‑1 (MQ=255) gcgtcGCGGTGACAGGGGTTTAATTTCTCAGTTCAACCCGATCGAAGAGGTGCCGTAGGATGGAAGCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAGCCAGGTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGGTCCTCGAAAccc < 2:345310/142‑1 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAAGCCGGTCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTGCGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGAGCGTGCCGTCTCGTCTGAACCTCGGTCACACCCTCAGAAcctccc > 1:277408/1‑139 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGCAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCAAGTAAAAAAAACAGACAGAACCACGAAACCCAcc > 1:494613/1‑143 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAcc > 1:551839/1‑143 (MQ=255) cACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCt < 1:123064/143‑1 (MQ=255) aCGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCCCGTATGAACATCGGTCAGAGCCTCGAAACCCACCTg > 2:46992/1‑143 (MQ=255) ggTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCATCCCGATCGAAGATATGCTTTATGATGAATTCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTggg < 1:20093/143‑1 (MQ=255) gTAACAAGGGTGTAATTTCTAGGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTAGGCCGGTAGACATCGTACGGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGt < 1:771641/143‑1 (MQ=255) cAAGGGTGTAAGTACTAAGATCGACCCGAGCGAAGATATGCCTGACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATgg < 1:706066/143‑1 (MQ=255) gggTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTGTGGCTg > 1:58192/1‑143 (MQ=255) tttCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGCACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGt > 1:795811/1‑143 (MQ=255) ttCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGAGGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGACCCGGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGCACGTCGGTCACATCCTCGACACCCACATGGTAATGGATCCGAAAGATa > 1:306391/1‑143 (MQ=255) ctgaGATCTACCCGATCCCTGATATGCCTTACGATGCAACCGCTACGCCGGTCGTCATCTTACTGAACCAGCTGTGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATc < 2:609938/140‑1 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACGAGCTGGGCGTAACGTCTCGTATGAACACCGGTCAGATCCTCGAAACGCACGTGGGTATGCCTGCGAAAGGTATCg > 2:834091/1‑143 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGACTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTCTGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGAAATGGCTGCGAAAAGTATCg > 1:726162/1‑143 (MQ=255) aTCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACATCGGTATGGCTACGAAAGCTAGCGGCGa > 2:328645/1‑143 (MQ=255) aaCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACTCCGGTAGTCATCGTACTGATCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACaa < 1:617296/143‑1 (MQ=255) aaCCCCATCGAAGGTATGCCCGACGATCAAAACGGCACGCCGGTAGACATCGTACTTAACCAGCTGCGCGTACCGTCGCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACaa < 1:264065/143‑1 (MQ=255) actcGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCTGTAAACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAGCGATAGGTACGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAg < 1:109718/140‑1 (MQ=255) cccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCCGATCCTCGACACCCACCTGGGTATAGCTGCAAAAAGAAACGGCGACAAGa > 1:468064/1‑143 (MQ=255) cccGAGCGAAGATATGCTTTACGATGACAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGa < 2:522669/143‑1 (MQ=255) cggttCGAAGATATGCGTTGCGACGAGAACGGTACGCGGGTAGAGATCGTACTGAACCAGGTGGGCGAACCGTGTCGTATGAACATCGGTCAGAACCTCAAATACTGCATTGGTTTGGTTGGGAAAGGTATCGGCGACAAGAt < 2:358638/139‑1 (MQ=255) ccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAt < 1:727268/143‑1 (MQ=255) acGATCGAGGATATGCCGTACGATGAAGACGGTACGCTGGTAGAGATCGTACTGAACGAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAGCGTCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAt < 2:500334/142‑1 (MQ=255) cGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGTTGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATc < 1:235083/143‑1 (MQ=255) tCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCTGTAGACATCGTACTTAACCTGTTGGGCGTACCGTCTCATAGGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAAc < 1:479363/143‑1 (MQ=255) gAAGATATGCCTTACGAGGAAAACGGTACGACGGTAGACATCGTACTCGACCAGTTGGCCGTACCGTCTCGTATCAAGATCGGTCAGATCCTCTCAACCCACCTGGGTATGGCTGCTAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGc < 2:65264/143‑1 (MQ=255) gAAGATATCCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGCCAGATCCTCGACACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTCACGGCGACAAGATCACCGc > 2:285641/1‑143 (MQ=255) atatGCGTTCGGATGCAGACGGGGCGCCTGTAGACATCGTAGTGAGCACGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGTGTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATg < 2:452968/143‑1 (MQ=255) tatGCCTTACTATGATATCGGTACTCTTTTTTACATCGTATTTAACCTTCTGTGCGTACCGTCACGTATGAACAACGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGc < 1:649183/143‑1 (MQ=255) aTGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagcag < 1:670275/143‑1 (MQ=255) tgcaaaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACagcagc < 2:559302/140‑1 (MQ=255) aaaaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCCTGCCGCAACcgcagcca > 2:435000/1‑141 (MQ=255) aaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGCTCCACGCCCTGCTGAAAcagcagacaga > 1:513031/1‑138 (MQ=255) cgtccGCCCGTAGACTTCCCACTGGAGCGGGTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGt < 2:546222/139‑1 (MQ=255) gTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACGGCAGCaagcagcc > 2:401159/1‑141 (MQ=255) caCGCCTGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCGGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcg < 1:273667/142‑1 (MQ=255) aCGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcgc < 2:551839/143‑1 (MQ=255) gCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATACTCGACACCCACCAGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAGCAACGCCATGCTGAAACAGCGGAAAGAAGACACGa > 1:220802/1‑143 (MQ=255) cGGTAGACCTCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAATCCCTCCTGGGTTTGGCTGTGATAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGaaa < 1:1529/143‑1 (MQ=255) aGACTTCGGTCTGAACCCGCTGGGCGGACCGTCTCGTAGGAACGTCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCCGAGAAATGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTgc < 2:488913/143‑1 (MQ=255) aTCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGa > 2:664575/1‑143 (MQ=255) aTCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCCGGGTCTGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACACAATGCAGAAACAGCAGCAAAAAGTCGCGAAACTGCGCGa > 1:684146/1‑143 (MQ=255) tCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGGCGCGAAACGGCGCGac > 2:373294/1‑142 (MQ=255) cTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGAGACAAGATCAAAGCCATGCTGAAACAGAAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCAt > 1:62389/1‑143 (MQ=255) tGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTACGCGAATTCAta > 1:765067/1‑142 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCa > 1:596131/1‑143 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGCGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACCGCAGCAAGAAGTCGCAAAACTGCGCCAAACCATCCa > 2:343923/1‑143 (MQ=255) | TCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCA > NC_000913/4184403‑4184681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |