| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3416618 = | 102 (0.740) | 43 (0.350) +GAATTAATTCC |
25/178 | 9.7 | 28.1% | intergenic (+65/+164) | yhdZ/rrfF | putative amino‑acid transporter subunit/5S ribosomal RNA of rrnD operon |
| ? | CP009273 | 4033989 = | 145 (1.060) | noncoding (113/120 nt) | rrfA | 5S ribosomal RNA of rrnA operon | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTG > CP009273/3416518‑3416716 | cGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTc > 1:2713204/1‑101 (MQ=255) tACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTg > 1:2866240/1‑101 (MQ=255) tACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTg > 1:2110339/1‑101 (MQ=255) tACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTg < 2:2711631/101‑1 (MQ=255) cGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGc > 2:3258371/1‑101 (MQ=255) gAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCa < 2:1504406/101‑1 (MQ=255) aGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGGCTTTCTCTTGGTTTTATGTCTGGCAg > 2:72355/1‑101 (MQ=255) aGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAg < 1:1377774/101‑1 (MQ=255) aGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAg < 1:2301403/101‑1 (MQ=255) gggCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGt > 1:2629445/1‑101 (MQ=255) gCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGttt > 2:1710657/1‑101 (MQ=255) aTTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTAt > 1:1893324/1‑101 (MQ=255) tttttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATg > 2:3114819/1‑101 (MQ=255) tttttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATg < 2:1073006/101‑1 (MQ=255) tttttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATg > 2:1681650/1‑101 (MQ=255) ttttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATgg < 2:397046/101‑1 (MQ=255) tttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCAACCTTTCGGATTGCCCTTCGCTTTTTTTTTTTTCTTGCTGTTTAttgg > 2:2306788/1‑98 (MQ=255) ttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcg < 2:2702508/101‑1 (MQ=255) ttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcg < 2:3266579/101‑1 (MQ=255) tATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgg < 2:3197324/101‑1 (MQ=255) cGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgggcg > 2:3139012/1‑101 (MQ=255) cGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgggcg < 2:2209802/101‑1 (MQ=255) gCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTTATGTCTGGCAGTTTATggcgggggg > 2:2275423/1‑98 (MQ=255) gCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgggggg > 1:2977296/1‑98 (MQ=255) cAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcggggggg > 2:692126/1‑97 (MQ=255) aGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTcc < 2:1686251/101‑1 (MQ=255) aGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGcc > 1:320723/1‑101 (MQ=255) ggTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCt < 1:2103954/101‑1 (MQ=255) tAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTTCttc > 1:1478591/1‑99 (MQ=255) tAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTG‑c > 1:821611/1‑101 (MQ=255) aTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑ccc < 2:2285610/101‑1 (MQ=255) aTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑ccc < 1:1353622/101‑1 (MQ=255) ccATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGgcccg‑ccccc > 1:1823073/1‑99 (MQ=37) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑cccccc > 2:263068/1‑101 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑cccccc > 2:1744381/1‑101 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑cccccc > 1:1903207/1‑101 (MQ=255) aTTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTC‑ccccccc > 1:71065/1‑100 (MQ=25) ttAATTGAATGTTAGTTAGAAAAACAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCGGGCAGTTTATGGCGGGCTTCCTG‑CCCGCCAc < 2:304880/101‑1 (MQ=21) tAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCAcc < 1:706226/101‑1 (MQ=255) aTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCCG‑ccccccccccc > 1:2543118/1‑100 (MQ=25) ttGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑cccccccccccc > 2:2754500/1‑99 (MQ=25) tGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTcc < 2:1386544/101‑1 (MQ=255) tGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTcc < 2:2829082/101‑1 (MQ=255) gAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCg < 1:2664318/101‑1 (MQ=255) aaTGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGTCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGACAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCgg < 1:537948/101‑1 (MQ=255) aTGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCCCCACCCTCCcgg > 1:2712024/1‑101 (MQ=255) tGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTTCTc‑ccccccccccccccgcc > 2:2034730/1‑97 (MQ=21) tGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGGCTG‑CCCCCCCCCCCCCCGGc > 2:1995512/1‑101 (MQ=25) gTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGcc < 1:2517848/101‑1 (MQ=255) ttAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑CCCCCCCCCCCCCCGGccc > 1:2864289/1‑100 (MQ=21) ttAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCCCCACCCCCCCGGCCg > 1:525906/1‑101 (MQ=255) ttAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCG‑CCCGCCACCCCCCCGGCCg > 1:385038/1‑101 (MQ=255) tAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGt < 1:2092468/101‑1 (MQ=255) aGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTT‑CCCCCCCCCCCCCCGGGCggt > 1:3190121/1‑99 (MQ=21) aGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGtt < 2:3005121/101‑1 (MQ=255) aGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCCGGCCGtt > 1:541353/1‑101 (MQ=255) aGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGGcctc > 1:826469/1‑99 (MQ=18) cGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑CCCCCCCCCCCCCCGGGCGTTGCtt > 1:2606634/1‑101 (MQ=18) cGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTTCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCtt < 1:246247/101‑1 (MQ=255) gAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTc < 2:2182401/101‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCg < 2:1608596/101‑1 (MQ=255) aaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCa < 2:1801804/101‑1 (MQ=255) gCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑CCCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGGCTCGCCAc > 2:1353134/1‑101 (MQ=18) gCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAAc < 2:1407050/101‑1 (MQ=255) aaaaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTT‑CCCCCCCCCCCCCCGGCCGGCGGTTCGCAAccg > 2:3155451/1‑99 (MQ=18) aaaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCCG‑CCCGCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCGCAACgct > 1:172164/1‑99 (MQ=18) aaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCCG‑CCCCCCCCCCCCCCCGCCGTTGCTTTGCAAcaatc > 2:1618823/1‑97 (MQ=18) aaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑CCCCCCCCCCCCCCGGGCGGTGCCTCGCAACgctta > 2:2883135/1‑97 (MQ=18) ggCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaaa < 1:1664390/101‑1 (MQ=255) ccATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGTGGCCTG‑CCCGCCCCCCCCCCGGGCGTTGCCTCCCCACCTTTAAATc > 2:1023483/1‑101 (MQ=17) cATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATcc < 1:2396222/101‑1 (MQ=255) cATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGCTTCCCAACGTTTAAATcc > 1:1784459/1‑101 (MQ=18) aTCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTG‑ACCCCCCCCCTCCCGGCCTCTGCCTCCCAACGCTCCAATccc > 1:377721/1‑100 (MQ=17) aTCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑CCCCCCCCCCCCCCGGCCGGTTGTTCGCCAAGTTTAAAtacc > 2:1092886/1‑98 (MQ=12) aTCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCg < 2:2660508/101‑1 (MQ=255) tCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGc < 1:2127003/101‑1 (MQ=255) tttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTG‑CCCCCCACCCCCCCGGCCGGTGCTTCGCAACGTTCAAAACCCCTcc > 1:1403567/1‑101 (MQ=17) tttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCCCCCCCCCCCGGGGCGGTTCTTTCCAACGTTTAAAAccccccc > 1:136084/1‑96 (MQ=17) ttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTG‑CCCGCCCCCCTCCCGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCCAATCCGCTccc > 1:789824/1‑101 (MQ=17) tCGGATGGCTTTTCGCTTGTTTTGATGCCTGGCAGTTTTTGGCCGGCTTCCGG‑CCCGCCCCCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcg < 2:1723809/101‑1 (MQ=14) cGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcgg < 1:2409885/101‑1 (MQ=255) cGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcgg < 1:1881429/101‑1 (MQ=255) ggATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTG‑CCCCCCCCCCCCCGGGCCGGTGCTTTCCAAAGGTCAAAAACCCTCCccgc > 1:1695298/1‑101 (MQ=9) gATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCCG‑CCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCGCCACGTTCAAATCCACTCCccgcg > 1:1767670/1‑101 (MQ=14) aTGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTT‑CCCCCCACCCCCCCGGGCGGTGCTTTCCAAAAGTCCAATCCCCCCCccgcgg > 1:2341370/1‑101 (MQ=9) aTGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcggcgg < 1:582265/101‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcggcgg < 1:2550609/101‑1 (MQ=255) gCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCCCCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGAtt < 2:1254751/101‑1 (MQ=255) ccTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGCCGTCCTC‑CCCCCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGAttt < 1:1648865/101‑1 (MQ=255) tttCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCGCCCTCTGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGt < 1:2856168/101‑1 (MQ=255) ttCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCCCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTc > 1:743303/1‑101 (MQ=255) tCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTcc < 1:2003101/101‑1 (MQ=38) cGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCt < 1:1633808/101‑1 (MQ=38) gCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTa < 2:1458657/101‑1 (MQ=35) ttgatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCCCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGGTTTGTCCTACt > 1:2000861/1‑101 (MQ=255) tgatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTc < 1:2281421/101‑1 (MQ=35) tgatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTG‑CCCCCCCCCCCCCCGGCCGCTGGTTTTCACCCTTTAAATCCCCCCCCCGCGGGGTTTTCCttccc > 2:1522155/1‑97 (MQ=2) atttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCgg < 1:1298987/101‑1 (MQ=35) gTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAgtg < 1:755691/101‑1 (MQ=38) gTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAgtg < 1:3148324/101‑1 (MQ=38) | CGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTG > CP009273/3416518‑3416716 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |