New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2282398 = | NA (NA) | 253 (1.850) | 33/200 | 8.7 | 64.4% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | CP009273 | = 3724821 | 140 (1.020) | coding (331/993 nt) | xylF | D‑xylose transporter subunit | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
ATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGT > CP009273/3724722‑3724921 | aTAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGc < 1:2879322/101‑1 (MQ=255) tAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCt > 1:399287/1‑101 (MQ=255) aaaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAggga > 2:2710083/1‑98 (MQ=255) aaaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCtt > 1:1179077/1‑101 (MQ=255) aaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTa < 1:3076135/101‑1 (MQ=255) aaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTa > 1:684865/1‑101 (MQ=255) aCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAgggaag < 1:2588212/101‑6 (MQ=255) aCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTAc < 1:2441049/101‑1 (MQ=255) ccGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACg < 2:1578692/101‑1 (MQ=255) ggggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGAc < 1:327484/101‑1 (MQ=255) gggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGAcc < 2:536916/101‑1 (MQ=255) gggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGAcc > 1:1833846/1‑101 (MQ=255) gggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGAcc < 2:2173143/101‑1 (MQ=255) ggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCg > 2:1048827/1‑101 (MQ=255) tCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATg > 2:3262427/1‑101 (MQ=255) cGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGa < 1:122936/101‑1 (MQ=255) gATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGAt < 2:1350948/101‑1 (MQ=255) tGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTa > 1:2951827/1‑101 (MQ=255) gTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTaa > 1:1017498/1‑101 (MQ=255) gTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTaa > 1:1421916/1‑101 (MQ=255) ttCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAAc > 2:715157/1‑101 (MQ=255) ttGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGAt < 2:2013962/101‑1 (MQ=255) ttGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGAt < 1:336155/101‑1 (MQ=255) gTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGc < 2:2981242/101‑1 (MQ=255) tCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCg < 1:1411295/101‑1 (MQ=255) cATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCgg > 1:2762677/1‑101 (MQ=255) ttattCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGat < 2:2761537/101‑1 (MQ=255) tattCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGata < 1:2085337/101‑1 (MQ=255) tattCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGata < 2:1428322/101‑1 (MQ=255) attCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGatat < 1:990508/101‑1 (MQ=255) attCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGatat < 1:527228/101‑1 (MQ=255) ttCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATc < 1:2454349/101‑1 (MQ=255) ttCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATc < 2:1637765/101‑1 (MQ=255) ttCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATc < 1:3315802/101‑1 (MQ=255) tCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCg < 1:1695005/101‑1 (MQ=255) ataACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGAtttt > 2:2183169/1‑101 (MQ=255) cGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTtata < 1:2620268/101‑1 (MQ=255) cGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTtata < 2:2646931/101‑1 (MQ=255) ggTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTatat > 1:2226631/1‑101 (MQ=255) ggTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTatat > 2:1316576/1‑101 (MQ=255) ggTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTatat > 1:2484461/1‑101 (MQ=255) gTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAtt > 1:2518630/1‑101 (MQ=255) aGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAtttct > 2:2333225/1‑101 (MQ=255) gTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAtttcttt > 2:2420764/1‑101 (MQ=255) tATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAtttctttc > 1:432768/1‑101 (MQ=255) gTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAAc < 1:3235050/101‑1 (MQ=255) tAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAAcn > 2:1251145/1‑100 (MQ=255) tAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACg < 1:3123534/101‑1 (MQ=255) tAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACg < 1:1938239/101‑1 (MQ=255) tAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACg < 2:1194669/101‑1 (MQ=255) aCGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaa < 2:491314/101‑1 (MQ=255) cGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaaa < 1:313184/101‑1 (MQ=255) gTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaaaa < 1:1355036/101‑1 (MQ=255) gTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaaaa > 1:2300561/1‑101 (MQ=255) ttGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaaaaa > 2:2485228/1‑101 (MQ=255) ttGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaaaaa < 2:2069164/101‑1 (MQ=255) tGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAg < 2:309380/101‑1 (MQ=255) tGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAg < 2:2288521/101‑1 (MQ=255) tGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATCATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATACCGAAAAAg < 2:1112365/101‑1 (MQ=255) tAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTc < 2:3155323/101‑1 (MQ=255) tAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTc < 1:219134/101‑1 (MQ=255) tAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTc < 2:3048395/101‑1 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg > 2:325895/1‑101 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg < 1:233258/101‑1 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg > 2:1593195/1‑101 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg < 1:1802786/101‑1 (MQ=255) agaagCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTg > 1:1951386/1‑101 (MQ=255) agaagCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTg > 1:2903750/1‑101 (MQ=255) gaagCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGa < 2:3318955/101‑1 (MQ=255) gCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACt < 2:986415/101‑1 (MQ=255) gCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACt < 1:57351/101‑1 (MQ=255) cAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGc > 2:2086851/1‑101 (MQ=255) cAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGc > 1:2264265/1‑101 (MQ=255) cAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGc > 1:1640549/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa > 1:433388/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa > 2:2899083/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa > 2:871026/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa < 2:2887320/101‑1 (MQ=255) aaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAg < 2:3124855/101‑1 (MQ=255) aaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAg < 2:1856408/101‑1 (MQ=255) aCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAgg < 1:2065693/101‑1 (MQ=255) aagaagGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCa > 1:473568/1‑101 (MQ=255) aagGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCaaaa < 1:1826579/101‑1 (MQ=255) aagGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCaaaa < 1:1131531/101‑1 (MQ=255) aagGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCaaaa > 2:1812442/1‑101 (MQ=255) gCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGcc < 2:1942644/101‑1 (MQ=255) aTTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCt < 1:3183038/101‑1 (MQ=255) aTTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCt < 1:764671/101‑1 (MQ=255) ttAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTACCGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTg < 2:1180825/101‑1 (MQ=255) ttAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTg > 2:2990701/1‑101 (MQ=255) tAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTgg > 2:2010953/1‑101 (MQ=255) tAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTgg < 1:1683449/101‑1 (MQ=255) aaaGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGCCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGt > 2:356656/1‑101 (MQ=255) cttccttAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTc < 1:60177/96‑1 (MQ=255) aaGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTc < 2:962493/101‑1 (MQ=255) tccttAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGa > 2:466735/4‑101 (MQ=255) tATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGCTATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGat > 1:1630564/1‑101 (MQ=255) tAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATAtt > 1:729446/1‑101 (MQ=255) aGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTg > 1:2561223/1‑101 (MQ=255) gCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGt < 1:1048827/101‑1 (MQ=255) | ATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGT > CP009273/3724722‑3724921 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |