New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2283592 | NA (NA) | 71 (0.520) | 21/200 | 12.8 | 32.6% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | CP009273 | 3724818 = | 147 (1.070) | coding (328/993 nt) | xylF | D‑xylose transporter subunit | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CATGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGAT > CP009273/3724718‑3724916 | cATGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTAt < 1:110008/101‑1 (MQ=255) cATGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTAt < 1:268041/101‑1 (MQ=255) cATGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTAt < 1:162420/101‑1 (MQ=255) aTGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTAtt < 2:1976606/101‑1 (MQ=255) tGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTa > 2:1107994/1‑101 (MQ=255) tGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTa < 1:802537/101‑1 (MQ=255) tGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTa < 2:806586/101‑1 (MQ=255) aTAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGc < 1:2879322/101‑1 (MQ=255) tAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCt > 1:399287/1‑101 (MQ=255) aaaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAggga > 2:2710083/1‑98 (MQ=255) aaaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCtt > 1:1179077/1‑101 (MQ=255) aaaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCtt > 1:562335/1‑101 (MQ=255) aaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTa < 1:1733129/101‑1 (MQ=255) aaCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTa < 1:3076135/101‑1 (MQ=255) aCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAgggaag < 1:2588212/101‑6 (MQ=255) aCCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTAc < 1:2441049/101‑1 (MQ=255) ccGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACg < 2:204319/101‑1 (MQ=255) gggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGAcc > 1:1833846/1‑101 (MQ=255) gggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGAcc < 2:536916/101‑1 (MQ=255) ggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCg > 2:1048827/1‑101 (MQ=255) ggTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCg < 2:1467870/101‑1 (MQ=255) gtgtCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCCGGTATTAAGTAACGATGTAAAAGAAGCCAAAAAAAAAAGCATTAAACTATTTTTTTACGACCGt > 2:3281336/1‑101 (MQ=255) cGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGa < 1:122936/101‑1 (MQ=255) tGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTa > 1:2951827/1‑101 (MQ=255) gTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTaa > 1:1421916/1‑101 (MQ=255) gTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTaa > 1:1017498/1‑101 (MQ=255) ttCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAAc < 2:1328898/101‑1 (MQ=255) cTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGa > 2:2841516/1‑101 (MQ=255) cTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGa > 2:37040/1‑101 (MQ=255) ttGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGAt < 2:2013962/101‑1 (MQ=255) tCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCg < 1:1411295/101‑1 (MQ=255) attattCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGa > 1:1137398/1‑101 (MQ=255) tattCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGata < 1:2085337/101‑1 (MQ=255) tattCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGata < 2:1428322/101‑1 (MQ=255) attCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGatat < 2:3070011/101‑1 (MQ=255) attCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGatat < 1:990508/101‑1 (MQ=255) attCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGatat < 1:527228/101‑1 (MQ=255) ttCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATc < 2:1637765/101‑1 (MQ=255) ttCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATc < 1:3315802/101‑1 (MQ=255) ccGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGa > 1:3286594/1‑101 (MQ=255) ataACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGAtttt > 2:2183169/1‑101 (MQ=255) aaCGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTta < 1:1675404/101‑1 (MQ=255) aCGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTtat > 1:38121/1‑101 (MQ=255) aCGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTtat < 1:2579462/101‑1 (MQ=255) ggTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTatat > 2:1316576/1‑101 (MQ=255) ggTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTatat > 1:2484461/1‑101 (MQ=255) ggTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTatat > 1:2226631/1‑101 (MQ=255) tCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAttt < 1:1864017/101‑1 (MQ=255) cAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAtttc < 1:2701658/101‑1 (MQ=255) aGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAtttct > 2:2333225/1‑101 (MQ=255) gTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAtttcttt < 1:1959875/101‑1 (MQ=255) tATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATAtttctttc < 1:2383237/101‑1 (MQ=255) aTTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCg > 2:2981424/1‑101 (MQ=255) ttAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGa > 1:46685/1‑101 (MQ=255) ttAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAAGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGa < 1:1341546/101‑1 (MQ=255) gTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAAc < 1:3235050/101‑1 (MQ=255) tAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACg < 1:3123534/101‑1 (MQ=255) tAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACg < 2:1194669/101‑1 (MQ=255) cGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaaa < 1:313184/101‑1 (MQ=255) gTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaaaa > 1:2300561/1‑101 (MQ=255) ttGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGaaaaa > 2:2485228/1‑101 (MQ=255) tGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAg < 2:309380/101‑1 (MQ=255) tGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAg < 2:2288521/101‑1 (MQ=255) tGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATCATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATACCGAAAAAg < 2:1112365/101‑1 (MQ=255) tAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTc < 2:3048395/101‑1 (MQ=255) tAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTc < 2:2121261/101‑1 (MQ=255) tAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTc < 1:219134/101‑1 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg > 2:1593195/1‑101 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg < 2:3238457/101‑1 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg > 2:325895/1‑101 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg < 1:233258/101‑1 (MQ=255) aaaaGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCg < 1:1802786/101‑1 (MQ=255) aagaagCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGt < 2:1219188/101‑1 (MQ=255) agaagCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTg > 1:2903750/1‑101 (MQ=255) agaagCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTg > 1:1951386/1‑101 (MQ=255) gaagCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGa < 2:3318955/101‑1 (MQ=255) gCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACt < 2:986415/101‑1 (MQ=255) gCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACt < 1:2512070/101‑1 (MQ=255) cAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGc > 1:2264265/1‑101 (MQ=255) cAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGc > 2:2086851/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa > 2:270140/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa > 1:433388/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa > 2:871026/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa > 2:2899083/1‑101 (MQ=255) aaaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCa < 2:2887320/101‑1 (MQ=255) aaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAg < 2:1856408/101‑1 (MQ=255) aaCAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAg < 2:3124855/101‑1 (MQ=255) cAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGc > 2:2436728/1‑101 (MQ=255) aagGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCaaaa > 2:1812442/1‑101 (MQ=255) aagGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCaaaa > 1:320740/1‑101 (MQ=255) gCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGcc < 2:1942644/101‑1 (MQ=255) aTTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCt < 1:764671/101‑1 (MQ=255) aTTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCt > 2:2195264/1‑101 (MQ=255) aTTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGACGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCt > 1:627904/1‑101 (MQ=255) tAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTgg < 1:1683449/101‑1 (MQ=255) cttccttAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTc > 2:609149/6‑101 (MQ=255) cttccttAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTc < 1:60177/96‑1 (MQ=255) aaGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTc < 2:962493/101‑1 (MQ=255) tccttAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGa > 2:466735/4‑101 (MQ=255) tATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGCTATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGat > 1:1630564/1‑101 (MQ=255) | CATGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGAT > CP009273/3724718‑3724916 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |