| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP009273 | 1,106,933 | Δ3,772 bp | [opgH]–[mdtG] | [opgH], yceK, msyB, [mdtG] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP009273 | 1106933 | 1110704 | 3772 | 150 [0] | [0] 151 | [opgH]–[mdtG] | [opgH],yceK,msyB,[mdtG] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1106932 | 0 (0.000) | 148 (0.900) | 99/198 | 0.6 | 100% | coding (614/2544 nt) | opgH | membrane glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| ? | CP009273 | 1110705 = | 0 (0.000) | coding (242/1227 nt) | mdtG | putative drug efflux system protein | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1106832‑1106932‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCACATATTCAGGGCGGAGTGAC > CP009273/1110705‑1110804 ATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTT > 1:3870755/1‑101 ATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTT > 1:1763357/1‑101 TATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTT < 2:2574352/101‑1 TATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTT < 2:1239807/101‑1 ATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTA < 2:3840421/101‑1 ATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTA > 2:3856466/1‑101 TGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTC > 1:1036332/1‑101 GGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCG < 1:2382042/101‑1 TCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGC > 2:62336/1‑101 AGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGA > 1:3545504/1‑101 ATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTC > 1:2236239/1‑101 GTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACC > 2:1986694/1‑101 TGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCC > 2:1467200/1‑101 GGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCA < 2:1658336/101‑1 GGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCA < 2:3683498/101‑1 TCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAAC > 2:174114/1‑101 TCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAAC < 1:2949075/101‑1 TCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAAC > 2:1570662/1‑101 TTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGT < 1:439732/101‑1 TATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGA < 1:3650650/101‑1 TATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGA < 1:2838457/101‑1 TATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGA < 1:2313972/101‑1 TATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGA < 1:2166515/101‑1 ATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAG > 2:3258335/1‑101 TGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGG > 2:3538470/1‑101 GCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGC < 2:1776663/101‑1 AGCTTCTGCCTTATATGCTGCAACCCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCCCCCCAAAACGGTGAGGCGA < 1:926908/101‑1 GCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGAT < 2:3681960/101‑1 TTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGG < 1:3116848/101‑1 TGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCG > 1:517920/1‑101 TGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCG > 1:3949754/1‑101 CCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAA > 1:3727749/1‑101 CCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAA < 1:1882338/101‑1 TTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAA < 2:2262629/101‑1 ATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATA < 2:67106/101‑1 ATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATA < 1:3884540/101‑1 TATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAA > 1:890718/1‑101 GCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACCGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAA < 1:2796225/101‑1 TGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATG > 1:1521066/1‑101 TGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATG < 2:3501114/101‑1 TGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATG > 2:2858961/1‑101 AAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAA > 1:914575/1‑101 AAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAA < 2:3333353/101‑1 ACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATG < 1:270245/101‑1 CCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGC < 1:3334999/101‑1 CGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCT < 1:1134286/101‑1 GGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTG > 2:2047857/1‑101 GTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGA > 2:2781993/1‑101 GTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGA < 1:2623541/101‑1 GTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGA < 1:3711087/101‑1 GTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGA < 1:1815301/101‑1 TATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAA > 1:2591794/1‑101 ATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAG > 1:2784450/1‑101 TCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGA > 1:1574732/1‑101 TCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGA > 1:1405728/1‑101 CCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGAC < 1:2448860/101‑1 CCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGAC < 1:693464/101‑1 CCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGAC < 2:3028958/101‑1 CCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGAC < 1:1567990/101‑1 CTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACA > 1:3409027/1‑101 TGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAA > 2:892681/1‑101 TGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAA > 1:2304960/1‑101 GATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTAGGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAAT < 1:1553891/101‑1 GATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAAT < 2:2582772/101‑1 ATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATA > 1:1963628/1‑101 ATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATA > 1:1323451/1‑101 TCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATAC > 1:2285007/1‑101 TCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATAC < 2:1348549/101‑1 TCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATAC > 2:2327546/1‑101 CTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCG < 2:3385710/101‑1 TCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGG > 2:772005/1‑101 TCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGG < 1:696665/101‑1 TTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGAC < 1:1192264/101‑1 TTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACC < 1:794277/101‑1 TTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACC < 2:3027531/101‑1 TTGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACC < 2:1202970/101‑1 TGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCA < 2:2495896/101‑1 TGCGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCA < 1:2197799/101‑1 CGGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCACA < 1:771418/101‑1 GGTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCACAT < 1:2645777/101‑1 GTACTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAAACAATACCGGACAACAat > 2:3868045/1‑99 CTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCACATATTC > 2:2260561/1‑101 CTGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCACATATTC < 1:3835847/101‑1 TGTTCTGTTGGGTTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCACATATTCA > 2:251220/1‑101 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GATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1106832‑1106932‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tTTACGGTCGGCGAGTCCACCCCAAAACGGTGAGGCGATGGCCGAAAATAAAAATGTAATGCTGAAGACAATACCGGACCACATATTCAGGGCGGAGTGAC > CP009273/1110705‑1110804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |