| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 4,236,389 | (CACCTA)1→2 | intergenic (‑42/‑323) | malE ← / → malK | maltose transporter subunit/fused maltose transport subunit, ATP‑binding component of ABC superfamily/regulatory protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4236382 | 0 (0.000) | 168 (1.080) +ACACCT |
112/174 | 0.0 | 100% | intergenic (‑35/‑330) | malE/malK | maltose transporter subunit/fused maltose transport subunit, ATP‑binding component of ABC superfamily/regulatory protein |
| ? | CP009273 | 4236383 = | 0 (0.000) | intergenic (‑36/‑329) | malE/malK | maltose transporter subunit/fused maltose transport subunit, ATP‑binding component of ABC superfamily/regulatory protein | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GGCGGAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAACACCTAAACGGACTCTAGTTTCTTTATACGGCAACCTCTTTCCATCCTCCTTGCCCCTACGCCCCACCGTCGCTTTGTGTGATCTCTGTTACAGAATTG > CP009273/4236282‑4236482 | ggCGGAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGaaa > 1:465327/1‑101 (MQ=255)ggCGGAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGaaa < 1:58371/101‑1 (MQ=255) gCGGAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAa > 1:109574‑M1/1‑100 (MQ=255) cGGAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAac > 1:388311‑M1/1‑99 (MQ=255) ggAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAaca < 2:11529‑M1/101‑4 (MQ=255) ggAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAaca < 2:54789‑M1/101‑4 (MQ=255) gAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacac > 1:1174148‑M1/1‑97 (MQ=255) aaaCATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacct < 1:1557647‑M1/101‑7 (MQ=255) aaCATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacaccta > 1:1360114‑M1/1‑94 (MQ=255) aaCATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacaccta > 2:372292‑M1/1‑94 (MQ=255) atcatcGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacac > 1:985998‑M1/1‑91 (MQ=255) tcatcGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacc > 1:2665898‑M1/1‑90 (MQ=255) catcGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacct < 2:3818535‑M1/101‑13 (MQ=255) catcGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacct > 2:189170‑M1/1‑89 (MQ=255) tcgtcgTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaa < 1:1725963‑M1/101‑15 (MQ=255) cgtcgtTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaa > 2:637654‑M1/1‑86 (MQ=255) gtcgtTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaac < 1:3415429‑M1/101‑17 (MQ=255) tcgtTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacg < 2:721439‑M1/101‑18 (MQ=255) ttAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGCCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggac > 1:3267702‑M1/1‑81 (MQ=255) tAATGCGGATAATGCGAGGATGCGGGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggact > 2:1378823‑M1/1‑80 (MQ=255) aaTGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactc > 2:1353669‑M1/1‑79 (MQ=255) tGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactcta < 2:1233180‑M1/101‑25 (MQ=255) tGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactcta < 1:478328‑M1/101‑25 (MQ=255) gCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctag < 1:3924428‑M1/101‑26 (MQ=255) cGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagt > 2:2342037‑M1/1‑75 (MQ=255) ggATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtt > 1:1443764‑M1/1‑74 (MQ=255) ggATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtt < 2:3374531‑M1/101‑28 (MQ=255) ggATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtt > 1:1654403‑M1/1‑74 (MQ=255) gATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagttt > 1:1317215‑M1/1‑73 (MQ=255) gATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagttt > 2:2081200‑M1/1‑73 (MQ=255) aaTGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctt > 2:3470591‑M1/1‑70 (MQ=255) aTGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttcttt < 1:3676955‑M1/101‑33 (MQ=255) tGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttcttta > 1:612858‑M1/1‑68 (MQ=255) cGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttata > 2:3231742‑M1/1‑66 (MQ=255) gAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatac > 1:1961399‑M1/1‑65 (MQ=255) aGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacg < 2:1317215‑M1/101‑38 (MQ=255) aGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacg < 1:1928451‑M1/101‑38 (MQ=255) gATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggc > 2:1548336‑M1/1‑62 (MQ=255) aTGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggca < 2:2332571‑M1/101‑41 (MQ=255) tGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaa > 2:1508978‑M1/1‑60 (MQ=255) cGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacgcctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacc < 2:2551634‑M1/101‑44 (MQ=255) cGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacc > 1:1052619‑M1/1‑58 (MQ=255) cGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacc < 1:378051‑M1/101‑44 (MQ=255) cGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacc > 2:3325579‑M1/1‑58 (MQ=255) gTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacct > 2:2723607‑M1/1‑57 (MQ=255) tGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctc > 2:364649‑M1/1‑56 (MQ=255) gCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctct > 1:1394338‑M1/1‑55 (MQ=255) gCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctct < 1:1087975‑M1/101‑47 (MQ=255) aCCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctcttt > 1:3398533‑M1/1‑53 (MQ=255) ccTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttc > 2:1028986‑M1/1‑52 (MQ=255) cTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttcc > 2:35838‑M1/1‑51 (MQ=255) cTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttcc > 2:792030‑M1/1‑51 (MQ=255) tGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttcca < 2:3437742‑M1/101‑52 (MQ=255) tGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttcca > 1:964533‑M1/1‑50 (MQ=255) gTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacccctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccat < 2:463176‑M1/101‑53 (MQ=255) gTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccat > 1:2144371‑M1/1‑49 (MQ=255) tttttATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatc > 1:782978‑M1/1‑48 (MQ=255) tttttATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatc > 2:2588042‑M1/1‑48 (MQ=255) tttttATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatc > 1:310337‑M1/1‑48 (MQ=255) tttATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatcct > 1:2022557‑M1/1‑46 (MQ=255) tttATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatcct > 2:759051‑M1/1‑46 (MQ=255) ttATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatcctc > 2:3856506‑M1/1‑45 (MQ=255) 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aaaacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatcctccttgcccctacgccccaccgtcgctttgtgtgatctctgtta < 1:2708823‑M1/101‑99 (MQ=255) aacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatcctccttgcccctacgccccaccgtcgctttgtgtgatctctgttaca < 2:3085108‑M1/101‑101 (MQ=255) aacacctacacctaaacggactctagtttctttatacggcaacctctttccatcctccttgcccctacgccccaccgtcgctttgtgtgatctctgttaca < 1:1027327‑M1/101‑101 (MQ=255) | GGCGGAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAACACCTAAACGGACTCTAGTTTCTTTATACGGCAACCTCTTTCCATCCTCCTTGCCCCTACGCCCCACCGTCGCTTTGTGTGATCTCTGTTACAGAATTG > CP009273/4236282‑4236482 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |