| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | CP009273 | 4,237,722 | (CCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTA)1→2 | coding (1011/1116 nt) | malK → | fused maltose transport subunit, ATP‑binding component of ABC superfamily/regulatory protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP009273 | = 4237719 | 34 (0.210) | coding (1008/1116 nt) | malK | fused maltose transport subunit, ATP‑binding component of ABC superfamily/regulatory protein | |||||
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
AAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGTCAAAACCTGGTGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTATCGGCCTGCCGCCAGAGCGTTGCCATCTGTTCCGTGAGGATGGCACTGCATGTCGTCGACTGCATAAGGAGCCGG > CP009273/4237619‑4237819 | ttCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGTCAAAACCTGGTGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGgta > 2:2053545‑M2/1‑98 (MQ=255) gaaactcaaatccatatccagatcccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTag > 1:3162887‑M1/73‑101 (MQ=255) gaaactcaaatccatatccagaacccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTTTTGCTag < 1:3335427‑M1/29‑1 (MQ=255) aaactcaaatccatatccagatcccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTaga < 2:2959730‑M1/30‑1 (MQ=255) aaactcaaatccatatccagatcccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTaga < 2:3897205‑M1/30‑1 (MQ=255) aactcaaatccatatccagatcccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGGGTTGGTagaa < 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tcccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTAt > 1:579120‑M1/51‑101 (MQ=255) tcccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTAt > 1:1517537‑M1/51‑101 (MQ=255) aaCGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGTCAAAACCTGGTGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGgtaccgccagaacgacgtggtgttgg < 2:1729071‑M2/101‑27 (MQ=255) ccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTATCg > 2:350294‑M1/49‑101 (MQ=255) ccttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTATCg < 2:82531‑M1/53‑1 (MQ=255) cttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTATCgg > 2:776174‑M1/48‑101 (MQ=255) cttccattcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTATCgg < 2:3221455‑M1/54‑1 (MQ=255) 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tCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGTCAAAACCTGGTGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGgtaccgccagaacgacgtggtgttggtagaagaa < 1:1077084‑M2/101‑35 (MQ=255) tCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGTCAAAACCTGGTGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGgtaccgccagaacgacgtggtgttggtagaagaa < 1:2326536‑M2/101‑35 (MQ=255) tCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGTCAAAACCTGGTGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGgtaccgccagaacgacgtggtgttggtagaagaa > 2:3295203‑M2/1‑67 (MQ=255) attcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGCAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTATCGGCCTgc < 2:3431473‑M1/59‑1 (MQ=255) ttcgtcaaaacctggtgtaccgccagaacgacgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTATCGGCCTgcc < 2:1762352‑M1/60‑1 (MQ=255) aaaTCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGTCAAAACCTGGTGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGgtaccgccagaacgacgtggtgttggtagaagaagg < 1:1320673‑M2/101‑37 (MQ=255) tcaaaacctggtgtaccgccagaacgccgtggtgttgGTACCGCCAGAACGACGTGGTGTTGGTAGAAGAAGGTGCCACATTCGCTATAGGCCTGCCGCCa > 2:2190072‑M1/38‑101 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |