| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,526,007 | 0 | T | G | 23.0% | 507.0 / 22.1 | 175 | intergenic (+159/+424) | yjhR/nanS | pseudogene, helicase family; putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/107); new base G (40/0); total (67/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.04e-21 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCG > CP009273/4525907‑4526107 | cGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTg > 1:2889354/1‑101 (MQ=255) aCTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCt > 1:1505342/1‑101 (MQ=255) cTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCtt < 2:2527797/101‑1 (MQ=255) cTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCtt < 1:1457771/101‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCttt < 1:3885904/101‑1 (MQ=255) tCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTa < 1:666147/101‑1 (MQ=255) ccGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAg < 1:896424/101‑1 (MQ=255) ccGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAg < 2:834332/101‑1 (MQ=255) cGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAgg < 1:2130428/101‑1 (MQ=255) cGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAgg < 1:3142374/101‑1 (MQ=255) gTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTggg > 2:3443154/1‑100 (MQ=255) ttttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGaa < 1:2866168/101‑1 (MQ=255) tttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAAt < 2:2111304/101‑1 (MQ=255) ttGCGAGTCGCC‑TTCCTTATTATAAATCTTTTTTTTTTCCTAATTATTTTCCTTTGCATAATTCGCCTGGGGTTAATGGCGGGGGGTTTTTTGGAATgaaa > 2:2084731/1‑101 (MQ=255) cGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATgaaagaa < 2:3891263/101‑1 (MQ=255) cGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTGGGATtaaaaaa > 2:2420774/1‑101 (MQ=255) gAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATgaaagaaa < 2:904527/101‑1 (MQ=255) gTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAAt < 1:2426662/101‑1 (MQ=255) gTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAAt < 1:1287315/101‑1 (MQ=255) cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTGGAATGAAAGaaaaaaa > 2:3338939/1‑98 (MQ=255) gCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgca < 2:1424527/101‑1 (MQ=255) ccTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaa < 2:1166143/101‑1 (MQ=255) cTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaag < 1:2463965/101‑1 (MQ=255) cTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAgcaag > 2:1702232/1‑101 (MQ=255) tttCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaagc < 1:2029852/101‑1 (MQ=255) ttCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaagca < 1:1100967/101‑1 (MQ=255) tCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaagcaa < 1:3660917/101‑1 (MQ=255) tCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTGGAATGAAAGAAAAAgcaaaaaa > 2:3164130/1‑97 (MQ=255) tCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTAGGAATGAAAGAAAAAgcaagcaa > 1:3760027/1‑101 (MQ=255) ccTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTAGGAATGAAAAAAAAAGCAAACaat > 1:769821/1‑101 (MQ=255) cTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCaata > 1:1888678/1‑101 (MQ=255) tGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCaataa < 1:1656053/101‑1 (MQ=255) aTTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataata < 2:670526/101‑1 (MQ=255) ttATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTGGAATGAAAAAAAATGCAAGCAataatat > 1:2094917/1‑101 (MQ=255) ttATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatat < 1:3338939/101‑1 (MQ=255) ttATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatat < 2:2581958/101‑1 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAGCAAGCAataatataa > 1:363102/1‑101 (MQ=255) taAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatataat < 1:439317/101‑1 (MQ=255) taAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTAGGAATGAAAGAAAAAGCAAGCAataatataaa > 1:1698470/1‑100 (MQ=255) aaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTTGAAAGAAAAAAAAAGGAAGCAATAATAtaaaaa > 2:3118767/1‑101 (MQ=255) aTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATaataat < 1:1714491/101‑1 (MQ=255) aTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATaataat < 1:2561116/101‑1 (MQ=255) aTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAAAAAAAGCAAGCAATAATAtaaaaaa > 2:1501136/1‑100 (MQ=255) aTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTAGGAATGAAAGAAAAAGCAAGCAATAATATaataat > 2:2144528/1‑101 (MQ=255) tCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAGCAAGCAATAATAtaataaag > 2:882395/1‑99 (MQ=255) ttATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGc > 1:1035038/1‑101 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAAAGGcc > 1:587342/1‑101 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGcc < 1:664058/101‑1 (MQ=255) aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCt < 2:3034626/101‑1 (MQ=255) aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCt < 2:2754479/101‑1 (MQ=255) gTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTGGAATGAAAAAAAAAACAAGCAAAAAAATAATAATGGCCTAAt > 2:3003350/1‑101 (MQ=255) gTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTGGAATGAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAATAAAAATGGCCTAAt > 2:10887/1‑101 (MQ=255) tttACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTGGAATGAAAAAAAAAGCAAACAATAATATAAAAATGGCCTAAtt > 2:1010733/1‑101 (MQ=255) tACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAACAAGCAATAATATAAAAAATGACTAAtttt > 2:3556002/1‑100 (MQ=255) tACCTAATCATTTTCCTATGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTc < 2:1023871/101‑1 (MQ=255) aCCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTAGGGATGAAAGAAAATGCAAGCAAAAATATAATAATGGCCTAAttttt > 1:1002936/1‑99 (MQ=255) tAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTg < 1:1941404/101‑1 (MQ=255) tCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTGGAATAAAAGAAAAATCAAGCAATAATATAATAAAGGCCTAATTTTTTTGAAc > 2:1738323/1‑101 (MQ=255) tCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGGAATAATATAATAATGGCCTAATTTTTTTGaaa > 2:2497313/1‑100 (MQ=255) cATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAAca < 2:1314004/101‑1 (MQ=255) cATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAAca < 1:2762034/101‑1 (MQ=255) cATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAAca < 2:3569950/101‑1 (MQ=255) tttCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAAcatca < 1:2060928/101‑1 (MQ=255) tttCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCGTTTTGGGATGAAAGAAAAAACAAGCAAAAATAAAATAAAAGCCTAATTTTTTTTTAcatca > 2:33940/1‑101 (MQ=255) ttCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAAcatcat < 1:1644287/101‑1 (MQ=255) ccTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTa < 2:2319426/101‑1 (MQ=255) ccTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTa > 1:1588794/1‑101 (MQ=255) cTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTaa < 2:2058968/101‑1 (MQ=255) tttGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAg < 1:3162267/101‑1 (MQ=255) 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cgcCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATatcatcat < 1:219058/101‑1 (MQ=255) ccTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTGGGATGAAAAAAAAAACAAGGAATAATATAATAATAGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCg > 2:1622299/1‑101 (MQ=255) ccTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTAGGAATGAAAGAAAAAGCAAGCAATAATATAAAAAAGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCg > 2:3823856/1‑101 (MQ=255) ccTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAACAAACAATAAAATAAAAAAAGCCTAATTTCTTTTAACATCATTAAGCATATCATCATCg > 2:1990623/1‑101 (MQ=255) cTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAGCAAGCAATAATATAAAAAAGGCCTAATTTCTTTTAACATCATTAAGCATATCATCATCGt > 2:3633223/1‑101 (MQ=255) cTGGGATTAATGGC‑GGGGGCCTTTAGGAATAAAAAAAAAATCAAGAAAAAATATAAAAAAGGGCTAAATTTTTTTAACATCATTAAGCATatcataatcct > 2:1957706/1‑99 (MQ=255) tGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTc > 1:3745862/1‑101 (MQ=255) tGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAGAAAAAGGAAGCAATAATATAATAAAAGCCTAATTTCTTTTAACATCATTAAGCATATCATCATCGTc > 2:3272737/1‑101 (MQ=255) gggATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCt < 2:122470/101‑1 (MQ=255) ttAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTAttt < 1:616771/101‑1 (MQ=255) ttAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTAttt < 1:311468/101‑1 (MQ=255) tAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTg < 2:2874530/101‑1 (MQ=255) aaTGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGc < 1:979194/101‑1 (MQ=255) tGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCa < 1:3052875/101‑1 (MQ=255) 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gTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATcc < 1:2925324/101‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCg > 1:1368009/1‑101 (MQ=255) tGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCg > 1:123519/1‑101 (MQ=255) | GCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCG > CP009273/4525907‑4526107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |