Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,325,806 | C→T | R168C (CGT→TGT) | topA → | DNA topoisomerase I, omega subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,325,806 | 0 | C | T | 99.2% | 490.3 / ‑4.6 | 124 | R168C (CGT→TGT) | topA | DNA topoisomerase I, omega subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (69/54); total (69/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGG > CP009273/1325709‑1325902 | ccGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTc > 1:553739/1‑101 (MQ=255) cGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTcn < 1:1353591/101‑2 (MQ=255) gAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGATGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGc < 2:3883957/101‑1 (MQ=255) aGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCt < 2:2110526/101‑1 (MQ=255) tggtgTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCttt > 1:3254086/1‑101 (MQ=255) ggtgTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTa < 1:549509/101‑1 (MQ=255) gtgtTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTAt > 1:3367022/1‑101 (MQ=255) gtTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATgg > 2:789076/1‑101 (MQ=255) gtTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATgg > 1:434989/1‑101 (MQ=255) gtTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCACGCATTTAACAAACCGGGCGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATgg > 1:3307311/1‑101 (MQ=255) ttAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGAc < 2:1155924/101‑1 (MQ=255) tAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGAcc > 2:149660/1‑101 (MQ=255) tAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGAcc > 1:2883139/1‑101 (MQ=255) tAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGAcc < 1:1233483/101‑1 (MQ=255) aaCGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACcg < 1:3551151/101‑1 (MQ=255) aaCGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACcg < 2:3287707/101‑1 (MQ=255) aCGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACcgc > 1:1608478/1‑101 (MQ=255) aCGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACcgc > 2:1288940/1‑101 (MQ=255) cGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACcgcg < 2:3859283/101‑1 (MQ=255) cGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACcgcg > 2:2788011/1‑101 (MQ=255) gAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCgt > 2:3454039/1‑101 (MQ=255) gAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCgt < 1:3265996/101‑1 (MQ=255) gAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCgt > 2:3836840/1‑101 (MQ=255) gAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCgt < 2:3315696/101‑1 (MQ=255) aaaTTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCgtg > 1:1095399/1‑101 (MQ=255) tACTAAAAACGCGATCCGCCGGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGCTCGTTTTAAGCCCCAGC‑GGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTggg < 2:369171/101‑1 (MQ=255) tACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGtggtgg < 1:528225/101‑1 (MQ=255) aaaaaCGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGta > 1:780603/1‑101 (MQ=255) aaaaCGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGtat < 1:3525123/101‑1 (MQ=255) aaaaCGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCCAGGTGGGGtat > 1:1372707/1‑101 (MQ=255) agcgcgATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTatat < 2:806896/99‑1 (MQ=255) aCGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATg < 2:385752/101‑1 (MQ=255) aCGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATg > 2:2956468/1‑101 (MQ=255) gcgATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGt < 1:1141429/101‑1 (MQ=255) cgATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGtt > 1:2947453/1‑101 (MQ=255) cgATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGtt < 1:2419449/101‑1 (MQ=255) gATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGttt < 2:959101/101‑1 (MQ=255) gATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGttt < 2:190796/101‑1 (MQ=255) gATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGttt < 2:54974/101‑1 (MQ=255) gATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGCATATGGttt > 2:1457551/1‑101 (MQ=255) aTCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTc < 2:1633855/101‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTc < 2:2947453/101‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTc < 1:152301/101‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTc > 2:451512/1‑101 (MQ=255) aTCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGGATATGGTTTc > 1:1363624/1‑101 (MQ=255) tCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTcg > 1:3771519/1‑101 (MQ=255) cGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTcgcc > 2:1379667/1‑101 (MQ=255) cGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTcgcc < 2:1053025/101‑1 (MQ=255) gCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTcgccg < 1:1012166/101‑1 (MQ=255) gCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTcgccg < 2:2993183/101‑1 (MQ=255) gCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGGATATGGTTTcgccg > 1:22918/1‑101 (MQ=255) ccAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTcgccgc > 2:270500/1‑101 (MQ=255) aGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCgctg < 1:789076/101‑1 (MQ=255) aGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCgctg < 2:1303889/101‑1 (MQ=255) aGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCgctg > 2:3435210/1‑101 (MQ=255) cATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTa > 1:1662191/1‑101 (MQ=255) ttAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATgg < 1:1080415/101‑1 (MQ=255) aaCAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaa > 1:1221411/1‑101 (MQ=255) aaCAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaa < 1:3776199/101‑1 (MQ=255) aCAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaaa < 1:915128/101‑1 (MQ=255) cAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaaaa > 2:590793/1‑101 (MQ=255) cAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaaaa > 2:1715308/1‑101 (MQ=255) cAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaaaa < 2:3237905/101‑1 (MQ=255) aaaCCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaaaaa > 1:883916/1‑101 (MQ=255) aaaCCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaaaaa > 2:1282545/1‑101 (MQ=255) aaaCCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGaaaaa > 2:1846198/1‑101 (MQ=255) cGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATc < 2:2244157/101‑1 (MQ=255) cGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATc < 2:2392642/101‑1 (MQ=255) cGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGCTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATc > 1:592923/1‑101 (MQ=255) gggTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCg > 1:2024458/1‑101 (MQ=255) gggTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCg < 2:1702787/101‑1 (MQ=255) ggTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGc > 1:1544245/1‑101 (MQ=255) ggTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGc < 2:497919/101‑1 (MQ=255) ggTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGc > 2:3343711/1‑101 (MQ=255) gTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCt < 1:3540490/101‑1 (MQ=255) tGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTc < 2:2343/101‑1 (MQ=255) gAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCg > 2:2357770/1‑101 (MQ=255) aGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGt > 1:374102/1‑101 (MQ=255) aGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGt > 1:2941822/1‑101 (MQ=255) gCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTg < 1:2014365/101‑1 (MQ=255) cTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTgg > 2:2525076/1‑101 (MQ=255) tGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGc > 1:2822153/1‑101 (MQ=255) tGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGc > 2:2739262/1‑101 (MQ=255) tGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGc > 2:3563665/1‑101 (MQ=255) gAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGcc > 2:3063609/1‑101 (MQ=255) aaTATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCt > 1:2648498/1‑101 (MQ=255) tGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTg > 1:1229972/1‑101 (MQ=255) aTCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGcc < 1:1119542/101‑1 (MQ=255) tAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCgtg < 1:1093090/101‑1 (MQ=255) tAATGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCgtg > 2:236460/1‑101 (MQ=255) aTGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGtgtg > 2:3557110/1‑101 (MQ=255) tGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGc > 1:2166782/1‑101 (MQ=255) tGCCCAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGc > 1:2478734/1‑101 (MQ=255) ccAGCAGGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGt > 1:1604161/1‑101 (MQ=255) cagcagGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTc > 1:2284191/1‑101 (MQ=255) cagcagGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTc > 2:2497789/1‑101 (MQ=255) agcagGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCg < 1:1696586/101‑1 (MQ=255) agGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTg < 2:1579898/101‑1 (MQ=255) agGCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTg > 1:3527675/1‑101 (MQ=255) ggCGTGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTgg > 2:136348/1‑101 (MQ=255) | CCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGG > CP009273/1325709‑1325902 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |