New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 354947 | 37 (1.080) | 5 (0.160) | 5/294 | 2.1 | 13.1% | coding (438/660 nt) | cynT | carbonic anhydrase |
? | CP009273 | = 355075 | 33 (1.060) | coding (566/660 nt) | cynT | carbonic anhydrase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CCCTTCCTACGGGCCGGAACCCGGTGGCGTTTCTGCTTCGGTGGAGTATGCCGTCGCTGCGCTTCGGGTATCTGACATTGTGATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCTGGGTCTACGACATTGAAAGCGGCAGCATCGCAGCTTTTGACGGCGCAACCCGCCAGTTTGTGCCACTGGCCGCTAATCCTCGCGTTTGTGCCATACCGCTACGCCAACCGACCGCAGCGTAACCTTATTTTTAAACCATCAGGAGTTCCACCATGATTCAGT > CP009273/354710‑355209 | tcattccgccGGGCCGGGACCCGTTGGCGTTTCTGTTTCGGTGGGGTTTGCCGTCGCTGCGCTTCGGGTTGCTGACATTGTGATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATCTGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCt < 2:218759/265‑1 (MQ=255) ccTTCCTACGGGCCGGAACCCGGTGGCGTTTCTGCTTCGGTGGAGTATGCCGTCGCTGCGCTTCGGGTATCTGACATTGTGATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCCGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCCCTGGCTGCGTTTTGCCGATTCAGCCCGCGTTGTTAATGACGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGGCAAAATCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAATTGGCTa > 1:218761/1‑274 (MQ=255) tCGGTGGAGTATGCCGTCGCTGCGCTTCGGGTATCTGACATTGTGATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGatgctgccgctttcaatgtcgtagacccagccgtgcagggcgatccgcccctcttcgagcgccaggcgcaccg < 1:282980‑M1/274‑74 (MQ=255) tGCTGTTGCCGCGTTTCGGTTTTCTGCCATTGTGATTTGTGGTCATCCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACGGGCTGCGTTCTGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTAGCGCTCGAAGAGGGGCGGa < 1:547472/275‑1 (MQ=255) tGCGCTTGTGGTATCTGACATTGTGATTTGGGGGCATTCTAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCAGGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTg < 1:31321/274‑1 (MQ=255) gcgcTTCGGGTATCTGACATTGTGATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCATTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGAt > 2:113845/1‑185 (MQ=255) ttCGGGTATCTGACATTGTGATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTa < 1:113846/185‑1 (MQ=255) ttGTGATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGatgctgccgct > 1:571614‑M1/1‑161 (MQ=255) tgtgATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCAt > 1:493674/1‑183 (MQ=255) tgATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCATGCACGGCTGGGTCTAAGACATTGaa > 1:413263/1‑275 (MQ=255) gATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGatgctgccgctttca < 2:571605‑M1/172‑16 (MQ=255) aTTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCCTCCCGCGTCGTTACTGAGGCGCGCCCGCCTTCCGCTTTACCGTCCAAAGCTGCGGCGAt > 2:295366/1‑161 (MQ=255) aTTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCt < 2:493667/183‑1 (MQ=255) gtgGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCAGGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTa < 1:295370/161‑1 (MQ=255) aTTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGa > 2:236384/1‑150 (MQ=255) cAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGt < 1:236387/150‑1 (MQ=255) cgATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTTCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCt > 1:411607/1‑158 (MQ=255) tGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTg > 2:511595/1‑153 (MQ=255) cGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGTCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCa < 1:511602/153‑1 (MQ=255) ccAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAgggg > 2:167820/1‑197 (MQ=255) cTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCTATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGa < 1:167821/197‑1 (MQ=255) tgccGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGGGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCANGGCTGGGTCTACGACATTGAAAGCGGCAGCATCGCAGCTTTTGACGGCGCAACCCGCCAGTTTGTGCCACTGGCCGCTAATCCTCGCGttt > 1:525900/1‑275 (MQ=255) ccGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGAGTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCTGGGTCTACGCCATTGAAAGCGGCAGCATCGCAGCTTTTGACGGCGCAACCCGCCAGATTGCTGCAATGGCCGCTAACCCTCGCGtgtg > 1:14622/1‑274 (MQ=255) cTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGatgctgccgctttcaatgtcgtagacccagccgtgcagggcgatccgcccctcttcg > 1:71376‑M1/1‑76 (MQ=255) gCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCTGGGTCTACGACATTGaaa > 1:267997/1‑191 (MQ=255) cTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGatgctgccgctttcaaggtcgtagacccagccgtgcagggcgatccgcccctcttcgagcg < 2:71375‑M1/133‑62 (MQ=255) tGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGcc > 2:182062/1‑135 (MQ=255) cGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGa > 1:161966/1‑73 (MQ=255) cGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGc > 1:371650/1‑163 (MQ=255) cGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCTGGGTCTACGACATTGAAAGCgg < 2:267993/191‑1 (MQ=255) ttATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGgc < 1:182064/135‑1 (MQ=255) aTGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGt < 2:161965/73‑1 (MQ=255) aTGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACgg < 2:371646/163‑1 (MQ=255) gcgcgcCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACg > 2:266208/1‑47 (MQ=255) gcCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGaa < 1:266212/47‑1 (MQ=255) cGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCGCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCTGGGTCTACGACATTGAAAGCGGCAGCATCGCAGCTTTTGACGGCGCAACCCGCCAGTTTGTGCCACTGGCCGCTAATCCTCGCGTTTGTGCCATACCGCTACGCCAACCGACCGCAGCGTAACCTTATTTTTAAACCATCAGGAGTTccacc < 1:169272/274‑1 (MQ=255) aCCGTCAAAAGGTGCGGCGATGTTACGTGAAATCGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCATGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCTGGGTCTACGACATTGAAAGCGGCAGCATCGCAGCTTTTGACGGCGCAACCCGCCAGTTTGTGCCACTGGCCGCTAATCCTCGCGTTTGTGCCATACCGCTACGCCAACCGACCGCAGCGTAACCTTATTTTTAAACCATCAGGAGTTCCACCATGAtt < 1:311883/274‑1 (MQ=255) cGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCAc > 1:27673/1‑110 (MQ=255) gTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCTGGGTCTACGACATTGAAAGCGGCAGCATCGCAGCTTTTGACGGCGCAACCCGCCAGTTTGTGCCACTGGCCGCTAATCCTCGCGTTTGTGCCATACCGCTACGCCAACCGACCGCAGCGTAACCTTATTTTTAAACCATCAGCAGTTCCACCATGATTCAGt < 1:544558/275‑1 (MQ=255) aaaaGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCt < 2:27672/110‑1 (MQ=255) cggcgATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGc > 1:544217/1‑45 (MQ=255) cggcgATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTcatccatc > 2:458701/1‑58 (MQ=255) | CCCTTCCTACGGGCCGGAACCCGGTGGCGTTTCTGCTTCGGTGGAGTATGCCGTCGCTGCGCTTCGGGTATCTGACATTGTGATTTGTGGTCATTCCAACTGTGGCGCGATGACCGCCATTGCCAGCTGTCAGTGCATGGACCATATGCCTGCCGTCTCCCACTGGCTGCGTTATGCCGATTCAGCCCGCGTCGTTAATGAGGCGCGCCCGCATTCCGATTTACCGTCAAAAGCTGCGGCGATGGTACGTGAAAACGTCATTGCTCAGTTGGCTAATTTGCAAACTCATCCATCGGTGCGCCTGGCGCTCGAAGAGGGGCGGATCGCCCTGCACGGCTGGGTCTACGACATTGAAAGCGGCAGCATCGCAGCTTTTGACGGCGCAACCCGCCAGTTTGTGCCACTGGCCGCTAATCCTCGCGTTTGTGCCATACCGCTACGCCAACCGACCGCAGCGTAACCTTATTTTTAAACCATCAGGAGTTCCACCATGATTCAGT > CP009273/354710‑355209 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |