New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 4334267 | 43 (1.560) | 4 (0.160) | 4/254 | NT | 8.4% | coding (1082/1422 nt) | melB | melibiose:sodium symporter |
? | CP009273 | = 4334413 | 47 (1.840) | coding (1228/1422 nt) | melB | melibiose:sodium symporter |
TGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAAT > CP009273/4334007‑4334536 | tGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGTTGGCAGATATCGTGGATTACGGTGAATATAAACTGCAGGTACGATGTGaaa > 2:6507/1‑275 (MQ=255) 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2:224635/1‑167 (MQ=255) tgtTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAg < 2:290402/197‑1 (MQ=255) tAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGc < 1:224637/167‑1 (MQ=255) cttttgtgtTCTTCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCCGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTg < 1:316047/270‑1 (MQ=255) gtgttgTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTNTTCTGGGTATTACAGGTCACCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGCGATGATTGGATATGTACCGAATGTTGaa < 1:429330/275‑1 (MQ=255) gtggttTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGaa < 1:6507/275‑1 (MQ=255) ggCATTAATGAGCTATCACAGCGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTGGTGTTAGGGATGATTTGCTATGTACCGANATTTGAACATTCGActgttctttcc > 2:375706/1‑264 (MQ=255) 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cgtcgtCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGtt > 1:279704/1‑204 (MQ=255) gtcCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAggg < 2:279702/204‑1 (MQ=255) gtcCCCATTGTGACTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTGGTGTTAGGgatgat < 1:551445/209‑1 (MQ=255) aaTGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCAtt > 1:129049/1‑159 (MQ=255) tgGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCgg < 2:129048/159‑1 (MQ=255) gcgcTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTa > 2:264849/1‑196 (MQ=255) tttttCTGGGGATTACAGGTCTGTATGGTGGCAGATTTCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGGACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCg < 2:560527/274‑1 (MQ=255) ttttCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCa < 1:264851/196‑1 (MQ=255) ggTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGGGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGGTTACTCCGTGCAGACTATGGAGGTGAAGGGCGGTTCAGACTGTGCGGCTTTTTTCACTGCGGTTGTGTTAGGGATGAtt > 2:218325/1‑157 (MQ=255) ttACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCt < 1:218327/157‑1 (MQ=255) gTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGt > 2:232681/1‑50 (MQ=255) gTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCt > 1:264448/1‑174 (MQ=255) gTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGt > 1:6840/1‑236 (MQ=255) tcatcaTGGTAGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCAtacctaatagggcttgcgtagactgttcaacattcggtacatagccaat > 1:548507‑M1/1‑46 (MQ=255) tcatGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGc < 1:232683/50‑1 (MQ=255) tcatGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGc < 2:264446/174‑1 (MQ=255) tcatGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACg < 2:6840/236‑1 (MQ=255) catGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCAtacctaatagggcttgcgtagactgttcaacattcggtacatagccaatcatc < 2:548499‑M1/95‑54 (MQ=255) tggtggCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATCGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCATTGGTGACACg < 1:551077/275‑1 (MQ=255) tggCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGAc > 1:160047/1‑73 (MQ=255) tggCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTAc > 2:496366/1‑166 (MQ=255) ggCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTAACAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTTCTTCCGTTTCTATCGCCCCAATGGTggacctcttg > 2:9278/1‑266 (MQ=255) 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atatCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCaa < 1:559999/164‑1 (MQ=255) tCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCAtgcctaatagggcttgcgtagactgttcaacattcggtacatagccaatcatccctaacacaaccgcaatgaaaaaa < 1:559742‑M1/105‑78 (MQ=255) cGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTACGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCGTTTTTCATAGCGGTTGTGTTAGGGATGCtt > 2:206649/1‑127 (MQ=255) ttGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGa > 1:324042/1‑37 (MQ=255) gATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCt < 1:206651/127‑1 (MQ=255) ttACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGt < 2:324037/37‑1 (MQ=255) gTGAATATAAACTGCACGTACGCTGGGAAAGTATCGCTTACTCCGGGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTACGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGc < 1:266581/181‑1 (MQ=255) aCTGCAtacctaatagggcttgcgtagacttttaaacattcggtacatagccaatcatccctaacacaaccgcaatgaataaagccgcaaaggctgaaccgcccttcaccaccatagtctgcacggagtaagcgatactttcacagcgtacgtgcagtttatattcaccgtaatcaacgatatctgccaccatgatgacctgtaatacccagaaaagcgccgttcccacattcagcaaaatacccgcaatcacaatgaggacgacgttgtgatag < 1:560535‑M1/275‑270 (MQ=255) aCTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGc > 2:214348/1‑87 (MQ=255) gCAtacctaatagggcttgcgtagactgttcaacattcggtacatagccaatcatccctaacacaaccgcaatgaaaaaagccgcaaaggctgaaccgcccttcaccaccatagtctgcacggagt > 1:474389‑M1/1‑3 (MQ=255) gCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCAtt > 1:283920/1‑82 (MQ=255) gCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGt > 2:402336/1‑120 (MQ=255) cACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGtt < 1:214350/87‑1 (MQ=255) aCGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGt > 2:242268/1‑118 (MQ=255) | TGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAAT > CP009273/4334007‑4334536 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |