| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 154238 | 59 (1.530) | 4 (0.110) | 4/298 | NT | 6.6% | coding (1376/1398 nt) | pcnB | poly(A) polymerase |
| ? | CP009273 | = 154557 | 57 (1.560) | coding (1057/1398 nt) | pcnB | poly(A) polymerase | |||||
ATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTACCCTGACGACGGGACATACGCAACTGCAACTGCCAGATATCGCGG > CP009273/153990‑154504 | aTACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGAGGTACCCTCACGACGGGGGGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGt > 1:431405/1‑274 (MQ=255) tgtgtgtgATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGGTTGCGGGGAGGACGAGTactgc > 2:688651/1‑270 (MQ=255) tgtgtgtgATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGG‑GCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGGCAACGAGTaggaccac > 2:609725/1‑275 (MQ=255) ttgATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCTCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTAGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCATCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCgg < 1:688660/274‑1 (MQ=255) gTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGG‑GCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGNGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGttc < 1:609734/275‑1 (MQ=255) agagagGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGCGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACTCCACTGTCCTGCGGTCCCCTCACGACGTGGTTCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTGCATCNCGGTCgcgt > 2:271220/1‑272 (MQ=255) tAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGa < 1:140700/275‑1 (MQ=255) ggTTGGTCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGANTGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCAGTGAGGGTTCTTAATCCAGCTCGTTGAg < 1:509047/238‑1 (MQ=255) tCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCAccc < 1:271225/275‑1 (MQ=255) cTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCCCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATCCGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTTCGCGTTTGCGTGGCCGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCATCTCGTTGAGCATCCCTTTTTTGTCTTGTGGCTCGGCACCCTGGACCTCAccc > 1:280197/1‑274 (MQ=255) cGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTTCGTGGACGACGAGTACGACGACCCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCCTCCCTCTGTGGTCTGGTGGNTTGGACACATGNNACCCACCcctcca > 2:485649/1‑275 (MQ=255) tAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGTGTACGACGACGCGATGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGTTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTc > 1:391620/1‑274 (MQ=255) gaaACGGTAAGAATGTGTGTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCATCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGANTGCTGCCTNTGGCAATATACGTCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCAACCATTTAACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACg < 1:464938/274‑1 (MQ=255) gCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCCGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCCCGCaa > 1:367676/1‑275 (MQ=255) gCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTAACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGNGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTGCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCCACACTTCaccccg > 1:601622/1‑267 (MQ=255) tCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGa > 1:32067/1‑202 (MQ=255) tCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCa < 1:590542/228‑1 (MQ=255) ggATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAAcc < 2:32067/202‑1 (MQ=255) tatCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGCCGCTGCAGATCCGCGTTCCGCCCAAATTCCGCCCGCAACNCCAACactc > 2:277873/1‑272 (MQ=255) ttCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACg < 1:570496/274‑1 (MQ=255) agcaTTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGCACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCCCAACTTCAGCCCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGTNTGGTACCTAgg > 2:55349/1‑275 (MQ=255) tGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAAc > 1:345620/1‑225 (MQ=255) cTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGctggacgaagcctgccgttcactggcaatcccgaaacgtctgccgacattaacccgcgatatctggcagttgcagttgcgtatgtcccgtcgtcagggtaaacgcgcatggaaactgctggagcatcctaagttccgtgcggcttatgacctgttggc > 2:186824‑M1/1‑70 (MQ=255) cTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTg > 1:381692/1‑85 (MQ=255) cTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCCGACGCTCCAGTTCAACGTTACGCTCCACTTCCGCTCGCAACGCCACCAGGTCATAAGCCGCACGGAACTTAtgctgcctcttct > 2:664194/1‑267 (MQ=255) cTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGATGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGCTCATAAGCCACAAGGAACTTAGGATGCCCcagcag > 1:70990/1‑275 (MQ=255) aGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGctggacgaagcctgccgttcactggcaatcccgaaacgtctgacgacattaacccgcgatatctggcagttgcagttgcgtatgtcccgtcgtcagggtaaacgcgcatggaaactgctggagcatcctaagttccgtgcggcttatgacctgttggccttg < 1:186827‑M1/228‑163 (MQ=255) aGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGgacg < 2:381686/85‑1 (MQ=255) aGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGANTAAGACGACGTCGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCa < 1:664203/248‑1 (MQ=255) gagGCCAGATTGATGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTg > 2:452346/1‑75 (MQ=255) ccAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGgacg < 1:452353/75‑1 (MQ=255) cAGATTTCTGCCTATGGCAATATACGCCACTATCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGTCGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTc < 1:684560/227‑1 (MQ=255) tgcCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTacgacgacg > 1:124096/1‑81 (MQ=255) tgcCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTgg > 1:27759/1‑145 (MQ=255) gcCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGctggacgaagcctgccgttcactggcaatcccgaaacgtctgacgacattaacc > 1:70068‑M1/1‑46 (MQ=255) cgaTGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTACCCTgacga < 1:277878/272‑1 (MQ=255) tATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGt < 2:124095/81‑1 (MQ=255) tATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACt < 2:27759/145‑1 (MQ=255) gttggtattataCGCCACTGGCATGCGGTACCCTCACGAGGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCCTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTACCCTgacgac < 1:356747/266‑1 (MQ=255) aTGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGctggacgaagcctgccgttcactggcaatcccgaaacgtctgacgacattaacccgcg < 2:70067‑M1/100‑59 (MQ=255) ggCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTTGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTTCATATCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCCTCAGCCGCACGGAACCTAGGATGCTCAACGAGTTTCCATGCGAGTTTACCCTGCAGACCGGa > 1:442520/1‑275 (MQ=255) cAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAg > 2:426410/1‑102 (MQ=255) tataCGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTc > 2:500656/1‑138 (MQ=255) tataCGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGAGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGCCATAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCACGCGAGGTAAACATGACGAAGGGACATa > 1:218368/1‑274 (MQ=255) ataCGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATc < 1:426417/102‑1 (MQ=255) taCGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCCTAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTAACCGGCCGACGGGACATACg > 2:289115/1‑274 (MQ=255) cGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCAccc < 1:500663/138‑1 (MQ=255) cACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTc > 2:518577/1‑131 (MQ=255) gTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGTCCATCCCTTTTTGGTGTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCAccc < 1:518584/131‑1 (MQ=255) cccTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATc > 2:638350/1‑65 (MQ=255) cccTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTg > 2:636570/1‑75 (MQ=255) cccTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATccc > 2:488281/1‑83 (MQ=255) cccTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTgg > 2:216727/1‑111 (MQ=255) cccTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTa > 2:665681/1‑234 (MQ=255) cccTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTACCCTGACGACGGGACATACGCAACTGCAACTGCCAGATATc > 1:590495/1‑275 (MQ=255) cccTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCCCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCACAAACCGCACGGCACTTAGGATGCTCCCGCAGCTTCCATTCGCGTTTACCCTGACGCCGGGACATACGCAACTGAACCTCCCAGatcac > 2:490461/1‑272 (MQ=255) cACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTGTTCCGCCAGCTCGTTGAGCATCCCtttt < 1:488288/83‑1 (MQ=255) cACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGc < 1:638359/65‑1 (MQ=255) cACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCa < 1:636579/75‑1 (MQ=255) cACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACt < 1:216731/111‑1 (MQ=255) cACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTACCCt < 1:665690/234‑1 (MQ=255) acgacgTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACGGAAttt > 1:708623/1‑198 (MQ=255) acgacgTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGAAGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATANGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTACCCTGACGACGGGACATACGCAACTGCAACTGCCAGATATCGCgg > 1:531524/1‑274 (MQ=255) ggtgCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGttcttc > 2:297895/1‑50 (MQ=255) | ATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGTCTGGTGGCGCGGAAACCTGGAACTCACCCCACCATTTCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGCAAGGCCAACAGGTCATAAGCCGCACGGAACTTAGGATGCTCCAGCAGTTTCCATGCGCGTTTACCCTGACGACGGGACATACGCAACTGCAACTGCCAGATATCGCGG > CP009273/153990‑154504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |