New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 158933 = | 49 (1.270) | 13 (0.350) | 7/304 | NT | 17.1% | coding (342/2430 nt) | hrpB | putative ATP‑dependent helicase |
? | CP009273 | 159131 = | 79 (2.120) | coding (540/2430 nt) | hrpB | putative ATP‑dependent helicase |
TTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCGTTATTTACCGCTGCCCGCGCATCAGCGTTTTGACGATGCCGTTGCGGTAGC > CP009273/158661‑159199 | ttattaAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCNGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCCTGACCCGGAACTGAg < 1:491327/275‑1 (MQ=255) ccGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGACAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCCAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGAGCATGAGCCAGCGAGACCCGGGAATGAGCGGGGTTGGACt > 1:31731/1‑275 (MQ=255) actggggCGGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACGGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCNGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTTACCCGGAACTGCGCGGTGTTGGACTGGt < 1:515283/272‑1 (MQ=255) ggggCCGGAAGCTGAACCGGGCGGCCGCTCCAACCGCGGGCGCCTCCCGGCATTAACGGGCAAATTAGCCGGCTGGGGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGACAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAGACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGAt < 2:31731/275‑1 (MQ=255) cccttgcggtgccgggaggatcgcttttcgctgatcgttcagcgacaacgcgccatacagcgggcagagcaatacatcactgccgatgcgcgaagccagttgttcctgcacacgctgaatttctccgacgccaggtaaaaataacagtaatgatccgctttcctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacg < 2:293237‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcggtgccgggaggatcgcttttcgctgatcgttcagcgacaacgcgccatacagcgggcagagcaatacatcactgccgatgcgcgaagccagttgttcctgcacacgctgaatttctccgacgccaggtaaaaataacagtaatgatccgctttcctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCg > 1:293243‑M1/250‑254 (MQ=255) cAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGCTGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGGGGTTACCGAAGGCGTGCTGACCAGCATGCACCAGCGTCACCCGGAACTGAGGGGGGGTGGACTGGGGAACCTTGATGAAGTGCATggaaggcgcgttgc > 2:167297/1‑262 (MQ=255) cGGCATTAACGGGAAAATTTTCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTNACGAAAAGNCAGGCGATACCGCTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttgg < 1:466600/275‑1 (MQ=255) gCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTtga < 1:412996/232‑1 (MQ=255) gcgccatacagcgggcagagcaatacatcactgccgatgcgcgaagccagttgttcctgcacacgctgaatttctccgacgccaggtaaaaataacagtaatgatccgctttcctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCg > 1:346059‑M1/205‑209 (MQ=255) agagacaaggAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttggcg < 1:140952/266‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGcaac < 1:393455/275‑1 (MQ=255) ggagtggcgTGGTCTGGCGGAGCGTAACGTCGGGCAACGTGTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTAGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGt < 1:670596/268‑1 (MQ=255) gCCGCGTGGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCt < 1:311983/273‑1 (MQ=255) cgtcgtCTGGCGGGGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtga < 1:167300/275‑1 (MQ=255) gatgcgcgaagccagttgttcctgcacacgctgaatttctccgacgccaggtaaaaataacagtaatgatccgctttcctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCGGTGCTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGAc < 1:399598‑M1/106‑1 (MQ=255) tcTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAg < 1:124940/171‑1 (MQ=255) cgTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACTCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCg > 2:522627/1‑163 (MQ=255) cgTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGgtgt > 1:622587/1‑167 (MQ=255) aCGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACTCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGgtgt < 1:522634/163‑1 (MQ=255) aCGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGa < 2:622578/167‑1 (MQ=255) catcgcAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTCCCGGATGCGTGCGCAAAACAGCGGCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGATGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGAGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTAATCGATGGGCAACAAGGTCTGGGTGATGACCTTAACctgcgtctcct > 2:118016/4‑267 (MQ=255) tgcacccgctgaattgcgccgacgcaaggtaaaaagaacagtaatggtccgctttcctgacgcagcatttcagcggtggctaacgcaacggcatcgtcaaaacgatgatgggcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCgg > 2:17158‑M1/148‑275 (MQ=255) cAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCgg < 1:131056/274‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGGTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGATGATAATGTCGGCTAc > 1:398339/1‑275 (MQ=255) ttAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAg < 2:663185/130‑1 (MQ=255) acgccaggtaaaaataacagtaatgatccgctttcctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGCGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGTCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGCTGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTAGGCTCcccttgacaccgtcctc < 2:76558‑M1/148‑9 (MQ=255) aGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcg > 1:598800/1‑182 (MQ=255) aGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttgg < 2:598791/182‑1 (MQ=255) ggCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAgcgc > 1:205336/1‑156 (MQ=255) aTACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCt < 2:205332/156‑1 (MQ=255) ccGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGa < 1:113283/274‑1 (MQ=255) gTTTGCTGCCGGGTGCGTGCGCAAAACGGCGTCGGGTCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGTTCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAg < 1:251023/274‑1 (MQ=255) ttGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCATGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGATCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAAGCTCCCAGAAgcg > 1:683245/1‑275 (MQ=255) atccgctttcctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacg < 1:327632‑M1/1‑1 (MQ=255) gCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACt > 1:601605/1‑178 (MQ=255) tACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGc > 2:629917/1‑196 (MQ=255) gctttcctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCg > 2:327626‑M1/98‑102 (MQ=255) ccGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGAt < 2:601596/178‑1 (MQ=255) ggATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtga < 1:629926/196‑1 (MQ=255) cctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcggtcaaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAGATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCa > 1:76559‑M1/93‑274 (MQ=255) aagtgacaggcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGTATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCa > 1:639054‑M1/93‑274 (MQ=255) ctgacgcagcatttcagcggtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCa > 1:104418‑M1/92‑273 (MQ=255) gcgtgcgCAAAACTGAGTCGGGCCGAATCACCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGNCTGc > 1:488143/1‑188 (MQ=255) gtgcgCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTCCCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGCACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGACttggcg > 1:601046/1‑152 (MQ=255) gcgcAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAGGGCGTGCTGACGCTCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTCGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGGCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTTTGTCGGCTACCCTGGACAACGAcc > 1:680485/1‑232 (MQ=255) gtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttccaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCAGGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCCCCGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCCCTTGTAGAAGATGCTGCCAGAAGGCCCTGTcgtcatcgcagaaacgatgtgcct < 2:639045‑M1/201‑12 (MQ=255) gtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATg < 1:706138‑M1/38‑1 (MQ=255) gtggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc < 1:439880‑M1/133‑1 (MQ=255) tggctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaancGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCa > 1:551181‑M1/72‑253 (MQ=255) ggCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcg > 2:256843/1‑134 (MQ=255) ctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAgcg > 2:706128‑M1/69‑110 (MQ=255) ctaccgcaacggcatcgtcaaaacgctgatgcgcgggcagcggtaaataacggcgttcaaccggaaacGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTgg > 2:439873‑M1/69‑205 (MQ=255) gAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttgg < 1:256848/134‑1 (MQ=255) aaagatggatGGAGGTGGATAAAGCAGGTGTGATGACGCGAAGGATGAAGCGTGACCGGGAACTTAGCGGTGTTGGACGGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGAGGATTTGGCGTTGGAGCTGTGACTCGAGGTGGAACAAGGTCAGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGGCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGaa < 2:398332/266‑1 (MQ=255) ccGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgtt > 2:467335/1‑126 (MQ=255) gCCAGGCAGTGGTTACCGGAGGGGTGGTGGCGCGCATGATCCGGCGTGACCCGGAACTGGGCGGTGTTGAACTGGTGTTCCGTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCg < 2:683236/274‑1 (MQ=255) ccTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATg > 1:705550/1‑181 (MQ=255) cTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttggcg < 1:467342/126‑1 (MQ=255) tGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGGGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACGCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTGAAACTGATGATTATGTCGGCTACGCTGGACAACGACCGCTGGCAGCAAATGCTGCCAGAAGAGCCTGTCGTACTCTCAGAAGGGCGCGCGTTTCCGGTTGAACGCCGGTAt > 1:452431/1‑275 (MQ=255) gAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCgg < 2:705540/181‑1 (MQ=255) cGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGACTGTCGTCATCTCAGAAAGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGGCGTTAttt > 2:156625/1‑264 (MQ=255) ggCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCGTTATTTACCg < 1:156628/264‑1 (MQ=255) gTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAg < 1:584262/38‑1 (MQ=255) gcATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGAtgtg > 2:439990/1‑110 (MQ=255) gATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGcaac < 1:439997/110‑1 (MQ=255) cGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCATATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCGTTATTTACCGCTGCCCGCGCATCAGCGTTTTGACGATGCCGTTGc > 1:441491/1‑275 (MQ=255) aCCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCATCAAATGCTGCCAGAAGCGCNTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCGTTATTTACCGCTGCCCGCGCATCAGCGTTTTGACGATGCCGTTGCGGt > 1:548784/1‑274 (MQ=255) aCCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCNTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCGTTATTTACCGCTGCCCGCGCATCAGCGTTTTGACGATGCCGTTGCGCTa > 1:513418/1‑275 (MQ=255) aCCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGATTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCATCTCAGAAGGACGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCGTTATTTACCGATCCCAGCACATCAGCGTTTTGACGATGCCGTAGCGCTa > 1:380172/1‑275 (MQ=255) cccGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTtgat > 2:546310/1‑37 (MQ=255) ggaaatGAGGGGGGTTGGATTGGTGATCCTTGATGTATTTCATGAGGGCAGCGTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCGTTATTTACCGCTGCCCGCGCATCAGCGTTTTGACGATGCCGTTGCGGTAGc > 2:548775‑M1/7‑273 (MQ=255) gAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAAt < 1:546319/37‑1 (MQ=255) aaCTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTGGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgtt > 1:538045/1‑70 (MQ=255) GAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttggcg > 2:538037‑M1/1‑70 (MQ=255) GAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtgat < 1:281063‑M1/103‑1 (MQ=255) | TTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGTCATCTCAGAAGGGCGCTCGTTTCCGGTTGAACGCCGTTATTTACCGCTGCCCGCGCATCAGCGTTTTGACGATGCCGTTGCGGTAGC > CP009273/158661‑159199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |