New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3213605 | 44 (1.140) | 15 (0.420) | 8/294 | NT | 23.0% | coding (753/1380 nt) | patA | putrescine:2‑oxoglutaric acid aminotransferase, PLP‑dependent |
? | CP009273 | = 3213757 | 59 (1.640) | coding (905/1380 nt) | patA | putrescine:2‑oxoglutaric acid aminotransferase, PLP‑dependent |
TCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCACCTTTGGCGGCAACCCGCTGGCCTGTGCGGC > CP009273/3213348‑3213877 | tCACCGGTCGGCAAGTTTATTTTTATGGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCNTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgccg < 1:562573/274‑1 (MQ=255) tATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTACCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATGGAAGCCATGCGCACTGCTCTTAACGAGTGCAAAAACACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGAACCTCGACCCAATTCAGGGAACAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑AGACGCCGCCCggcgcgttggcacggcagaggctctccggctgtacggagt > 2:200679‑M1/1‑235 (MQ=255) tGCCCCCTGCGGCGCTTTCCACTGTTAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGNCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGgcg < 1:565140/275‑1 (MQ=255) accaGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTAt > 1:259282/1‑234 (MQ=255) gcggcgCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCa < 2:259277/234‑1 (MQ=255) aatagacagttAAGTCCCTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCNATGCGCACGGTACTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCt < 1:666401/264‑1 (MQ=255) ggCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAAACGTTTATACCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGACATGCGCACGGCACTTACCGAGTGCAAAAAAAACGATGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCGGACGCCGGGCGATCTCAACGACGTACGTAAGCTCAGCGAGGAATTCGGCGCACTGATGATCCTCGAGGAGGTAcctgtctct > 2:666392/1‑265 (MQ=255) cGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATg > 1:143617/1‑275 (MQ=255) tCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagt < 1:114234‑M1/275‑109 (MQ=255) aaaCCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATNCTCGAACCGAGACAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATga < 1:653427/275‑1 (MQ=255) tttATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATgggg > 1:566611/1‑237 (MQ=255) ttATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCTTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGAACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTa < 1:63296/275‑1 (MQ=255) aTGCCTTTACTTCCGGTCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTAc < 1:568575/274‑1 (MQ=255) gCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGATGGTCGCGCCAATCGGCATCACGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagt < 1:242884‑M1/275‑109 (MQ=255) gTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAATCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACAGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCa > 1:559890/1‑158 (MQ=255) tACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCcgtac > 2:684161/1‑165 (MQ=255) gCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTaa < 1:684170/165‑1 (MQ=255) ttCCGGCAGGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGGACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTg < 1:365143/272‑1 (MQ=255) agaggaagagCAATTTCGAATCCATGCGCACGGCTCTGTACTGGGGCAAAAGAGCCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGAGGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAg < 2:666136/264‑1 (MQ=255) tttGGCAATATCGAAGCCAGGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTcg < 1:577223‑M2/274‑3 (MQ=255) aGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGAAGCACTGATGANCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGcc > 1:666145/1‑250 (MQ=255) cACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGGGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGGACTGATGATCCTTGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGAGGAGCCGTGATGCCGATAGgcg > 1:722879/1‑275 (MQ=255) ttAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCAt < 1:338113/274‑1 (MQ=255) gAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcat > 2:314845‑M1/1‑84 (MQ=255) aGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCAAGGGCAAGATGTTCGCATGCGAGCATGAGCACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGAGTGAGACCGATTGGCGCGAACATCGCCAc > 1:99790/1‑274 (MQ=255) gTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcat > 2:332703‑M1/1‑82 (MQ=255) gTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCa > 1:243194/1‑92 (MQ=255) gTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCcgtacgt > 1:38285/1‑103 (MQ=255) gTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGt > 1:162707/1‑119 (MQ=255) gTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGaa > 2:600210/1‑198 (MQ=255) gTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGCTGCCGATTGGCGCCACCCTCGcgcctc > 2:33361/1‑270 (MQ=255) gTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATCTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTg > 1:390350/1‑275 (MQ=255) tGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCAc > 1:694505/1‑272 (MQ=255) gCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagt < 1:314851‑M1/188‑109 (MQ=255) aaaaaaaCCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagtgcgccgaactcatcgcatagcttacgtacggc < 1:354649‑M1/218‑141 (MQ=255) aaaaaaaCCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagt < 1:86191‑M1/186‑109 (MQ=255) aaaaaaaCCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:243189/92‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGc < 2:38285/103‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCgg < 2:162704/119‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTa < 1:600219/198‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCGGTGATGAGGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagt < 1:332709‑M1/186‑109 (MQ=255) ccGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGt > 1:202048/1‑136 (MQ=255) gggatggagtgGCTGCGCTGATCCTGGCACCGATGCAGGGTGAAGGTGCC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCCCCGCCGGGCTATTGCACCGCCGTACGTAGGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCAGCGCCACTGAAGAGGTGtttt < 2:99789/265‑1 (MQ=255) tgatgaTGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACaa < 2:202044/136‑1 (MQ=255) gCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcat > 2:677161‑M1/1‑57 (MQ=255) gCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTa > 1:526536/1‑123 (MQ=255) cGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagt < 1:677170‑M1/161‑109 (MQ=255) cGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACaaa < 2:526528/123‑1 (MQ=255) aCCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcat > 2:287529‑M1/1‑40 (MQ=255) cGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTc > 1:11174/1‑77 (MQ=255) aTTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagt < 1:287534‑M1/144‑109 (MQ=255) tCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGgcg < 2:11174/77‑1 (MQ=255) agagacaGNTTGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑ACG‑‑‑‑‑TC‑CGCCCCCGCCGGGCTATCTCACGGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATaccacca < 2:59355/266‑1 (MQ=255) aaGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGCTTGGCGTGACCATCGCCACTGACGAGGTGTTTTCAGTTCTGTGCGACAGCCACTTCCGGCATACCACCCCCTTTgt > 2:680486/1‑273 (MQ=255) ggC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATTTCCCCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTNGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCACCTTTggcgg < 1:595875/272‑1 (MQ=255) gC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatacggctgtacgttctcatactcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatcaccgtctgtacttcatcgaggatcat > 2:77859‑M1/1‑20 (MQ=255) aaT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagt < 1:77860‑M1/124‑109 (MQ=255) t‑‑‑‑‑tC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCTCCTTTGGCGGCAACCCGCt < 1:567591/274‑1 (MQ=255) c‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGCCAACCCATTCCTGCATACCCCCACCTTTggcggcctgtccctta > 1:59356/1‑264 (MQ=255) tGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCACCTTTGGCGGCAACCCGCTGGc < 1:33361/274‑1 (MQ=255) ccgccgagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatc > 1:627833‑M1/1‑6 (MQ=255) cgagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgaggatcatcagtgcgccgaactcatcgcatagcttacgtacggcggtgagatagcccggcggcggcagaattacgccaccttcaccctgaatcggttcgaggatcaccgcagccacatcatcaccggtttttttgcactcgttaagagccgtgcgcctggcttcgatattgccaaa < 1:577223‑M1/274‑273 (MQ=255) cgagcgctttggcaaggcagaggatatccggctgtacgttctcatgctcgcaggcgaacatcttgcccgtgcgccccatgcccgtttgtacttcatcgagg < 2:627824‑M1/101‑100 (MQ=255) | TCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGC‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑AAT‑‑‑‑‑TC‑TGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCACCTTTGGCGGCAACCCGCTGGCCTGTGCGGC > CP009273/3213348‑3213877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |