New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3498992 | 65 (1.690) | 4 (0.110) | 4/306 | NT | 7.0% | coding (388/1086 nt) | yhfS | FNR‑regulated pyridoxal phosphate‑dependent aminotransferase family protein |
? | CP009273 | = 3499068 | 43 (1.150) | coding (312/1086 nt) | yhfS | FNR‑regulated pyridoxal phosphate‑dependent aminotransferase family protein |
CGTGGCGCGAATACGGTTGATAACATCAGCATCGCCGACCACTGCACCAACACCCTCTGGCCCAAATAGCTTGAAGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCGCCGCATTCACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATGCACCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAACGCGCGGTTGATTCAGTCCTGGCGTTAAGCCTAAAT > CP009273/3498723‑3499264 | cGTGGCGCGAATACGGTTGATAACATCAGCATCGCCGACCACTGCACCAACACCCTCTGGCCCAAATAGCTTGAAGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCGCCGCATTCACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTACCGCTGGAACACCTGCCTCGCGAACCGTTTCCAGCACATCTGCCAGCCAGTAGCTGTCCTGCCGCGTCTGGCGCGTATTCTTCCCCAGCGCCGCCACCCGTTGTTGCTCTTCGACGAcc > 1:406523/1‑274 (MQ=255) cGTGGCGCGAATACGGTTGATAACATCAGCATCGCCGACCACTGCACCAACACCCTCTGGCCCAAATAGCTTGAAGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCGCCGCATTCACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTNGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGCCGACGAcc > 1:536233/1‑274 (MQ=255) ggCGCGAATACGGTTGATAACATCAGCATCGCCGACCACTGCACCAACACCCTCTGGCCCAAATAGCTTGAAGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCGCCGCATTCACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCNAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCCCGTCGACGACCTGCt > 1:533798/1‑275 (MQ=255) cgcgAATACGGTTGATAACATCAGCATCGCCGACCACTGCACCAACACCCTCTGGCCCAAATAGCTTGAAGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCGCCGCATTCACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCCCCCCACGTTTCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTCCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCACCCTTTTGTTGCTCGTCCACCACCtctt > 2:496324/1‑270 (MQ=255) cgcgAATACGGTTGATAACATCAGCATCGCCGACCACTGCACCAACACCCCCTGGCCCAAATAGCTTGACGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCGCCGCATTCACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATAACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTCCAGCGCCCACCGTTGCCAGCACATCTGCCAGAACGAAGCCGTCGTGCAGCTCCTCGCGCGAATGCTGCACCACCGGCGCAACCTTTTGTTGCTCGNGTCCGACCCGCt > 2:522976/1‑273 (MQ=255) gttgaaaaactaaGCACCGCCGACCACTGCCCCAACCCCCTCTGGCCCAAATGGCTTGAAGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCCCCGCAGTCACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGa < 2:596809/261‑1 (MQ=255) aTCGCCGACCACTGCACCAACCCCCTCTGGCCCAAGTAGCTTGAAGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCGCCGCATTCACAGCCGCTTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCGGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCATATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCGGACAGGTCATTGAAATCaa < 1:568981/275‑1 (MQ=255) 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tcgctgcatcanaaGCCGATGCGACCCACCTGCATCACCGCGTAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCACCGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATg < 2:56718/262‑1 (MQ=255) ggccacaaTTCCCTGCCCATTCCAGCCCCCTTCATCACCGCCGTGTTGTCATCGGTGAACGCTGGAACACATGCCGCGGGGAACGTTGGCAGAGCATCTGCCAGCACGTAGCTGGCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATg < 2:679030/268‑1 (MQ=255) gATTCGAGCCACCTTCATCATCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGGGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATGCACCAGAAGACGCTGcc < 1:166684/275‑1 (MQ=255) 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tCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCTCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATACCCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATGCACCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCAc < 1:3397/275‑1 (MQ=255) tCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAATAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAgg > 2:439968/1‑152 (MQ=255) gCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAATAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGcgcg < 1:439975/152‑1 (MQ=255) cgcgTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACacgggttattattgagcagatggggctgacgctt > 2:232242‑M1/1‑44 (MQ=255) tATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACacgggttattattgagcagatggggctgacgcttatta < 1:232247‑M1/78‑39 (MQ=255) tgcACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACacgggttattattgagcagatggggctgacgcttattactgttgatttcaatgacc > 2:486413‑M1/1‑35 (MQ=255) tgcACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACCGtattg > 1:602394/1‑75 (MQ=255) tgcACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTAGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATGCACCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGATCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATcg > 1:308240/1‑190 (MQ=255) cACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTc > 1:33855/1‑57 (MQ=255) ccAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACacgggttattattgagcagatggggctgacgcttattaatgttgatttcaatgacctgtc < 1:486420‑M1/91‑61 (MQ=255) cAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCCGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATGCACCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCt > 1:67133/1‑203 (MQ=255) aGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTg < 2:33855/57‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGTTTTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTAAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATGCACCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCAc < 2:67132/203‑1 (MQ=255) cATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATc > 2:119455/1‑80 (MQ=255) cGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 1:119456/80‑1 (MQ=255) ttgCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATGCACCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAACCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAACGCGCGGTTGATTCAGTCCTGGCGtt > 1:112343/1‑274 (MQ=255) gtcgACGACCTGCTGCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCa < 1:103757/40‑1 (MQ=255) gACacgggttattatagagcagagggggtggacgcttattactgttgatttcaatgacctgtcggcactgaagcaggtcgtcgacgagcaacaaccggatgcggcgctggtgcagcatacgcgccagcagccgcaggacagctacgtgctggcagatgtgctggcaacgttgcgcgcggcaggngttccagcgttaaccgatgacaactatgcggtgatgaaggtggctcgaatcggctgtgaatgcggcgcgaatgtctcgacattttcctgct > 1:496331‑M1/1‑3 (MQ=255) | CGTGGCGCGAATACGGTTGATAACATCAGCATCGCCGACCACTGCACCAACACCCTCTGGCCCAAATAGCTTGAAGCAGGAAAATGTCGAGACATTCGCGCCGCATTCACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCATGCACCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAACGCGCGGTTGATTCAGTCCTGGCGTTAAGCCTAAAT > CP009273/3498723‑3499264 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |