New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 3752711 = | 54 (1.400) | 5 (0.140) | 5/298 | NT | 10.2% | coding (511/1845 nt) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
? | CP009273 | 3752978 = | 37 (1.010) | coding (244/1845 nt) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
GCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGCCAGATGCTCACGGGTCTGTGCCATCACGCCGTCATCGCACGCC > CP009273/3752438‑3752976 | ggacaagggtttttgggagtgttgttgaaatgattgttgcgactgccggacacgttgaccacggcaaaacaaccttattgcaggcgattactggcgtaaatgctgaccgtctgccggaagaaaaaaagcgcggcatgaccatcgatctcggctatgcctactggccgcagccggatggtcgcgtgcctggttttatcgacgttcccggtcatgaaaagtttctttccaacatgctggcgggcgttggtggtatcgatcacgcgctgttggtggtg > 2:605910‑M1/274‑275 (MQ=255) gagcaacggtttttggagatgttgttgaaatgattattgcgactgccggacacgttgaccacggcaaaacaaccttattgcaggcgattactggcgtaaatgctgaccgtctgccggaagaaaaaaagcgcggcatgaccatcgatctcggcnatgcctactggccgcagccggatggtcgcgtgcctggttttatcgacgttcccggtcatgaaaagtttctttccaacatgctggcgggcgttggtggtatcgatcacgcgctgttggtggtg < 1:605919‑M1/2‑1 (MQ=255) gcgtcggtttttggagatgttgttgaaatgattattgcgactgccggacacgttgaacacggcaaaacaaccttattgcaggcgattactggcgtaaatgctgaccgtctgccggaagaaaaaaagcgcggcatgaccatcgatctcggctatgcctactggccgcagccggatggtcgcgtgcctggttttatcgacgttcccggtcatgaaaagtttctttccaacatgctggcgggcgttggtggtatcgatcacgcgctgttggtggtgg > 1:98010‑M1/272‑274 (MQ=255) aTCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACTGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCt < 1:172802/275‑1 (MQ=255) ggCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAA‑‑GCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCGACCAGAGTGAANCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAAGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑AGTGCTcggg > 1:647086/1‑272 (MQ=255) cagcCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCg > 1:204377/1‑275 (MQ=255) ctctTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTggctct > 1:121294/1‑272 (MQ=255) gCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCCCCTTTTACGGAAAATGCTCGGTCAATCGCGCGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGCAGCAGATGCTAGCGCCGGGCAACCAt > 1:226934/1‑275 (MQ=255) tAAGCGCGATACGCTGCCCAGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCACGGCACCTTTTACGATAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTGTCTTGGCTGG‑CGTGCGGGCGTTCCGGCAACTGAATCAGAAGCCCGGCAAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGt > 1:575739/1‑274 (MQ=255) accgAGACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTTTTTGCTTGTTTTGCGCAGCCAGCGCCCGTACACGCTTCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGCATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGTACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTtgctg < 2:647077/273‑1 (MQ=255) ggttgaCGCGGCCCGGCATTTGCGGTCTCTGTGTGCGGGTTTTGCGTATGCAGCGCACTTATACGCATCTGTTTATTTACTCCCGTCAGCCATAGTGAATCGGCTACCTTCACTTCCCCGCTTACCGCCGTATCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTGCCGTCAACTGAAGCAGATGCTCGCTCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTtgctg < 2:226929/269‑1 (MQ=255) cccGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCt > 1:166276/1‑227 (MQ=255) gCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTcgcg < 2:166273/227‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCCCACGTACACGCATCGGTTTATTTACTCCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGc < 1:299524/275‑1 (MQ=255) gCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCAt > 2:326179/1‑233 (MQ=255) tttCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTccc < 1:326185/233‑1 (MQ=255) tctgccggaagaaaaaaagcgcggcatgaccatcgatctcggctatgcctactggccgcagccggatggtcgcgtgcctggttttatcgacgttcccggtcatgaaaagtttctttccaacatgctggcgggcgttggtggtatcgatcacgcgctattggtggtgg > 2:234936‑M1/165‑167 (MQ=255) cgcATGCATCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACTGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGaa < 1:305495/275‑1 (MQ=255) cgcATGCAGCGCACGTACTCGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGaa < 1:424789/275‑1 (MQ=255) cggaCGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCCGAGCGAATCGCCTACATTCACTTCAACGCGTAACGCCGTACCGGTGACGACAAGCCCGGCACCGTGGCCGGTAAATGAGCGGTCAATCGCGAGGCGGACACTACGTAGGCTGG‑AGTGCTCGCGGTCAGGCAACTGAATCAGATGCACGAGCAGGGCATCCATTCCTCGACATTCGTTTGCGCCGGGGATAACCATTTTTGCATCCGCCAAACGGTATTCCGGCCGANACTACNNNa > 2:256716/4‑275 (MQ=255) aTCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCtctgtccctt > 1:331588/1‑265 (MQ=255) tCAGCCAGAGCGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTCCCGGCAACAGAAGCAGATGCTCGCGCAGGCCATCCATTCCCCGCCCTTCGGTTGCTGCGTTGACAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGCCGTTCAACCACAACAACACGCCCtcc > 1:709584/1‑272 (MQ=255) aGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACGTCCCCGCGTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGTCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCACCGACCTTCGATTNCTGCGGTGNTAAACAGTTTTACTTCAGCAAAACAGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTAAACATCATCAACACGCGCTCCGTc > 1:466393/1‑275 (MQ=255) tCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGTCACCTTTTACGGTAAATTCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCTGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTGGCTGCGGTTGTAAACAATTTTGCCTCAGAAATACCGTATTACCGCa > 1:441204/1‑217 (MQ=255) ccccGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGc > 1:627660/1‑95 (MQ=255) ccccGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGtt > 2:236645/1‑155 (MQ=255) ggttttatcgacgttcccggtcatgaaaagtttctttccaacatgctggcgggcgttggtggtatcgatcacgcgctgttggtggTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGc < 1:72858‑M1/113‑1 (MQ=255) gCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTcgc < 2:627651/95‑1 (MQ=255) gCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTtgctg < 1:236650/155‑1 (MQ=255) cTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCCCCACT‑TTCAg > 1:212352/1‑275 (MQ=255) ttatcgacgttcccggtcatgaaaagtttctttccaacatgctggcgggcgttggtggtatcgatcacgcgctgttggtggTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGaa > 2:72857‑M1/82‑198 (MQ=255) caaacccGGACCAGGGACGACCAGCCCGGCCCCTTTTGCGGTAACTGCGCGTTCAATCGTGAGGCGGAGACTATGGTGGCGGG‑CGTGCTCTCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATGAACAGTTGTTCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACCCGCGCTTCGTCCACGCGGTCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCa < 2:204373/270‑1 (MQ=255) aCCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAGACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTcc > 1:236938/1‑126 (MQ=255) gTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAGACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGa < 2:236933/126‑1 (MQ=255) gTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCACGCAGGGCATCCAt > 1:604604/1‑119 (MQ=255) cgacCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCACGCAGGGCATCCATTccc < 2:604595/119‑1 (MQ=255) cccGGCACCTTTTACGGTAAGTGCGCGGTCACTCGCGAGGCGCCAACTAGGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGGAGCAGACGCTCGCGCAGGGCATCCATGCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGCTAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGc > 2:579363/1‑169 (MQ=255) cccGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGa > 2:374372/1‑82 (MQ=255) cccGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCCGCCAACCCGTCTTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACCCCCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCACCGCCACT‑GCCAGCATCGGGTTCCCTTCCAGCTGCaaa > 2:604733/1‑274 (MQ=255) cccGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACGATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCGTTACCTGGCGTTCAACGTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCCCCACT‑GCTACCATCGGCTTACCGGTCAGCTGCaaa > 1:671756/1‑274 (MQ=255) gCATCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTGCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCCAACCCGTATTCCCGCAGaa < 1:579372/169‑1 (MQ=255) gCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCa < 1:374378/82‑1 (MQ=255) ccTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCNGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGc < 1:604742/272‑1 (MQ=255) acatgctggcgggcgttggtggtatcgatcacgcgctgttggtggTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGGGCAGGGCATCCATTCCCAGAACTTCGGTtgc < 2:227460‑M1/70‑1 (MQ=255) gctggcgggcgttggtggtatcgatcacgcgctgttggtggTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCg > 1:227465‑M1/42‑115 (MQ=255) aaaTGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTGCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGCCAGATGCTCACgg > 1:627220/1‑274 (MQ=255) aaaTGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCa > 2:156069/1‑152 (MQ=255) agtacgcgGTCAAGCGCGAGCCGGAAACTCAGTTGGCGGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAATAAGATGATCACGACGGGCATCAAATCCTCTACCTTCTGCTCCTGCGATGCTAAACAGGATCGCCTCAGCAAAACCGTCTTCGCTCAGAACATCCTTTCACCGCCGCTCAACCTCCTCAACAACAGCTTCCGCCACTCTATCGGCACTAGTCAGCG‑CACTCGTACGCACCGGTGTACCGGTCCGCTGAAAACTCTACAGACGcgtgcgag > 2:95329/5‑267 (MQ=255) aaTGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAAcc > 1:209622/1‑140 (MQ=255) gcgcGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAAc < 1:156072/152‑1 (MQ=255) cgcgGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTAt < 2:209618/140‑1 (MQ=255) cgGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCCACCTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCGTCACAATCGCCAGATGNTCACggtcttgtt > 2:525324/1‑267 (MQ=255) cgGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTAAACCTCATCATCACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGCCAGATGCTCACGGGTCtgtg > 1:391750/1‑274 (MQ=255) gTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGa > 1:590316/1‑88 (MQ=255) gTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTa > 2:571050/1‑135 (MQ=255) aTCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCtt < 2:590307/88‑1 (MQ=255) aTCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTcc < 1:571059/135‑1 (MQ=255) aTCGCGAGGCGGAAACTATGTTGACTGG‑CATGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCTTCGNCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCACCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGCCAGATGCTCACGGGTCTGTGCCATCa > 1:494831/1‑274 (MQ=255) cgcgAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTNGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGGCAGATGCTCACGGGTCTGTGCCATCACg < 1:525331/274‑1 (MQ=255) cGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGGTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTTCCGc > 2:512261/1‑129 (MQ=255) aaaCTATGTTGGCGTG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGNTAAACAGTTTTGCCTCAGCTAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGCCAGATGCTCCCGGGTCTGTGCCATCACGCCGTCATCGc < 1:546034/274‑1 (MQ=255) aaCTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAACCCGTATTCCCGCAGaa < 1:512268/129‑1 (MQ=255) tgtggtggTGGTCGTGCTCTCGGTCCGCGACCTGAAGCAGAGTCTCGCTCAGGGCATCCAGTCCCCGACCTTCGTTTGCTGCGGTGATAAACAGTGTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCGTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGCCAGATGCTCACGGGTCTGTGCCATCACGCCGTCATCGCACGcc > 1:357461‑M1/9‑275 (MQ=255) ggctgg‑cGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAAAAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACgcgc > 2:57406/1‑157 (MQ=255) | GCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGG‑CGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCGCAGAACCTCCTTTACCTGGCGTTCAACCTCATCAACACGCGCTTCGTCCACGCGATCGGCTTTGGTCAGCGCCACT‑GTCAGCATCGGGTTACCGGTCAGCTGCAAAATCGCCAGATGCTCACGGGTCTGTGCCATCACGCCGTCATCGCACGCC > CP009273/3752438‑3752976 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |