New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TACCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTATGGGCGGCATGGGTGGCATGGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAGAAATAAACAAACCCCCGGGCAGAAATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGTAAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTTTCCGGGCAACACGGAGAAGAAGGCGGTTCTATGCGCGGCGCAGCAAACGATCTGCGCAACCAGGCGGCTGCAATGGGCGGTAACGTGATTTATGGCATCAGTAGCCCGTCGCAGGGAATGTTGTC > CP009273/4362404‑4362921 | tACCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTATGGGCGGCATGGGTGGCATGGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAGAAATAAACAAACCCCCGGGCAGAAATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCAAGGAAAATACTTAGCAGGGCGTGTCGGTGCCGCGCTACTGCTGGCggg > 2:719297/1‑275 (MQ=255) aaCGATGCAGCGGAGTTAGGCGCTGCGGGCGGGATGGGCGGCATGGGTGGCATGGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAGAAATNAACAAACCCCCGGGCAGATATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGTAAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCCACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAAc < 1:537015/275‑1 (MQ=255) tggggggCGGTCANGGAGGCATGGCTGGCGTTGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTAGCAGAAATAAACAAACCCCCGGGAAGAAATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGTAAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCCCCAGCAACGAATTGAGTGCGGCCGGTccg < 2:531273/269‑3 (MQ=255) gTATGGGCGGCATGGGTGGCATGGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAGAAATAAACAAACCCCCGGGCAGACATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGTAAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCATAGTGTACGCa < 1:719307/275‑1 (MQ=255) aTGGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAGAAATAAACAAACCCCCGGGCAGAAATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGTAAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGAt > 2:366231/1‑202 (MQ=255) aTGGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAGAAATAAACAAACCCCCGGGCAGAAATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGCGGAATAACATGCACGTAAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCa > 1:640157/1‑272 (MQ=255) gcggcATGATGTAATTGCCCTGCATCTCGCAGAAATAAACAAACCCCCGGGCAGAAATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGTAAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCg < 1:366237/202‑1 (MQ=255) 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aCTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAagcaaagcaa < 2:224751/151‑1 (MQ=255) ttAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTg > 2:420173/1‑113 (MQ=255) tAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAg > 1:239055/1‑49 (MQ=255) tAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAgtg > 2:609559/1‑78 (MQ=255) tAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑tt > 1:321735/1‑86 (MQ=255) tAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTa > 1:259170/1‑126 (MQ=255) tAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCCCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCagag > 2:74153/1‑76 (MQ=255) tAGCAGGGATAGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTTTCCGGGCAACACGGagaag > 1:708497/1‑174 (MQ=255) cAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAg < 1:420180/113‑1 (MQ=255) aGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTNCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTTTCCGGGCAACACGGAGAAGAAGGCGGTTCTATGCGCGGCGCAGCCCACGGTCTGCGCAGCCAGGCGGCTGCAAt < 1:486223/225‑1 (MQ=255) aGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAAc < 2:239050/49‑1 (MQ=255) aGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACg < 1:609568/78‑1 (MQ=255) aGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTgg < 2:321729/86‑1 (MQ=255) aGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGc < 2:259165/126‑1 (MQ=255) aGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTTTCCGGGCAACACGGagaaga < 2:479722/171‑1 (MQ=255) aGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTTTCCGGGCAACACGGAGAAGAAgg < 2:708487/174‑1 (MQ=255) gggtgggcGGGGCCGTGCTAATGATGGCGGGGTGTCGCTCCAGCAACGAATGGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTAATGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTGTCCGGGCAACACGGAGAAGAAGGCGGTTCTATGCGCGGCGCAGCAAACGATCTGCGCAACCAGGCGGCTGCAATGGGCGGTAACGTGATTTATGGCATCAGTAGCCCGTCGCAGGGAATGTTGTc < 2:242400/267‑1 (MQ=255) ggATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGa > 2:214141/1‑85 (MQ=255) ggATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTTTCCGGGCAACACGGAGAAGAAGGCGGTTCTATGCGCGGCGCAGCAAACGATCTGCGCa > 1:389545/1‑207 (MQ=255) aTTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCg > 1:117848/1‑123 (MQ=255) tGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGag < 1:214145/85‑1 (MQ=255) tGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTTTCCGGGCAACACGGAGAAGAAGGCGGTTCTATGCGCGGCGCAGCAAACGATCTGCGCAACCa < 2:389539/207‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAg < 2:117847/123‑1 (MQ=255) tGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTg > 1:381085/1‑43 (MQ=255) gCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCg > 2:238739/1‑52 (MQ=255) ccGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAg > 1:669516/1‑43 (MQ=255) ccGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCg > 2:311490/1‑51 (MQ=255) gcgcTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGtg < 2:381079/43‑1 (MQ=255) cgcTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa < 1:238744/52‑1 (MQ=255) GCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGtgct > 2:669507‑M1/1‑43 (MQ=255) GCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa > 1:311496‑M1/1‑51 (MQ=255) | TACCGACCTGCCGAAAAACGATGCAGCTGACTTAGGCGCTGCTGGCGGTATGGGCGGCATGGGTGGCATGGGCGGCATGATGTAATTGCCCTGCACCTCGCAGAAATAAACAAACCCCCGGGCAGAAATGTCTGGGGGTTTTTCTTTTGGTCATCTTTCTAGTATAAGATTCAGACACGGACGACGCGAGTGGCGTCCAGCTCATTGATTATGGGGAATAACATGCACGTAAAATACTTAGCAGGGATTGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCA‑TTGTGGACGAGCAGCCAGGCGCAGAGTGCCAGCTGATTGGTACTGCGACAGGTAAGCAAAGCAACTGGCTTTCCGGGCAACACGGAGAAGAAGGCGGTTCTATGCGCGGCGCAGCAAACGATCTGCGCAACCAGGCGGCTGCAATGGGCGGTAACGTGATTTATGGCATCAGTAGCCCGTCGCAGGGAATGTTGTC > CP009273/4362404‑4362921 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |