New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TCTTACTGGCGTAAAGCGAACGAAGCTTACATGGCGCTGATCATGGACGCGCGTTACAGCAAAGACCGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCTTTGACTCGGTGGCCCAGGACGCGGCAGAAAAAGCCGCCGTGGAAGGCATTCCGGCACTGA > CP009273/162063‑162600 | aCTGGCGTAAAGCGAACGAAGCTTACATGGCGCTGATCATGGACGCGCGTTACAGCAAAGACCGTATTCTTGAGCTGTAGATGAACGAGGTNTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTg < 1:509481/275‑1 (MQ=255) 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ccataccgactaacagcgcctgctggtcgaggcttagctcttctaccgggcgaccaaagtaatacaagcttgccagcgggaagccgcggatttcgttgtcgccgctctgaccgagatacacctcgttcatatacagctcaagaatacggtctttgctgtaacgcgcgtccatgatcagcgccatgtaagcttcgttcgctttacgccagtaaaaacgctcgctggagCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCCGCAACAGCAACAGATTATTGa > 1:225058‑M2/228‑274 (MQ=255) ggACGCGCGTTACAGGAAAGACCGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAACTCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATCATTGATCAAg < 1:699010/275‑1 (MQ=255) ggACGCGCGTTACAGCAAAGACCGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTTATCa > 2:712256/1‑273 (MQ=255) 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TCTTACTGGCGTAAAGCGAACGAAGCTTACATGGCGCTGATCATGGACGCGCGTTACAGCAAAGACCGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCTTTGACTCGGTGGCCCAGGACGCGGCAGAAAAAGCCGCCGTGGAAGGCATTCCGGCACTGA > CP009273/162063‑162600 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |