New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 394704 = | 35 (0.910) | 11 (0.300) | 6/296 | NT | 25.9% | coding (86/309 nt) | yaiY | DUF2755 family inner membrane protein |
? | CP009273 | 395096 = | 30 (0.830) | coding (48/213 nt) | yaiZ | DUF2754 family putative inner membrane protein |
GATACCAGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCCAGTTCAATCAAACGTGTGATCAGATCGGTGTAACCC > CP009273/394827‑395369 | gATACCGGCGGCTGATGGCAAGTATGACAGGTCATTTAGATTGTAAATATCAGAATCATTGTAAATTGATGTTGGGAATAATCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTCTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCAt < 1:344366/275‑1 (MQ=255) aTACCAGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGCTTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTAGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTATCTACACCACAGACAGTTGTTGCAGACTATAAAAGGATGATGTTTGTCGTTAACGGAACTGCCATGAATATGACTGTAAAAAACCGCCGTGATAGGCACTACAATGTGTTCGCCCtt > 2:603726/1‑275 (MQ=255) aaTCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGATCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCg > 1:557820/1‑218 (MQ=255) cATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGNTGCAGAATATGCCAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAg < 1:603735/275‑1 (MQ=255) aTGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCAt < 1:253839/218‑1 (MQ=255) aTGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCAt < 2:557811/218‑1 (MQ=255) ttGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCANGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCCTTCTTAATAGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGAAGACCTATg > 1:602795/1‑275 (MQ=255) tctaaatgacctgtctgacttgcaataagccgctggtatcacaccagaagagaagcagatgacttccggaggtttttatggctgatttcaccctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctcttcaacgcctggcaacattgcctatgcgttCGCCATTGGCCTTATATTCANTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGTTGACGTggg > 1:489971‑M2/164‑261 (MQ=255) tctaaatgacctgtcagacttgccataagccgctggtatcacaccagaagagaagcagatgacttccggaggtttttatggctgatttcacgctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctcttcaacgcctggcaacattgcctatgcgttCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTACTGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTcagg > 1:65510‑M2/164‑275 (MQ=255) tctaaatgacctgtcagacttgccataagccgctggtatcacaccagaagagaagcagatgacttccggaggtttttatggctgatttcaccctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctcttcaacgcctggcaacattgcctatgcgttCGCCATTAGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTctgg > 1:436073‑M2/164‑275 (MQ=255) tctaaatgacctgtcagacttgccataagccgctggtatcacaccagaagagaagcagatgacttccggaggtttttatggctgatttcaccctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctcttcaacgcctggcaacattgcctagtcgttCGCCATTGGCCTTATATTCCTTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTAAGCCGTCGGGCTGGGGACGGGGGTGATTAGTTtctt > 2:707350‑M2/164‑273 (MQ=255) tctaaatgacctgtcagacttgccataagccgctggtatcacaccagaagagaagcagatgacttccggaggtttttatggctgatttcaccctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctctacaacgcctggcaacattgcctatgcgttCGCCATTAGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTg > 1:439495‑M2/164‑216 (MQ=255) aGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCtt > 1:661345/1‑188 (MQ=255) acaAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATg < 2:661336/188‑1 (MQ=255) aatgacctgtcagacttgccctaagccgctggtatcacaccagaagagaagcagatgacttccagaggtttttattgctgatttcaccctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctcttcaacgcctggcaacattgcctatgcgttCGCCATTGGTCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGc < 1:672102‑M2/57‑1 (MQ=255) aatgacctgtcagacttgccataagccgctggtatcacaccagaagagaagcagatgacttccggcggtttttatggctgatttcaccctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgaaatgcctcttcaacgcctggcaacattgcctatgcgttCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGTCGTGGGTGAt < 1:707360‑M2/102‑1 (MQ=255) aatgacctgtcagacttgccataagccgctggtatcacaccagaagagaagcagatgacttccggaggtttttatggctgatttcaccctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctctacaacgcctggcaacattgcctatgcgttCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGc < 2:439488‑M2/57‑1 (MQ=255) aTTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGt > 2:458052/1‑177 (MQ=255) attaACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACt < 1:458059/177‑1 (MQ=255) gaatACACCACGGTAGTTTGTTGTAGACTATGAAAGGTTGTTTTTTTTTGTTCGAGGAGCGGCTAGGAATGTGATTGGAAAAAGCCGCCGGGATTGGCACTACTAGGCGTTCGCGAGTGGCAGTATATTCATTATTAATGGGGTGGGGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAGGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTATGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAAt < 2:602786/272‑1 (MQ=255) cgcgatggacgngcggaggtttgtctggcttatttcaccctggcaaaatcgctgtttagtggaaagtatcgcaatgcctcttcaacgccgggcaacgttgcctatgcgtgCGCCAGTGGGCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGTGTTACTGGGAGTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGTGTGATTAGTTTCGGTCTGGCGGGGTTGATTATTCGGCGTCTCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATa < 2:65509‑M2/165‑1 (MQ=255) gtatatgacttccggaggtttttatggctgatttcaccctgtcaaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctcttcaacgcctggnaacattgcctatgcgttCGGCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATaa < 1:564765‑M2/166‑1 (MQ=255) ttgttgCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCtggctggc < 1:426004/211‑1 (MQ=255) taagagacagatGCAAGGATGTTGTTTTTCGTGAGCGGGGCTGCCATGAATCTGCATGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGACATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGt < 2:240365/264‑1 (MQ=255) gAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTACCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGACGCAAAAGGTTGTCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTCGTTTCAGGCTGGCGGGGTTGCTGTTTCGTAGTAGCAATTAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAata > 1:680270/1‑275 (MQ=255) tatGCAGGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATACGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTAATGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGACGTAGGTCTGGGGACGTGGGAGNTTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGCTTATTTGTCGTTGCGATGAAGAAACTGAAAACGCACAATAAGAATATTAACGGGCGATAAAATATTa > 1:531671/1‑275 (MQ=255) ttgttTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCgg > 1:240370/1‑249 (MQ=255) caaaatcgctgtttagcggaaaatatcgcaatgcctcttcaacgcctggcaacattgcctatgcgttCACCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGTCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTg > 2:635421‑M2/68‑120 (MQ=255) cGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTgg > 2:188545/1‑110 (MQ=255) aaCGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGAtt < 1:188548/110‑1 (MQ=255) aaTCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTtata > 1:477980/1‑60 (MQ=255) tGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATattca < 2:477973/60‑1 (MQ=255) gCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGc > 1:710853/1‑70 (MQ=255) gCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGa > 1:380588/1‑110 (MQ=255) gCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAAc > 1:438034/1‑196 (MQ=255) ccTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTa > 2:365282/1‑81 (MQ=255) tttaaaaaaTCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTggg > 2:24762/5‑85 (MQ=255) gTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCgtgg < 2:710843/70‑1 (MQ=255) gTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTa < 2:380582/110‑1 (MQ=255) gTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGccc < 2:438027/196‑1 (MQ=255) tAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTgg < 1:365288/81‑1 (MQ=255) aaaaaTCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGAttt < 1:24762/85‑1 (MQ=255) tgtattaTGCTTTANCCCTTGGCCTTATGTTCGTTCTGTATTGCGTTTTGGGTTTACTGGGATTTGAAGCTAAAGGTTGGCAGACCTATGTCGTCGGTGTGGTGACTTGTGTGATTTGTTTCTCGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTACAATCTCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAATATAATACATTGTCGGTTGGAATGCGTTGTCCGCAGCGTGACGCTCCAGACCCAGTTCAATCAAACGTGTGATCTGa < 2:531663/270‑1 (MQ=255) tCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTACTGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCCAGTTCAATCAAACGTGTGATCAGATCGGTGTAAccc > 1:413456‑M2/2‑275 (MQ=255) tCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGGGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGACAACGCACAACAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTAAATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCAGCAGAGTGACACTCCAGCGCCATTTCAATCNAACGTGTTATAACATCGTTGTAAcc > 2:471438‑M2/2‑274 (MQ=255) tCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGAGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGAAGACCTATGCAGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGATACAGCGCCAGTTCAATCAAACGTGGTATCCgaacggagttaacc > 2:76925‑M2/2‑270 (MQ=255) | GATACCAGCGGCTTATGGCAAGTCTGACAGGTCATTTAGATTGTCAATATCAGAATCATGGTAAATTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAACGGAGCTGCCATGAATCTGCCTGTAAAAATCCGCCGTGACTGGCACTACTATGCGTTCGCCATTGGCCTTATATTCATTCTTAATGGCGTGGTGGGGTTACTGGGATTTGAAGCAAAAGGTTGGCAGACCTATGCCGTCGGTCTGGTGACGTGGGTGATTAGTTTCTGGCTGGCGGGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATCCGCAGCGTGACGCTCCAGCGCCAGTTCAATCAAACGTGTGATCAGATCGGTGTAACCC > CP009273/394827‑395369 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |