New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2489882 = | 39 (1.010) | 6 (0.170) | 5/290 | NT | 16.7% | coding (759/921 nt) | lpxP | palmitoleoyl‑acyl carrier protein (ACP)‑dependent acyltransferase |
? | CP009273 | 2490290 = | 24 (0.680) | intergenic (+246/‑110) | lpxP/ypdK | palmitoleoyl‑acyl carrier protein (ACP)‑dependent acyltransferase/inner membrane protein |
TGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGCGTACATTAGCGCCGTCTCGAGCAGTTTAGCTCAGAATTCTGGGGTGATGCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCAGGCGTAACAGTAATTACGCGGAGAGATGTAAAGTGAAATATTTCTTTATGGGCATTTCTTTTATGGTCATCGTTTGGGCCGGTACTTTTGCCCTGATGATCTAAAAGCAAACTGTGCAATGAAAAACAGGAGCCATCAGGCTC > CP009273/2490019‑2490510 | tGGGAGAATCGTCTTTGTACATTTAACAATCTGCTCTTACTTTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGCGTACATTAGCGCCGTCTCGAGCAGTTTAGCTCAGAATTCTGGGGTGATGCCCa < 1:568252/275‑1 (MQ=255) 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cTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGCGTACATTAGCGCCGTCTCGAGCAGTTTAGCTCAGAATTCTGGGGTGATGCCAACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCATGCGTAACAGTAATAACGCGGAGAGATGTAAAGTGAAATATTTCTTTATGGGAATTTCTTTTATGGTCATCGTTTGGGCAGGTACttttttctggatgctt > 2:11430/1‑263 (MQ=255) aaGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGCGTACATTAGCGCCGTCTCGAGCAGTTTAGCTCAGAATTCTGGGGTGATGCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCAGGCGTAACAGTAATTACGCGga < 2:664214/192‑1 (MQ=255) aaGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGAGTACATTAGCGCCGTCTCGAGCAGTTTAGCTCAGAATTCTGGGGTGATGCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCAGGCGTAACAGTAATTACGCGGAGAGATGTAAAGTGAAATATTTCTTTATGGGCAt < 1:418911/225‑1 (MQ=255) cgcatgatctctttctcgataatcttgttcatataggcagcggcttgattttcatctgtcgggtagccttccatctctggggtgatgCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCAGGCGTAACAGTAATTACGCGGAGAGATGTAAAGTGAAATATTTCTTTATGGGCATTTCTTTTATGGTCATCGTTTGGGCCGGTACTTTTGCCTTGACCAATTAAAAGCaa > 2:45145‑M2/88‑275 (MQ=255) cgcatgatctctttctcgataatcttgttcatataggcagcggcttgattttcatctgtcgggtagccttccatctctggggtgatgCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTAGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCAGGCGTAACAGTAATTACGCGGAGAGATGTAAAGTGAAATATTTCTTTATGGGCATTTATTTTATGGTAATTGTTTGGGGAggtacttttgctctgattttcgaagcgaac > 2:117575‑M2/88‑262 (MQ=255) aaTAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTGCAGTTTTGGGCGTACATTAGCGCCGTCTCGAGCAGTTTAGCTCAGAATTCTGGGGTGATGCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCAGGCGTGACAGTAATTACGNGGAGAGATNTAAAGTGAAATATTTCTTTa > 1:475782/1‑213 (MQ=255) 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gAATTCTGGGGTGATGCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCAGGCGTAACAGTAATTACGCGGAGAGATGTAAAGTGAAata < 1:453236/134‑1 (MQ=255) tggggtgatgCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCaa > 1:57060‑M2/11‑57 (MQ=255) gtgatgCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCa < 2:57060‑M2/51‑1 (MQ=255) | TGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGCGTACATTAGCGCCGTCTCGAGCAGTTTAGCTCAGAATTCTGGGGTGATGCCCACGGTAAAATACAGGGCTTTTAAGGTCGCTTTGCCCGGTGTCAACTCACTGTATCAGGTGTAATGAAGTCATTCAGGCGTAACAGTAATTACGCGGAGAGATGTAAAGTGAAATATTTCTTTATGGGCATTTCTTTTATGGTCATCGTTTGGGCCGGTACTTTTGCCCTGATGATCTAAAAGCAAACTGTGCAATGAAAAACAGGAGCCATCAGGCTC > CP009273/2490019‑2490510 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |