New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 3476232 = | 36 (0.940) | 7 (0.190) | 5/306 | NT | 17.3% | coding (1585/1914 nt) | yheS | putative transporter subunit of ABC superfamily: ATP‑binding component |
? | CP009273 | 3477029 = | 32 (0.850) | coding (469/1023 nt) | yheT | UPF0017 family putative hydrolase |
GTCTGGTGGTGTTTCACGGGCTGGAAGGCAGTCTCAACAGCCCTTACGCCCACGGTCTGGTTGAGGCGGCGCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTG > CP009273/3476781‑3477226 | gTCTGGTGGTGTTTCACGGGCTGGAAGCCAGTCTCAACAGCCCTTACGCCCACGGTCTGGTTGAGGCGGCGCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGGCGGCTTTGCGCCCGGCGGTAAAAATCTTGCCTGTTTGCCGGCcaa > 1:420907/1‑274 (MQ=255) tCTGGTGGTGTTTCACGGGCTGGAAGGCAGTCTCAACAGCCCTTACGCCCACGGTCTGGTTGAGGCGGCGCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAaagg < 1:590051/275‑1 (MQ=255) gtggtgTTGTACGGGCTGGAAGGCAGTCTCAACAGCCCTTACGCCCACGGTCTGGTTGAGGCGGCGCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAaaggaagg < 1:47302/275‑1 (MQ=255) cGCCCACGGTCTGGTTGGGGCGGCGCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTgcg < 1:263790/274‑1 (MQ=255) ggggcttggggttgcggcgCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATTCTTTTTGGCGGATGACGCGGTGAACCAAACCGTATGAACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTGTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTa < 2:39347/262‑1 (MQ=255) gcggcgCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTa > 1:231899/1‑262 (MQ=255) gcggcgCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTa < 2:231894/262‑1 (MQ=255) cggcgCAAAAGGGCGGTTGGCTGGGCGTTGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGTATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCTAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGt < 1:679427/275‑1 (MQ=255) gcctgcgccagttgcgcgttcagcttctccatctctttttccagacgggcaatctctttacgcagtggctgggtttgcgcacgcagctcagcttcccgacgcttctgatctttacgtgcctgggcgctgttcgcattctcttttggcgcttcgtcggtAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGGGCttt > 1:390875‑M2/159‑275 (MQ=255) tGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGGATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGCCAAAGGAAGGCANTGATCTCCNGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGGTTATGCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGtt > 1:477476/1‑275 (MQ=255) tttCGCGGATACAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCCCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATTGGGCGGTGATTGTCTCTGCTCCGTTTATGCTGGAAGCCTGGAGCTATCATATGGAAAAGGGCTTATCCCGGGGTTATCa > 1:705808/1‑275 (MQ=255) cgGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGGCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGGTGGCAAAGGAAGGCAATGATAGGCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCACTGCGCCGTTTATTCTGAAAGCCAGGAGGAGTCTGAGGGAGAAGGGCGTTTCCAGGGGTTGTCAggagt > 2:199224/1‑271 (MQ=255) ggtaaaaaaataagTATGCACCGTATTTGCCCGTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGGGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTTCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTg < 2:583539/260‑1 (MQ=255) tATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTGTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATCCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGcc > 1:680781/1‑274 (MQ=255) cGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGGTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCGGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATAGGCTGGCCTGCTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCCCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTAGGCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGAGATCTTGCCGCGTGTAGACGCGTGACGTGCTGCAGACGGTAAAAGCTAATggc > 2:329243/1‑271 (MQ=255) gCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGAAGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGt > 1:503679/1‑200 (MQ=255) ttACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGTAGCt < 2:503672/200‑1 (MQ=255) aCCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAATTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGtc > 1:416671/1‑167 (MQ=255) ttCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTg < 2:416664/167‑1 (MQ=255) tCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCCATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGc > 1:419271/1‑178 (MQ=255) tCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCt > 1:426923/1‑179 (MQ=255) ggcgagcaaCGGAAGACTCCAGTTTGNTTTTCCGCTGGCTGCAACGCTAATTTGTTCATGCGCCAACGGCTTCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCa < 2:477469/268‑1 (MQ=255) gCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGaa < 2:426916/179‑1 (MQ=255) gCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGa < 2:419264/178‑1 (MQ=255) aGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGc > 2:37102/1‑171 (MQ=255) gCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGt < 1:37102/171‑1 (MQ=255) cgcagctcagcttcccgacgcttctgatctttacgtgcctgggcgctgttcgccttctcttttggcgcttcgtcggtAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGATTATGCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGTGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTg > 1:634755‑M2/78‑275 (MQ=255) cgcagctcagcttcccgacgcttctgatctttacgtgcctgggcgctgttcgcattctcttttggcgcttcgtcggtAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATgc > 2:709022‑M2/78‑130 (MQ=255) gcagctcagcttcccgacgcttctgatctttacgtgcctgggcgctgttcgcattctcttttggcgcttcgtcggtAATATGCTGGCCTGTTTg > 2:237096‑M2/77‑94 (MQ=255) gcagctcagcttcccgacgcttctgatctttacgtgcctgggcgctgttcgcattctcttttggcgcttcgtcggtAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGTAGCTATCCTATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTTTTAAAAGCCAATGCCGCGTGCAATTTGGCAGCCTCCCCCCTAACGctc > 2:505797‑M2/77‑273 (MQ=255) gctcagcttcccgacgcttctgatctttacgtgcctgggcgctgttcgcattctcttttggcgcttcgtcggtAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATgcggcg < 1:709032‑M2/57‑1 (MQ=255) ctcagcttcccgacgcttctgatctttacgtgcctgggcgctgttcgcattctcttttggcgcttcgtcggtAATATGCTGGCCTGTTTGCTgg < 1:237101‑M2/22‑1 (MQ=255) tggctgCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATg > 2:156568/1‑97 (MQ=255) ggctgCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTgg > 2:353920/1‑81 (MQ=255) tgCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGAtct < 1:156571/97‑1 (MQ=255) gCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCaaa < 1:353926/81‑1 (MQ=255) tGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTgcgc > 1:267431/1‑98 (MQ=255) gTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGtt < 2:267426/98‑1 (MQ=255) ccaTTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCg < 2:98367/59‑1 (MQ=255) | GTCTGGTGGTGTTTCACGGGCTGGAAGGCAGTCTCAACAGCCCTTACGCCCACGGTCTGGTTGAGGCGGCGCAAAAGCGCGGCTGGCTGGGCGTGGTGATGCATTTTCGCGGATGCAGCGGTGAACCAAACCGTATGCACCGCATTTACCATTCGGGCGAAACCGAAGACGCCAGTTGGTTTTTACGCTGGCTGCAACGCGAATTTGGTCATGCGCCAACGGCTGCCGTCGGCTATTCGCTCGGCGGTAATATGCTGGCCTGTTTGCTGGCAAAGGAAGGCAATGATCTCCCGGTTGATGCGGCGGTGATTGTCTCTGCGCCGTTTATGCTGGAAGCCTGTAGCTATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTG > CP009273/3476781‑3477226 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |