New junction evidence | |||||||||||
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aTGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTgg > 1:434460/1‑181 (MQ=255) ttaGCCTTTTTCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGGTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGGCGTGGATGACTTTTCTGCCTTTGCGTCGGttgttg < 1:234643/272‑1 (MQ=255) tCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGAt < 2:434453/181‑1 (MQ=255) cAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCg > 1:106361/1‑110 (MQ=255) cAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGACGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTCTGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTANCGCCACGGGCGTGGAGGCCTGTTCTGCCTTTgggcctttt > 2:441151/1‑261 (MQ=255) cTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACg < 2:106360/110‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGc > 1:314898/1‑83 (MQ=255) aTcggcggttgtcgacatcgacaccacctggaaaaacgcctggttaattgtcatcagcgccgaactgtagacattatgaaaccacagtacgagggtacaaataaccaccagcgtaaactgtaagccgataaacatgcgaaatcccggatcgcgccaataaaccttcagactacgcccacttaacagtgaaaagtgcagaccgtagttacagccggagatcagcaggaagatagcaatgatagtgttaatagtcgggctatcgaaataaccgatac > 1:638197‑M2/1‑2 (MQ=255) | CTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGGCGTGGATGACTTTTCTGCCTTTGCGTCGGTTGTTGCGACATTGAA > CP009273/4027279‑4027805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |