New junction evidence | |||||||||||
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ctcaaccagaggaccatatctacggctgcggcgaacagttttcctacttcgatctgcgtgAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAg > 1:75735‑M2/61‑166 (MQ=255) caaccagaggaccatatctacggctgcggcgaacagttttcctacttcgatctgcgtgAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTg < 1:22136‑M2/176‑1 (MQ=255) aTTAGCGGTTTTAAAGGTGTGGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGCAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAATGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACTGCAAGACCCGTGTNTGCGttcatcg > 2:69784/1‑270 (MQ=255) accagaggaccatatctacggctgcggcgaacagttttcctacttcgatctgcgtgAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGt < 2:75734‑M2/110‑1 (MQ=255) cGGTTTTAAAGGTGTGGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCtcat > 2:49374/1‑72 (MQ=255) gTTTTAAAGGTGTGGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAaac < 1:17220/275‑1 (MQ=255) tttAAAGGTGTGGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAAc < 1:49374/72‑1 (MQ=255) gtgGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAGTTTAAAGCCAGCTCATGAACGTGGTTAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGGTTGCCGGGAGCTGGAACAGCTATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGGTAAATAAGGATGAATACCCACACCCTACGGCGCTGCGACAGTTCCGATATTCTGGCTTGCGATCACAACGGAACGACCGGGGTGTGAGTTGAGCGCATACACCAATtgtgccg > 2:665731/1‑272 (MQ=255) gtgGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCATCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGTATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTTCTGGAAGCTGGaa > 2:105738/1‑129 (MQ=255) gtgGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACgt > 1:643819/1‑65 (MQ=255) gtgGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTTCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAATTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTTCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTTCTTTTAGCAAATAAACAACTTGTGaat > 1:186664/1‑274 (MQ=255) gtgGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATTAACAGATGTTaa > 1:692869/1‑153 (MQ=255) gtgGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACNCCATAAGGCGCTg > 1:555898/1‑197 (MQ=255) gtgGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACACCATCAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTCCGATCTCCACGGAAAGAACCGAGTGTGCGTTGAGGGAATAaacaaccgttttag > 2:617208/1‑267 (MQ=255) gTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGcc < 1:69785/274‑1 (MQ=255) tCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACgtggtg < 2:643810/65‑1 (MQ=255) tCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGa < 1:105739/129‑1 (MQ=255) tCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTg < 2:692860/153‑1 (MQ=255) ttGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTa > 2:711335/1‑153 (MQ=255) cgcgGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATa < 1:711345/153‑1 (MQ=255) cGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACAGggcg > 1:320964/1‑275 (MQ=255) cgtgAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGttt > 1:209022‑M2/5‑79 (MQ=255) cgtgAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATNAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGAATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGGCAGaa > 1:612899‑M2/5‑275 (MQ=255) cgtgAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAg > 2:377944‑M2/5‑155 (MQ=255) cgtgAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATAtt > 1:547101‑M2/5‑177 (MQ=255) gtgAAATTTAAATCCGGCTCATCATCGTGTTGAAGCGTTGTCGTATTCGCGTGCTCATCGACGGCAGAATCCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGGTAANTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGGCAGaaa < 1:665740‑M2/272‑1 (MQ=255) aaaTTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCg < 2:209018/79‑1 (MQ=255) aaaTTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGgcgc < 1:377950/155‑1 (MQ=255) aaaTTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTgg < 2:547092/177‑1 (MQ=255) | TGATTCCAGTAATAATAAGTCGATACCTGAATTAAAGGCGTTAGGCGGGCAACTCATAGGTTCAACTGCCAGTCCCTGACGCTGTAATTTTTCACCGCTATAAACCTGCACCCAGAGTTGATCGGAACAAAGGCTTACCGAAAGCGCCTGCTGTGGATGGGTAATGGTCATTTCCCACAAATCATTAGCGGTTTTAAAGGTGTGGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGCGTTGTCGGATTCGCGTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGGCAGAAA > CP009273/4062883‑4063395 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |