| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009273 | = 4284794 | 46 (1.200) | 4 (0.110) | 4/298 | NT | 6.7% | coding (386/1314 nt) | gltP | glutamate/aspartate:proton symporter |
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GCGAAAGGCGAAATGCTGCCGATCATCTTTTTCTCGGTGCTGTTTGGTCTGGGGCTTTCTTCCCTGCCCGCGACGCATCGTGAACCGCTGGTGACCGTGTTCCGCTCCATCTCTGAAACCATGTTTAAAGTGACTCACATGGTGATGCGTTATGCACCGGTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGTGGCTAACTTTGGTTTCTCGTCTCTGTGGCCACTGGCGAAACTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCC > CP009273/4284874‑4285416 | gcggaaggcgaaaTGTTGCCGGTCAGCTTTTTCTCGGTGCTGTTTGGTCTGGGGCTTTCTTCCCTGACCGCGACGCATCGTGAACAGCTGGTGACCGTGTTCCGCTCCATCTCTGAAACCATGTTTAAAGTGACTAACATGGTGATGCGTTATGCACCGGTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGTGGCTAACTTTGGTTTCTCGTCTCTGTGGCCACTGGCGAAACTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGg > 1:258141‑M2/1‑273 (MQ=255) tGTTTGGTCTGGGGCTTTCTTCCCTGCCCGCGACGCATCGTGAACCGCTGGTGACCGTGTTCCGCTCCATCTCTGAAACCATGTTTAAAGTGACTCACATGGTGATGCGTTATGCACCGGTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGTGGCTAACTTTGGTTTCTCGTCTCTGTGGCCACTGGCGAAACTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGg > 2:112778‑M2/1‑233 (MQ=255) gttggtttttCTTCCCTGCCCGCGACTCTTCGTGTTCCGCTTGTGTTCGTGTTCCGCTCCGTCTCTGAACCCTTGTTTGTAGTTTTTTACATGGTGATGCGTCATGCACCGTTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGGGGTTAAATTTTGTGTCTCGTGTCTGTGGCCACTGTAGGAACTGTTGCTTGTTGTGCAGTTCGACCTTTAGTTGTTCGAGCTGGTAGTGGTGTGTATTGTGGCTCGCTTGTGCGGGTTACGCGTCAGGATCCt < 2:93275/268‑1 (MQ=255) tGGGGCTTTCTTCCCTGCCCGCGACGCATCGTGAACCGCTGGTGACCGTGTTCCGCTCCATGTCTGAAACCATGTTTAAAGTGACGCACATGGTGATGCGTTATGCACCGGTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGTGGCTAACTTTGGTTTCTCGTCTCTGTGGCCACTGGCGAAACTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCt < 2:723151/274‑1 (MQ=255) ggCTTTCTTCCCTGCCCGAGACGCATCGTGAACCGCTGGTGACCGTGTTCCGCTCCATCTCTGAACCCCTGTTTAACGTGACTGCCATGGTGATGCGTTAGGCAACGGTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGTGGCTAACTGTGGTTTCTCGTATCTGTGGCCACTGGCGACACTGGTTCTGCTGGTGCATTTCGCCCTTCTGTTCTTGTCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGTGATAAGCGCGTGGATCGTGAta > 2:148737/1‑274 (MQ=255) cccTGCCCGCGACGCATCGTGAACCGCTGGTGACCGTGTTCCGCTCCATCTCTGAAACCATGTTTAAAGTGACTCACATGGTGATGCGTTATGCACCGGTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGTGGCTAACTTTGGTTTCTCGTCTCTGTGGCCACTGGCGAAACTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGTCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTg > 1:142865/1‑275 (MQ=255) gcgACGCATCGTGAACCGCTGGTGACCGTGTTCCGCTCCATCTCTGAAACCATGTTTAAAGTGACTCACATGGTGATGCGTTATGCACCGGTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGTGGCTAACTTTGGTTTCTCGTCTCTGTGGCCACTGGCGAAACTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGgcgcg > 1:309700/1‑227 (MQ=255) 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aaaCTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCt < 1:160984/95‑1 (MQ=255) aaaCTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCa < 2:151822/142‑1 (MQ=255) aCTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGcc > 2:2461/1‑68 (MQ=255) tGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAg < 1:619203/79‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGgtagtgctctgatatttcgagatatcgacggtcgccaactgcgacatatccaccccggcaccgggctggaagacgttcgccagagtgatccccaa < 1:551261‑M2/135‑96 (MQ=255) gTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCtgtg < 1:2461/68‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGCAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTTATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATc > 1:575915/1‑275 (MQ=255) ctgctgGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGgtagtgctctgatatttcgagatatcgacggtcgccaactgcgacatatccaccccggcaccgggctggaagacgttcgccagagtgatccccaaaatg > 2:551252‑M2/1‑36 (MQ=255) tGCGTTTCGGCATTCTGTTTGTCGCGCTGGGAGTGTGGGGAATTGTGGCGCGCTTGTGCTGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTTGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATcgcg < 2:21199/275‑1 (MQ=255) tGCATTTCGCTATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACNCCACTGCCAGTTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATcgcg < 1:650247/275‑1 (MQ=255) gCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGgtagtgctctgatatttcgagatatcgacggtcgccaactgcgacatat < 1:583342‑M2/77‑50 (MQ=255) ttCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGgtagtgctctgatatttcgagatatcgacggtcgccaactgcgacatatccac > 2:583333‑M2/1‑24 (MQ=255) ttCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCt > 2:164761/1‑239 (MQ=255) tCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCAt > 1:151077/1‑265 (MQ=255) tCGCCATTCTGTTCTACGCGCTGATAGTAGTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGANCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTACATCGCGCAg > 1:502635/1‑272 (MQ=255) gCCTTTCTTTTTTTCGTGCTGGTAGTTCTGGGATTTTTGGCGCGCCTGTGCGGGTGAAGCGTCTGGTTTCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGTTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATGTTCATCGCGCAGTTGTa < 2:636037/275‑1 (MQ=255) ccATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTAt < 1:164764/239‑1 (MQ=255) ttttagggttGGTTGGGCTGGGGATTGTGGCGCGACTGTGCGGGTTTAGCGTCTTGTTCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGAc < 2:578147/266‑1 (MQ=255) ttcGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGTTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTTTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTTCTCGCGCAGTTTTATGGctgtttttt > 2:627946/1‑267 (MQ=255) cgcTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATcgcg < 1:627955/251‑1 (MQ=255) gcTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCACAGTATTGCCGCTATCTTCATCGGGCAGTTGTCTGGCATTGACCttctc > 2:715485/1‑270 (MQ=255) | GCGAAAGGCGAAATGCTGCCGATCATCTTTTTCTCGGTGCTGTTTGGTCTGGGGCTTTCTTCCCTGCCCGCGACGCATCGTGAACCGCTGGTGACCGTGTTCCGCTCCATCTCTGAAACCATGTTTAAAGTGACTCACATGGTGATGCGTTATGCACCGGTGGGTGTGTTTGCGCTGATTGCGGTGACGGTGGCTAACTTTGGTTTCTCGTCTCTGTGGCCACTGGCGAAACTGGTGCTGCTGGTGCATTTCGCCATTCTGTTCTTCGCGCTGGTAGTGCTGGGAATTGTGGCGCGCCTGTGCGGGTTAAGCGTCTGGATCCTGATTCGTATTCTGAAAGATGAGCTGATTCTGGCGTACTCCACTGCCAGCTCTGAAAGCGTGCTGCCGCGAATTATTGAGAAGATGGAAGCCTACGGAGCACCGGTGTCGATCACCAGTTTCGTGGTGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCC > CP009273/4284874‑4285416 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |