| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009273 | 4582489 = | 110 (2.860) | 4 (0.110) | 4/294 | NT | 3.4% | coding (1016/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor |
| ? | CP009273 | 4584393 = | 121 (3.360) | coding (147/1362 nt) | yjjL | L‑galactonate transporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
ATACGCACCAACACGAACTGCGTAAAGTTGTGCACCATGCCAGACATTGCCTGGAACAGTGACCAGAAGAACATCCCCAGTCCCAGCATCAGGCGTGGGCCTTTACGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTACCGCCGCAAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCTGGTGGCACGGGAATATCTGCCGACGAAGATGGAGTAAATGAAGAACGCGGATCGATGGTGATATTTTCTTTTTCCACGCCGGACTCCTGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGT > CP009273/4584127‑4584668 | aTACGCACCAACACGAACTGCGTAAAGTTGTGCACCATGCCAGACATTGCCTGGAACAGTGACCAGAAGAACATCCCCAGTCCCAGCATCAGGCGTTGGCCTTTACGATACAATAGTGGGCAGCAAGGAAGTCGCGCCATCACGAAAGCGAATAAAAACAAGGCGAGCAAAGCGACGATTTCGGACGAACTTAATACAAATTCTTCACAAATCGATAAAATCGAGAACGAAAGAAAACTCAGGTCGAGATAAGAGATTAANNANCCAaaaaaaaa > 2:567679/1‑275 (MQ=255)aTACGCACCAACACGAACTGCGTAAAGTTGTGCACCATGCCAGACATTGCCTGGAACAGTGACCAGAAGAACATCCCCAGTCCCAGCATCAGGCGTGGGCCTTTACGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGAGGTCGAGATAATTGATTACCGCCTCAAAAcataa > 2:503568/1‑275 (MQ=255) aCCAACACGAACTGCGTAAAGTTGTGCACCATGCCAGACATTGCCTGGAACAGTGACCAGAAGAACATCCCCAGTCCCAGCATCAGGCGTGGGCCTTTACGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTACCGCCGCAAAAAATAATaacaa > 1:103717/1‑275 (MQ=255) acccaCTTCGTAAAGTTGTGCACCATGCCAGACATTGCCTGGAACAGTGACCAGAAGAACATCCCCAGTCCCAGCATCAGGCGTGGGCCTTTACGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTACCGCCGCAAAAAATAATAACAACATGGc < 2:103716/271‑1 (MQ=255) aagAATTGGGTAAAGTTGTGCACCATGACAGAAATGGCCTGGAACAGTGACCAGAAGAACATCCCCAGTCCCAGCATCAGGCGTGGGCCTTNACGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGCTCGAGATAATTGATTACCGCCGCAAAAAATAATAACATCATGGc < 1:520542/273‑1 (MQ=255) tggaCCATGCCAGAGATTTCCTGGAACAGTGACCAGAAGAACAGCCCCAGTCCCAGCATCATGCGTGGGCCTTTACGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACAGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTACCGCCGCAAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGttt < 1:279378/272‑1 (MQ=255) cATGCCAGACATTGCCTGGAACAGTGACCAGAAGAACATCCCCAGTCCCAGCATCAGGCGTGGGCCTTTACGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTACCGCCGCAAAAAATAATAACAACATGGCGGCGGTTTGAATGCGTTTAATTc > 1:278508/1‑275 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |