New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 4604655 | 75 (1.950) | 8 (0.210) | 6/308 | NT | 9.8% | coding (706/864 nt) | yjjW | putative pyruvate formate lyase activating enzyme |
? | CP009273 | = 4605047 | 73 (1.940) | coding (314/864 nt) | yjjW | putative pyruvate formate lyase activating enzyme |
CGCTTAATCTGCTGATTATCGCGTCCGGTGAGTTGTTGATGACATTCGCTCCCCCACGCTTTGAGATCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCAACGTCCCATCGTCCACGGATTGTGACAGTTTTTGCAGCGCAGATTGCAGCCCTGCAAAAACAGAGCCAGACGACTGCCTGGCCCGTCAACG > CP009273/4604774‑4605313 | cgcTTAATCTGCTGATTATCGCGTCCGGTGAGTTGTTGATGACATTCGCTCCCCCACGCTTTGAGATCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGAAAGATGAGATGGCGNAGTTGCGGATCGGTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCAACCACAAACGGCAGCTGGGGCGTGGCTTTACCGCCACTCACCGTTAACCCTTCGATAAAAAACACAGCTTTGCTGACAt > 1:647862/1‑274 (MQ=255) gttaATGTGCTGCGTATCGCGTCCGGTGAGTTGTTGATGACGTTCGCTCTCCCACTCTTTGAGATCGAGTATTGCGCCTTCGTACTCCGGGAGCAATTTTTCCGAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACAAGACAGGTGAGTTGGCGCAGTTGCTGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGTCTTTACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCCGACATgg > 2:98218‑M2/2‑272 (MQ=255) tgctgATTATCGCGTCCGGTGAGTTGTTGATTACATTCGCTCCCCCACGCTTTGATATCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGNGAGCAATTNTTCCCAGCCGGTGTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGTACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCAc < 1:481509/275‑1 (MQ=255) gctgATTATCGCGTCCGGTGAGTTGTTGATGACATTCGCTCCCCCACGCTTTGAGATCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTCGCGGATCGTTTTTGCTAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCGTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGAACTGCTTTGCGAACATGGCTAAGCACt > 1:643083/1‑275 (MQ=255) tgctcgTCCTGTGAGTTGTGGATGATATTCGCTACCCCACGTTGTGAGATCGAGCATTGCGCCGTTGGACACCGAGACCAATTGTTCCCGTCCGGTTTCGCTCAACAGGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGTTAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCa < 1:306064/271‑1 (MQ=255) atggcgTCCGCTGAGTTGTTGAGTACACTCGCCCCTCCACGCTTCGAGATGGATAATTGCGCCCTCGCCCACCGGGATCAATTTTTCCCAGCTGGTTTTGCTCAACGTGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCa < 2:226761/272‑1 (MQ=255) gttgATGACATTCGCTCCCCCACGCTTTGAGATCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTANACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGcc > 1:605480/1‑275 (MQ=255) atgaCATTCGCTCCCCCACGCTTTGAGATCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCNCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCa < 1:617385/272‑1 (MQ=255) tGAGATCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCg > 2:152806/1‑227 (MQ=255) aTCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCa < 1:152809/227‑1 (MQ=255) cGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTg > 1:59201/1‑238 (MQ=255) aGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAACCCGCGCCACCACAACCGGCCGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCTTTCTCCCTTCGATACACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTCAGCCCTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTTGCATTTTGCGGCCCCCTCTTccggc > 1:304574/1‑274 (MQ=255) cATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGcc < 2:59200/238‑1 (MQ=255) cgcCGTCGCACACCGGGTGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGGCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAACCAGCGCCACCTCAAACAGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATca < 1:632065/275‑1 (MQ=255) cGTCGCACACCGGGAGTATTTTTTCCCAGCCGGTTTCGATCAACATTCCGTTACTGTCCACAATACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGAGAGCAGTAAACAGCGCCACCACANACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCacac < 1:607111/275‑1 (MQ=255) gTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACt < 1:226158/275‑1 (MQ=255) tCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGAGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCACCACTCACCGTNATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTAATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGGATCaaaca > 1:650108/1‑273 (MQ=255) cacCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCAGGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATctgtctcttat > 1:396300/1‑264 (MQ=255) gtgtattttgtCCCATCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACCTCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCTGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACca < 1:404065/269‑1 (MQ=255) aCATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATggcgatgttccggtacgcctgaacgcgtttcatgc < 1:444595‑M2/188‑36 (MQ=255) aTGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACAGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTcaacaa < 1:447407/274‑1 (MQ=255) gCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATggcgatgttccggtacgcctgaacgcgtttcatgcccac > 2:444588‑M2/1‑149 (MQ=255) ctttattttCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGc < 1:66573/267‑1 (MQ=255) cTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCg > 1:257332/1‑156 (MQ=255) tCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGAACTTCGTCCCCGCTCATGGATTCCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCCCAGCGGTCCCCACCACTTTGCCCTCACCACCCTGCCACAcccc > 2:598261/1‑273 (MQ=255) ccaccaGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCa < 2:257327/156‑1 (MQ=255) caccaGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCg > 1:193931/1‑151 (MQ=255) ccaGACAGGTGAGGTGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAACGCCACCACAAAAGGCAGCTGGGTCGTGGTATCGCCGCCACTCGCCGTTATCCCTTCGATAACCACCACTGCTTTGCGGCCGTGGCTACGCACTTAGTCCACACTCa > 2:19353/1‑159 (MQ=255) aGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCa < 2:193928/151‑1 (MQ=255) aCAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGa < 1:19353/159‑1 (MQ=255) cAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAACCAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTNCGGACATGGCTACGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGaca < 1:598270/275‑1 (MQ=255) aGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTc > 1:577427/1‑142 (MQ=255) ggcggagtgctcggTTGCGGTTGGTTTTCGATGACCGTAAACCGCCCCCACGCAACCGTCATCTGGGTCGTGGCTTCTCCGCCACTCACCGTTATCCCTGCGTTAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCCCTTCGTCCACGCTCAGGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCACGTTGCGGAGACCTGTTCAGGCAGCGATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACt < 2:643074/261‑1 (MQ=255) gTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTTGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGCCAACAACCTGCAACGCCGCATGCGGACACt > 1:435812/1‑274 (MQ=255) gTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACACAAGCGTTCCCAACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGACGccgtcctt > 2:90515/1‑267 (MQ=255) gagaTGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTcc < 2:577418/142‑1 (MQ=255) gaTGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGc < 1:90516/256‑1 (MQ=255) gcgcAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGTCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGgcacgc > 1:631666/1‑275 (MQ=255) gcAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGgcacgca < 1:346358/274‑1 (MQ=255) gATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTgc > 2:70083/1‑140 (MQ=255) gTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCa < 1:70084/140‑1 (MQ=255) tttttGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTgc > 1:674075/1‑135 (MQ=255) tgaacgCAGTAAAAAGCCCCACCCAAAACGGCAGCTTGGTCGTTGCTTCCCCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCa < 2:631657/269‑1 (MQ=255) tGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGACa < 2:674066/135‑1 (MQ=255) aGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACAcc > 1:105815/1‑155 (MQ=255) aGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCaa > 1:365395/1‑184 (MQ=255) gTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCtt < 2:105814/155‑1 (MQ=255) gTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACca < 2:365389/184‑1 (MQ=255) cgcCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTc > 2:436759/1‑148 (MQ=255) cgcCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTg > 2:184401/1‑219 (MQ=255) accacAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTcaggc < 1:436766/148‑1 (MQ=255) accacAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGc < 1:184404/219‑1 (MQ=255) aGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGa > 2:213505/1‑204 (MQ=255) gggTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCg < 1:213509/204‑1 (MQ=255) ggTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTc > 2:531364/1‑127 (MQ=255) gTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTcaggc < 1:531372/127‑1 (MQ=255) gCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGgca > 2:107280/1‑208 (MQ=255) cACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGgcacgca < 1:107281/208‑1 (MQ=255) aCCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATggcgatgttccggtacgcctga < 1:187803‑M2/72‑23 (MQ=255) ccACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATggcgatgttccggtacgcctgaacgc > 2:187800‑M2/1‑46 (MQ=255) cTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTc > 1:202727/1‑95 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATggcgatgttccggtacgcctgaacgcgtttcat < 1:108972‑M2/61‑34 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATggcgatgttccggtacgcctga < 1:617707‑M2/50‑23 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACcac > 2:589837/1‑123 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTc > 2:577883/1‑93 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCAcacca > 2:194016/1‑136 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTc > 2:119765/1‑146 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACACTCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCAACGTCCCATCGTCCACGGATTGTGACAGCTTTTGCAGCGCAGATGTCAGCCCTGCCAAAAAAGAGCCataa > 2:221497/1‑271 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTg > 2:301858/1‑164 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATACGGACACTGTGGCACGCACTCACCACAGTCATTGCAACGTCGCATCGTCCACGTATTGTGACAGTTTTTGCAGCGCAGAATACAGCCCACCAAAAACAGAGCCAgcgg > 1:7152/1‑272 (MQ=255) tCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCAACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCTGACAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGACGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCCCTCCCCACAGGCATTGCAACTTCCCATCGTCCACGGATTGTGTCAGGTTTTGCAGCGCAGATTGCAGCCCTGCAAAAACAGAGCCAgac > 1:432428/1‑274 (MQ=255) gATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTcaggc < 2:202723/95‑1 (MQ=255) tAAACAGCACTGCTTTGCGGACATggcgatgttccggtacgcctgaacgcgtttcatgccc > 2:108971‑M2/1‑24 (MQ=255) tAAACAGCACTGCTTTGCGGACATggcgatgttccggtacgcctgaacgc > 2:617698‑M2/1‑24 (MQ=255) tAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACTCTGCTCGCAAACCACAGCg < 1:589846/123‑1 (MQ=255) tAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTcaggc < 1:577892/93‑1 (MQ=255) tAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACttt < 1:194019/136‑1 (MQ=255) tAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTcaaca < 1:119766/146‑1 (MQ=255) tAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGc < 1:301864/164‑1 (MQ=255) aCTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACtgtg > 1:313155/1‑166 (MQ=255) gCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCTCGCTCATGGATTGCGCCAC‑GGTCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCAACGTCCCATCGTCCACGGATTGTGACAGTTTTTGCAGCGCAGATTGCAGCCCTGCAAAAACAGAGCCAGACGACTGCCTGGCCCGt < 1:263567/274‑1 (MQ=255) cTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGgcac < 2:313149/166‑1 (MQ=255) tGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCAACGTCCCATCGTCCACGGATTGTGACAGTTTTTGCAGCGCAGATTGCAGCCCTGCAAAAACAGAGCCAGACGACTGCCTGGCCCGTCAACg < 1:221502/275‑1 (MQ=255) | CGCTTAATCTGCTGATTATCGCGTCCGGTGAGTTGTTGATGACATTCGCTCCCCCACGCTTTGAGATCGAGCATTGCGCCGTCGCACACCGGGAGCAATTTTTCCCAGCCGGTTTCGCTCAACATGCCGTTACTGTCCACCAGACAGGTGAGATGGCGCAGTTGCGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCAT‑GGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCAACGTCCCATCGTCCACGGATTGTGACAGTTTTTGCAGCGCAGATTGCAGCCCTGCAAAAACAGAGCCAGACGACTGCCTGGCCCGTCAACG > CP009273/4604774‑4605313 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |