Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | CP009273 | 3798121 | 3798408 | 288 | 9 [7] | [8] 9 | waaS | lipopolysaccharide core biosynthesis protein |
TTAATCTCTCGGCTAACTCATTAATTATTTGAAGACGCCCTTTATCACGACCAAGGAAAAAACATATTGGCTGGCTGTTATTTTTGTCAGATAAACTATAATTTCTAATTTCATCCATTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCAAAATCATATATAATATCGAAATAATTCGCGTTATCAAGAATAAAATCTTCGCCAACAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATGACAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCTTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATTGAGGTAATGCTTGATGAATAATCGCC > CP009273/3797942‑3798319 | ttAATCTCTCGGCTAACTCATGAATTATATGAAGACGCCCTTTATCACGACCAAGGAAAAAACATATTGGCTGGCTGTTATTTTTGTCAGATAAACTATAATTTCTAATTTCATCCATTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCAAAATNATATAAAATATCGAAATAATTCGCGTTATCAAGAATAAAATCTTCGCCAACAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATAACAGTTAATAttt > 1:556596/1‑275 (MQ=255) gctggctgTTATTTTTGTCAGATAAACTATAATTTCTAATTTCATCCATTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCaaaa < 1:746845/113‑1 (MQ=255) gaatttaattacntCCTATAGAAANAAATTGTTCTATTGCCTTGATATTTTCATTCCCTATAAATCTATTCTCAAAATCATATATAATATCGAAATAATTCGCGTTATCAAGAATAAAATCTTCGCCAACAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATGACAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCTTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATTGAGGTAATGCTTGATGAATAATCGcc < 2:556591/260‑1 (MQ=255) aatttcATCCATTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCAAAATCatatat > 1:143795/1‑84 (MQ=255) aatttcATCCATTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCAAAATCATATATAATATCGAAATAATTCGCGTTATCAAGAATAAAATCTTCGCCAACAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATGACAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGAt > 1:747601/1‑189 (MQ=255) tcATCCATTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCAAAATCATATataata < 2:143795/84‑1 (MQ=255) tcATCCATTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCAAAATCATATATAATATCGAAATAATTCGCGTTATCAAGAATAAAATCTTCGCCAACAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATGACAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCt < 2:747593/189‑1 (MQ=255) aTTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCa < 1:372325/63‑1 (MQ=255) aTTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCa < 2:476464/63‑1 (MQ=255) | TTAATCTCTCGGCTAACTCATTAATTATTTGAAGACGCCCTTTATCACGACCAAGGAAAAAACATATTGGCTGGCTGTTATTTTTGTCAGATAAACTATAATTTCTAATTTCATCCATTCCTATAGGAAAAAATTGTTCTATTGCCTTGATCTTTTCATTCCCTATAAATCTATGCTCAAAATCATATATAATATCGAAATAATTCGCGTTATCAAGAATAAAATCTTCGCCAACAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATGACAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCTTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATTGAGGTAATGCTTGATGAATAATCGCC > CP009273/3797942‑3798319 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |