New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2877132 | 54 (1.350) | 4 (0.110) | 3/294 | NT | 8.1% | coding (366/1509 nt) | casA | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein |
? | CP009273 | = 2877239 | 39 (1.020) | coding (259/1509 nt) | casA | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein |
AGGTAGGTTGGTTTTCCGTATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCA > CP009273/2876867‑2877398 | aggtaggtTGGTTTTCCGTATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTAccc < 1:158439/273‑1 (MQ=255) gtaggtTGGTTTTCCGTATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCNCCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGAAAAATGCACAATTCGTCGCACCACTTAcccc > 1:616389/1‑272 (MQ=255) tttttGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTCAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGATTAACGCAATCGNAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACGCTGCCCCGGTTGATTGACACATGCACAATTCGTCGCGCCCCTTACCCCAGCCAACa > 1:667610/1‑242 (MQ=255) aggtgataaCATTGAGTACCCCCCTTGCACGCAGACCTATCCCCCGTACTACCGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAACCCGCTGTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCAGATTCGCCTGTTTTAATAACGCAATCGCAATGCATCCACCACATAATGCGTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGAACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTCGACACCTTTGGTCTGCATa < 2:636312/267‑1 (MQ=255) gAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGCTTTACAAATGCACCATTCGTCGCCCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCtt > 1:416143/1‑260 (MQ=255) aTTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACAACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAAAGCAATCGCAGTGCATCCACCACTTAATGCTTCACNCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGAACAATTCGTCGCGCAGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGAAACCTTTGGTCTGCATAAATGGATGtt > 1:676631/1‑275 (MQ=255) ttGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTCCGTGATTAAg > 1:18182/1‑274 (MQ=255) cGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGACGCTTACCCCAGCCAACAG‑TTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCt > 1:396991/1‑233 (MQ=255) tccgaacCAACGTACGAACATTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTCAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACatat < 2:18182/273‑1 (MQ=255) agaagagaccggTTTTCCTCCACCTAAACCGCTTTTAAAACCACCCCCCAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGAt < 2:719569/263‑1 (MQ=255) gttgttACAGTTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCAGTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAgg > 1:723761/1‑246 (MQ=255) gttgttACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAgg < 2:723747/246‑1 (MQ=255) gtTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACTCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGAtt > 1:587291/1‑230 (MQ=255) ttCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACCGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATCAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATACATATCAACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTc > 1:11425/1‑274 (MQ=255) ctccACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAgg < 2:587278/230‑1 (MQ=255) cGTAAACCGCGTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCAcggcg < 1:719583‑M2/247‑6 (MQ=255) gTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGTATCCATCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAgg < 1:648590/224‑1 (MQ=255) taccatctatcaaaaCCCCCCCCCACGCCCGGTGCCTGAGTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACTACCTAATGCTTCTCCCTGCCCCGGTTGATTGACAAGTGCACAATGCGTCGCGCCTCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAg < 2:11425/264‑1 (MQ=255) aaaaCCACCANCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGAt < 1:580580/194‑1 (MQ=255) accaccaAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCtt > 2:167447/1‑170 (MQ=255) ccaAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGt < 1:167449/170‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGtggatagatatgttctaccttaatcacgcagaacatccctttatgcagaccaaaggtgtcaaagcaaatgatgtgactccaatggaaaaactg > 2:605017‑M1/1‑106 (MQ=255) ggTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGtggatagatatgttctaccttaatcacgcagaacatccctttatgcagaccaaaggtgtcaaagcaaatgatgtgactccaatggaaaaactgttgg < 1:605030‑M1/199‑98 (MQ=255) gTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGtggatagatatgttctaccttaatcacgcagaacatccctttatgcagaccaaaggtgtcaaagcaaatgatgtgactccaatggaaaaactg > 2:211029‑M1/1‑101 (MQ=255) cTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCNATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGc < 1:614196/177‑1 (MQ=255) cTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGtggatagatatgttctaccttaatcacgcagaacatccctttatgcagaccaaaggtgtcaaagcaaatgatgtgactccaatggaaaaactgttgg < 1:211031‑M1/194‑98 (MQ=255) gCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGt > 1:684421/1‑108 (MQ=255) ggTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGttttt < 2:684407/108‑1 (MQ=255) tAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGtt > 1:132021/1‑155 (MQ=255) tAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCttt > 1:312102/1‑261 (MQ=255) gCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGc < 2:132020/155‑1 (MQ=255) acagccGCAGTGCACCCTCCACATAATGCTTCACCCTTCCCCGGTTTATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTGTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGcc < 2:312097/256‑1 (MQ=255) cAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCtt > 1:647149/1‑129 (MQ=255) tCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGATCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCtt > 2:96672/1‑252 (MQ=255) tCGCAGTGCACCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACa > 1:735926/1‑87 (MQ=255) tCGCAGAGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTAGTCGCGACGCTTACACCACCCAACAGTTTTTCCATAGGAGGCACATATTTTTCTTTGACACCTTTGATCTGCCTAAAGGGATGTTCTgag > 2:311324/1‑150 (MQ=255) cGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGt < 2:647135/129‑1 (MQ=255) aGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGttt < 2:735912/87‑1 (MQ=255) aGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGAt < 1:311329/152‑1 (MQ=255) aGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGc < 1:96673/252‑1 (MQ=255) ccacATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTgg > 1:228157/1‑115 (MQ=255) aTAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTg < 2:228155/115‑1 (MQ=255) cACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCg > 2:436547/1‑125 (MQ=255) cTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGAt < 1:436554/125‑1 (MQ=255) tGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACa > 1:724389/1‑55 (MQ=255) gCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTc > 1:425401/1‑274 (MQ=255) ccccGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCg > 1:87846/1‑118 (MQ=255) ccGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGttt < 2:724375/55‑1 (MQ=255) ggTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGAt < 2:87845/118‑1 (MQ=255) gTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACa > 1:522678/1‑48 (MQ=255) gTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAAtt > 2:660359/1‑230 (MQ=255) attgaCAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGttt < 2:522669/48‑1 (MQ=255) attgaCAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTCGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGcc < 1:660373/230‑1 (MQ=255) aCAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCNTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAAt > 1:681348/1‑230 (MQ=255) tcgtcgCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCNCGATGAGTTGTTAAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGc < 1:625030/275‑1 (MQ=255) gtcgCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATNTTCTGCGTNATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCa < 1:490535/275‑1 (MQ=255) gtcgCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGAtt > 2:115878/1‑95 (MQ=255) gtcgCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCttt > 1:129230/1‑191 (MQ=255) cgcgCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCg > 1:244841/1‑88 (MQ=255) cgccgcTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAgg < 1:115879/95‑1 (MQ=255) cgccgcTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGcc < 2:129229/191‑1 (MQ=255) cgcCGtggatagatatgttctaccttaatcacgcagaacatccctttatgcagaccaaaggtgtcaaagcaaatgatgtgactccaatggaaaaactgttggctggggtaagcggcgcgacgaattgtgcatttgtcaatcaaccggggcagggtgaagcattatgtggtggatgcactgcgattgcgttattcaaccaggcgaatcaggcaccaggttttggtggtggttttaaacgcggtttacg < 1:719583‑M1/247‑243 (MQ=255) ccgcTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGAt < 2:244838/88‑1 (MQ=255) | AGGTAGGTTGGTTTTCCGTATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCA > CP009273/2876867‑2877398 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |