| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009273 | 409554 = | 48 (1.200) | 5 (0.130) | 4/294 | NT | 10.3% | coding (1656/3147 nt) | sbcC | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | 409696 = | 42 (1.100) | coding (1514/3147 nt) | sbcC | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent | |||||
TTTGCTGTTGATACTGGATAATTTGCTGATTATGCGCGGCAATCTGCCCTTGTAATTCATGCCGTTGGCTGAGTAACCGCAGCTGGCGTTCGTGCTCATCTTGTGCATCCAGCCACGGTTGAATATCGTCCAGTGGCTGCAAGGTGATATTGAGGCTGGCCGTGACGGCTTGCCATTGTTGAGTAAGTGCTTGCTCATCTTGTCGGAGGCTTTGCGCTTCGTTTTCATCACGCTGAAGCTGCTTTGTTATGGCGTCCAGTTGCCCACGTAGCGTCGCACCTTCTTCACCGAGCTTTTTAACTTCGTTTTCCAGCGCCAGTAATCGAGACTGATTAACGCCAGGCTCCAGCGCCTGATACGCCTCGACCGCCGGGTGGCTGGTGGAACCACAAAGTGGGCAAGGCTGACCCGCCTGTAACTGTGCACGTTGAGCTTCCAGCGTTTTGATGCGCGCTTCCTGCTCGCAAATGGTTTTCACATCGGCAAGTTGCTGCGTCTTTTCTTTATAACGCTGGCGCATTTCGTTAAGTG > CP009273/409295‑409825 | ctgagcaacgcccactgcgtcagcacctggtcgcgctgcatggacagattgttccccaacaaaaacgtctggcgcagttacaggtcgctatccagaatgtcacgcaagaacagacgcaacgtaacgccgcacttaacgaaatgcgccagcgttataaagaaaagacgcagcaacttgccgatgtgaaaaccatttgcgagcaggaagcgcgcatcaaaacgctggaagctcaacgtgcacagttacaggcgggtcagccTTGc > 1:171816‑M1/260‑263 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |