New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2665812 | 40 (1.000) | 5 (0.130) | 4/292 | NT | 11.5% | coding (407/1203 nt) | hcaD | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
? | CP009273 | = 2665927 | 39 (1.030) | coding (522/1203 nt) | hcaD | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
CGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTCGCGAGGCCAACCTTGATACTGCCAATGGCATTGTCATTGATGAGGCTTGCC > CP009273/2665663‑2666195 | cgACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGGGGTTGAACTGGCGGCaa > 1:209820/1‑275 (MQ=255) ttAGGGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACNGGGAGAACGCTGCTTTACCGTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGCTTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCg < 1:556613/275‑1 (MQ=255) gCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGCCCGCGTCCGTTGCTTGATGCACGTGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTTGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGccc < 1:226144/275‑1 (MQ=255) ggCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAAcc > 1:339321/1‑205 (MQ=255) gCTCGACCGCTTCCGTTGCTTGATGCCCTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGANAAGTTCTGNAGCCCGAACGGTTAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACTGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCa < 1:488761/274‑1 (MQ=255) ccGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTTCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCTCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTNAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTAGTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCTCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCaataa < 1:569816/275‑1 (MQ=255) aCTGGGAGAAGGCTGCTTTATCCGCCGCCGTGCCGGGTATGCCGGCAGAGTGCGAGAATTTCTGCAGACCGAACGGTCAGTNTTGATTATNGGTGCCGGAACTATTGGTCGGGAACTGGCGGCCAGCGACACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGTTGTGCGCCTTCTGCTCAATAATGCCATTGAACAt < 1:476033/274‑1 (MQ=255) gctgctTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTgg < 1:398719/229‑1 (MQ=255) ctgctTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCTAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTg < 1:259888/241‑1 (MQ=255) gtataagagacaggCCATGACGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTTTCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACCTGGGGTCGATGGTg > 1:582425/14‑274 (MQ=255) tttACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTgcg > 1:80406/1‑230 (MQ=255) tACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCg > 1:202894/1‑163 (MQ=255) tACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGGGTGAGCCTTCTGACCAATAATGACATTGCACATGTGGTCGATGGTNTAAAAgaggaa > 2:63689/1‑270 (MQ=255) cGCCATGCCGTTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTCGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTAAAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAAAATGTGGTAGATGGTGAAAAAGTAAAACt > 1:732740/1‑275 (MQ=255) ccATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGa < 1:63690/275‑1 (MQ=255) tGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATgg > 1:76409/1‑152 (MQ=255) ggTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCTACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCg < 2:76408/152‑1 (MQ=255) cGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCAt > 1:235739/1‑197 (MQ=255) aaGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTg < 2:235737/197‑1 (MQ=255) gTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAActggcggcatcaccggcatggcgtagggtaaagcagcgttctcccagtgcatcaagcaacggcagcggtcgagctgccgcgccggttgctataaaaa < 1:40084‑M2/202‑98 (MQ=255) gTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAActggcggcatcaccggcatggcgtagggtaaagcagcgttctcccagtgcatcaagca < 1:91974‑M2/163‑59 (MQ=255) tGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAActggcggcatcaccggcatggcgtagggtaaagcagcgttctcccagtgcatcaagcaacggcagcggtcgagctgccgcgccggttgctataaaaagctg > 2:40083‑M2/1‑101 (MQ=255) tGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAActggcggcatcaccggcatggcgtagggtaaagcagcgttctcccagtgcatcaagcaacgg > 2:91973‑M2/1‑101 (MQ=255) tGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCCCATTCTGCGCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGCAAAAGTAGAACAGACGCTGCAAAATGGGGAAACGAGTCAGGCAGAtgtg > 2:654826/1‑275 (MQ=255) gaactgcAGTGGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGTTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGTTGTAATGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATTGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTGACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTa < 2:732726/268‑1 (MQ=255) aaCGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTCTACAGCGCCACNAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGAGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTAc > 1:668045/1‑275 (MQ=255) gTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGt < 1:458643/274‑1 (MQ=255) gTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTa < 1:132530/275‑1 (MQ=255) cAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCAt > 2:334855/1‑172 (MQ=255) cGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTg < 1:334861/172‑1 (MQ=255) aTTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGc > 1:336688/1‑121 (MQ=255) aTTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGAGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGACATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCCGGCAGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCAATTGAACATGTGGTCGATGGGGAAAAAGTAGAACTGCAGCTGCAAAGGNTGGAAACGCTGGAGGGTGATATTATGATTAACTCTAttttaattt > 2:458636/1‑267 (MQ=255) tCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACg < 2:336682/121‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTgg > 1:300736/1‑206 (MQ=255) aaCTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGaa < 2:300731/206‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAActggcggcaaccgtcatggcgtagggtaaagcagcgttctcccagtgcatcaagcaacggcagcggtcgagctgccgcgccggttgctataaaaagctgatcccagtgccagctttcgccgttggttaacactaactctcgtgtgtcgcgacccagcgttttgatggttacaccggaatgca > 1:138555‑M2/1‑45 (MQ=255) gCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCGACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAAc > 2:323709/1‑203 (MQ=255) ccAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCGACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCtt < 1:323715/203‑1 (MQ=255) cagATGCAAGGTGACAGTGATTGAACTGCCGGCAACCGTCATGGTCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGt > 1:539064/1‑141 (MQ=255) tGTAAGGTGACAGTGACTGAACGGGCGGCAACCGTCATGGGCCATAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGGGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGAt < 2:539054/141‑1 (MQ=255) aGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGACCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACcag > 2:122223/1‑86 (MQ=255) gACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAgg < 1:122224/86‑1 (MQ=255) aCAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGccac > 1:565951/1‑78 (MQ=255) aCAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCTCCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTCGCGAGGCCAACCTTGATACTTCCAATGGCAANGTACTTAATGAgtc > 2:537218/1‑273 (MQ=255) tGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACcagc < 2:565938/78‑1 (MQ=255) aTTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTCGCGGGGCCAACCTTGATACTGCCAATGGCATTGTCATTGATGAGGCTTGcc > 1:242240/1‑274 (MQ=255) | CGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCCACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTCGCGAGGCCAACCTTGATACTGCCAATGGCATTGTCATTGATGAGGCTTGCC > CP009273/2665663‑2666195 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |