| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 731,010 | C→A | 7.0% | pseudogene (1422/1521 nt) | rhsO → | pseudogene, Rhs family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 731,010 | 0 | C | A | 7.0% | 281.9 / 3.7 | 84 | pseudogene (1422/1521 nt) | rhsO | pseudogene, Rhs family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/35); new base A (2/5); total (44/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.50e-01 | |||||||||||
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GCCATATCCTATTGACCAGGCCAGTAGTGCGCCTAATGTTTTCAAAACATTCTTCAGAGCATTAAGCCCTTACGACTACACACTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGCCAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTAAGATGAAACAGAGAACATCGAGAGGAATAAGAAAATGAAAAGAGTTTTGTTCTTTTTGCTGATGATATTTGTTAGTTTTGGTGTTATAGCTGATTGCGAAATACAAGCTAAAGATCATGATTGTTTTACTATTTTCGCTAAGGGTACTATTTTTTCCGCGTTTCCTGTCTTAAATAATAAAGCCATGTGGAGATG > CP009273/730758‑731266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |