| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 733,570 | A→G | 5.5% | E8G (GAA→GGA) | ybfD → | H repeat‑associated putative transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 733,570 | 0 | A | G | 5.5% | 213.1 / 3.1 | 73 | E8G (GAA→GGA) | ybfD | H repeat‑associated putative transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/33); new base G (2/2); total (38/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
CTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCTGTCCTGCGAAATTTCATGAGAGCTTTA > CP009273/733299‑733818 | cgaTTAATACATTAACGAAGGTTCAGGTATTAAATTCCCGGTTAAGACGTAATATGCGGTAAGCGGTCTTGGATAGAAACTATCTCGAGTGAGTCCTTGCAGGGACCGCGCTTTCGTACTCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAAGTCGCATTTTATGTGTAAAAATTGAGATATTCCTAATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACCTGATCAAATACGTCGTACATAATTAAGGAGAACAACATGGAACTTAAAAAATGGATCGac < 2:245445/271‑2 (MQ=18) ttAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAATTAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATAGAAAATTTTTttatta > 2:573926/1‑275 (MQ=255) ttCAAGGCAGAGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAGTTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACGTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACaa > 1:722802/1‑274 (MQ=255) aaGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTNAATAATTCGCATTTTATGTGTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATaaa < 1:573939/274‑1 (MQ=255) tcGAATAGCAGTCATGGTTTGAATCTATCTCGCGTCTGTTCTGGCGGGGATCTGTCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTTNACTAAATANTTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGATAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATAACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATc < 1:497671/273‑1 (MQ=17) cGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAGTTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCgg < 2:722788/275‑1 (MQ=255) cGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTGTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTACATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTAACCACGATTACAGACAACAATGGAAAGTGGAACAAAAATTATCgg > 2:674691/1‑275 (MQ=255) aaGCAGCCATTGATATAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGTGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGANATTCCTTATTAGCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATTATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGa < 1:674705/272‑1 (MQ=255) gcCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTCTTGCTTATACATGATCTACTACTTCTTACATAATTCAGTAGTACAAACTGGAACTTCACAACTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAGGTGGACCATAAATTCTCGGCTATTCTAc > 2:678472/1‑275 (MQ=18) gATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATACAATACTTCTTNCATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGa > 1:679849/1‑275 (MQ=255) aGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 1:210555/274‑1 (MQ=255) gggCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGa < 1:687634/165‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAAAATAAATTATCGGATATTCTACTg > 1:432074/1‑228 (MQ=255) tatttGCTTTGTGTACTAAATAATTCTTATTTTTTGTTTAAAAATTTAGTTTTTCCTTATTACCTGAATGTGTTTTTTATTGATTATACATGATCAAATTCTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGAttt < 2:619110/271‑1 (MQ=11) tCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTCACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAACCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGTATAATCTACTGTTGACTATTTGTGCAGTTATTTCTGTTTCAGAAGGTGGGGAAGATATAGAGGAttt > 2:322798/1‑275 (MQ=255) atatTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTAGTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGa > 1:413778/1‑202 (MQ=21) tCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTa > 2:536735/1‑120 (MQ=35) tCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 2:413771/202‑1 (MQ=35) tattaCCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGa < 1:536745/120‑1 (MQ=35) ccTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTa > 2:641371/1‑111 (MQ=35) gAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATcccc > 1:607615/1‑103 (MQ=35) aaGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGa < 1:641385/111‑1 (MQ=35) cTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGAtt < 2:607602/103‑1 (MQ=35) ttttttATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCATAAGGCTGGGAAGa > 1:401445/1‑191 (MQ=14) ttATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGAtata < 2:401438/191‑1 (MQ=14) tATTGCTTATACATTATCAAATACTTCTCACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCa < 1:322804/275‑1 (MQ=25) cATGATCAAAGACTTCTGACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTANCGGATATTCTAGTGTTGACTATGTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATcc < 1:678486/275‑1 (MQ=255) aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGa > 1:697698/1‑102 (MQ=40) aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGa > 2:325552/1‑117 (MQ=39) aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTTTa > 1:594441/1‑275 (MQ=25) aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACAt < 2:697684/102‑1 (MQ=40) aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATAtt < 1:325558/117‑1 (MQ=39) ttcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGaa < 2:188977/49‑1 (MQ=40) ttcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAgg > 1:394645/1‑170 (MQ=37) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTAt > 1:14561/1‑102 (MQ=35) tACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTAc > 2:674651/1‑112 (MQ=35) tACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCACCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGAttt < 2:394638/170‑1 (MQ=25) cATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGa < 2:14561/102‑1 (MQ=35) tAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGtt < 1:674665/112‑1 (MQ=32) aaTTAAGGAGAACAAACTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACt > 1:47406/1‑115 (MQ=17) aaTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTAc > 2:564498/1‑107 (MQ=17) aaTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTAc > 2:640961/1‑107 (MQ=17) aTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCTGTCCTGCGAAAttttt > 2:618895/1‑273 (MQ=25) aaGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGtt < 1:640975/107‑1 (MQ=17) 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ggAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCTGTCCTGCGAAATTTCATgaga < 1:618908/275‑1 (MQ=38) gaACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAata < 2:563272/189‑1 (MQ=35) accAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATCAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGCTGTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCATGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCTGTGCTTGTAAATTTTCTgagatgtg > 2:176629/3‑271 (MQ=11) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAAt > 2:366684/1‑82 (MQ=33) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTAt > 2:352184/1‑85 (MQ=33) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTAt > 1:398125/1‑85 (MQ=33) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTAt > 2:454613/1‑85 (MQ=33) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCg > 2:157020/1‑87 (MQ=33) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGatat > 1:189410/1‑92 (MQ=33) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCTGTCCTGCGAAATTTCATGAGAGc > 1:71420/1‑273 (MQ=38) cAAAATGGAACTTAAGAAATTGATAGAAGATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAAt > 1:510184/1‑80 (MQ=11) cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTAt > 1:188074/1‑83 (MQ=33) cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtg > 2:575465/1‑108 (MQ=32) cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGa > 2:289928/1‑129 (MQ=32) cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATAGTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCACGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTACTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTTTATCTTTCCTGCGAAATTGCATTAAAACtttt > 2:586019/1‑274 (MQ=11) aaaTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATc < 1:366691/82‑1 (MQ=33) aaaTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGata < 1:157022/87‑1 (MQ=33) aaaTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGa < 1:454620/85‑1 (MQ=33) aaaTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGa < 1:352190/85‑1 (MQ=33) aaaTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGa < 2:398118/85‑1 (MQ=33) aaaTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTa < 2:189408/92‑1 (MQ=33) aaTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCag > 1:40068/1‑228 (MQ=34) aTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATc < 2:510175/80‑1 (MQ=34) aTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGa < 2:188072/83‑1 (MQ=33) aTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGcc < 1:575478/108‑1 (MQ=32) aTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 1:289933/129‑1 (MQ=33) aaaaaTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCAtt > 1:332729/1‑212 (MQ=34) aTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCa < 2:332723/212‑1 (MQ=34) | CTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCTGTCCTGCGAAATTTCATGAGAGCTTTA > CP009273/733299‑733818 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |