New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 454255 | 2 (0.070) | 26 (0.990) | 24/218 | NT | 93.1% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | CP009273 | = 604803 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
GCCGCACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAG > CP009273/454013‑454508 | gCCGCACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctg < 1:407504‑M1/274‑32 (MQ=255) tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTAATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAACCCGTTGCTGCTTTATGGCAAGCCGGACGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAACGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTATATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCActaagcgctacattaaggggttaaccatctgaagaatgcgacgcctacgtg > 2:35852‑M1/1‑224 (MQ=255) tgaaggtacaggtccatgtaagcCGTCTAAAAAGTGTTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGATGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTGTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgc < 1:655998‑M1/263‑53 (MQ=255) aCGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTAAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGAAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTGCCATACAATACGTTAACAAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTAACTTTTTCCTATATTCTCGGCGTTGAATGGGGGGGAAACATCCCatacgcgctaacttaagggttgaaacatcagaagaatgcgacgcctcggtggcgcgttaagaccttatctttat > 2:655987‑M1/1‑200 (MQ=255) aGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataag > 1:85226‑M1/1‑176 (MQ=255) ggTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgct < 2:85226‑M1/181‑10 (MQ=255) ttGATGGTCAAATCAAATCTTTGCTGATTTATGGTAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGCTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCGCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata < 1:45557‑M1/275‑109 (MQ=255) tGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgac > 1:244662‑M1/1‑109 (MQ=255) 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1:570000‑M1/1‑73 (MQ=255) aaaaaGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatac > 2:159440‑M1/1‑71 (MQ=255) aaaGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgc < 2:569989‑M1/121‑53 (MQ=255) aGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtc < 1:159443‑M1/180‑114 (MQ=255) gggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttc > 1:97709‑M1/1‑63 (MQ=255) ttttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttca < 2:97709‑M1/140‑82 (MQ=255) ttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTTTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaaggg > 1:486575‑M1/1‑57 (MQ=255) aTCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGCCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCata > 2:175332‑M1/1‑55 (MQ=255) ctcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttga < 2:486567‑M1/76‑24 (MQ=255) ccccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcg < 1:175336‑M1/58‑8 (MQ=255) tttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcg > 1:28821‑M1/1‑40 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGAGTTGAATGTGGGTTAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctg > 1:470287‑M1/1‑39 (MQ=255) ctctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgc < 2:28821‑M1/88‑53 (MQ=255) tctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcag < 2:470280‑M1/138‑104 (MQ=255) agtgcttatggggTAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTCATAGTTGGCGTTTAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTCTTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATTCGTTGTTTGGa > 1:189325/10‑232 (MQ=255) agcgcttatggggAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGACGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCag > 1:199949/10‑275 (MQ=255) tGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatgg > 1:119036‑M1/1‑21 (MQ=255) tgtgGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccac < 2:119035‑M1/144‑128 (MQ=255) tCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctctgtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccac > 1:386622‑M1/1‑4 (MQ=255) tCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcaggggtactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctcc > 1:130151‑M1/1‑4 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttc < 1:440138‑M1/79‑78 (MQ=255) | GCCGCACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAG > CP009273/454013‑454508 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |