Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | CP009273 | 567,750 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+43/‑70) | ybcM → / → ylcH | DLP12 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator/uncharacterized protein, DLP12 prophage |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 567750 = | 0 (0.000) | 116 (1.210) | 62/234 | 0.2 | 100% | noncoding (974/1258 nt) | IS3 | repeat region |
? | CP009273 | = 1463497 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
* | ? | CP009273 | = 567754 | 0 (0.000) | 161 (1.680) | 70/234 | 0.1 | 100% | noncoding (978/1258 nt) | IS3 | repeat region |
? | CP009273 | 1462167 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/567621‑567754 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > CP009273/1462167‑1462304 ATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATT < 1:5046468/139‑1 ATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATT < 1:3650265/139‑1 TAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGGAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTT < 1:2981177/139‑1 TCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCT > 1:3175455/1‑139 TCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCT > 1:4268633/1‑139 CCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCT < 1:4035721/138‑1 TCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATAT > 1:4961585/1‑139 CGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTC < 1:1046419/139‑1 GTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATT > 1:1773058/1‑124 TTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:1001322/138‑1 TTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGAAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:1953027/138‑1 TTTACTGAAAGAGTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGAGAAGAAAAGCATCCAGAGAGTAAAAGTCTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTCATTTTTGGAAATTTGAGTTGCCCCTATATTTCCA < 1:4186536/138‑1 TTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 1:4706277/139‑1 TACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGAT‑AGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA < 1:2977279/139‑1 ACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA < 1:4098085/139‑1 ACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA < 1:1988095/139‑1 CTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 1:2382549/139‑1 AATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAA < 1:2140390/139‑1 AATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAA < 1:426485/139‑1 TTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCAAT > 1:2570140/1‑139 TTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATT < 1:599186/99‑1 TTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:4517323/1‑139 TTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:2073596/114‑1 TTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCC < 1:1033556/104‑1 AATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATT < 1:2435809/95‑1 TATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATT < 1:2427795/93‑1 TAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 1:2732900/139‑1 AACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCC > 1:188215/1‑139 ACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG < 1:2771082/139‑1 ACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCC > 1:2620106/1‑138 ACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATA > 1:3181481/1‑99 CACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCC > 1:3289475/1‑137 CACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA > 1:3615254/1‑104 ACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 1:3364614/108‑1 ACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:1709204/103‑1 CAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 1:1277981/1‑138 CAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATA > 1:5014760/1‑95 AAGAGAGATAAGAAAAGCGTCGAGAGAGTAAAAGAGTGTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTGGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:4436256/1‑120 AGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCC > 1:2309694/1‑138 AGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:848999/1‑101 AGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTT > 1:5142932/1‑96 AGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGAGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCC > 1:4615862/1‑138 AGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGAAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATA > 1:5006763/1‑93 GAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCTATTACAAGCCCGCTGCCGC < 1:3657302/137‑1 GAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGC < 1:4888857/137‑1 GAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGC < 1:1850524/137‑1 AGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 1:4905713/100‑1 GATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA < 1:611092/138‑1 GATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATAT < 1:3625927/89‑1 ATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 1:3980879/1‑139 ATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 1:3193366/1‑139 ATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGC < 1:1952432/131‑1 ATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC > 1:782587/1‑108 ATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT > 1:4289614/1‑103 ATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTGGCCCCTATATTTCCATACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 1:4301965/1‑139 ATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGATTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 1:4848416/1‑139 gcaTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGC < 1:4395713/119‑1 GCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 1:550481/100‑1 GCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 1:3768859/100‑1 GCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATT < 1:2578290/68‑1 CTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 1:4701337/1‑139 TTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG < 1:1448903/139‑1 TTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG < 1:1688179/139‑1 TTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG < 1:4663861/139‑1 TTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 1:485117/137‑1 TTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTGGGGAAATTGGATTTGCGCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCAGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC < 1:345035/138‑1 TCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA > 1:2857339/1‑125 TCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA > 1:3581439/1‑81 AGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCC < 1:256558/115‑1 AGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:1187393/1‑100 AGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:3132843/1‑100 AGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:3860855/74‑1 AGTAAAAGTGGTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATA > 1:5157008/1‑68 TAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC > 1:3496169/1‑138 TAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC > 1:2084204/1‑138 AAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCA < 1:3188453/139‑1 AAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCA < 1:716804/139‑1 TGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGC > 1:1106810/1‑139 TTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGC > 1:4092814/1‑137 TTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT > 1:1279545/1‑74 AAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA < 1:2508271/101‑1 AGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTGCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCG < 1:2957723/137‑1 GAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGAT > 1:3182795/1‑138 GAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGAT > 1:2863855/1‑138 GAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC > 1:3817596/1‑85 GAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT > 1:3393883/1‑61 AGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGC < 1:596605/40‑1 AATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCGCTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC < 1:2349748/137‑1 TCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTG > 1:5087114/1‑101 TTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCA < 1:2221156/113‑1 TTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAAT > 1:4045714/1‑137 TTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAA < 1:1094325/139‑1 TGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC < 1:1079755/139‑1 GGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGAT > 1:4800537/1‑113 GGGAAATTGGATTTGCACCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAATTAACCCATTACAAGCACGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACG > 1:1654860/1‑137 tctagTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTCCAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCCCTACGCGGATGCCATT < 1:4543305/113‑1 ATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC < 1:1617003/139‑1 TTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCGCTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA < 1:2301058/139‑1 TTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA < 1:3065898/139‑1 TTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA < 1:2058901/139‑1 TATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/567621‑567754 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > CP009273/1462167‑1462304 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |