| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 923 = | 373 (0.010) | 142 (0.010) +TTAGCCTTTAATTGTCAATAGGTCTCGAG |
33/172 | 1.5 | 7.7% | intergenic (‑131/‑88) | aadA/fdh | aminoglycoside adenylyltransferase (Murphy, 1985)/formate dehydrogenase from Pseudomonas sp. 101 with an N‑terminal his‑tag |
| ? | KX077536 | 1006 = | 4187 (1.270) | intergenic (–/‑93) | –/unknown | –/BLA | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1377 total aligned reads displayed.
ATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATCACCATCACCACGCTAAAGTTCTGTGCGTTCTGTACGACGAC > Exported/791‑1061 | accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagccgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCa < 1:362103‑M2/31‑1 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagcactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCa < 1:1760126‑M2/31‑1 (MQ=255) cactcatactcttcctttttcaatattatggaagcatttatcagggatattgtctcatgagcgtatacatatttgaatgtatttagaaaaataatcatatcacgagacctattgacaattaaaggctaaAATTCcacac < 1:3812310‑M1/10‑3 (MQ=255) ccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaacaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTca > 1:3339676‑M2/105‑139 (MQ=255) ccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTca < 1:1091163‑M2/35‑1 (MQ=255) cccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTcag < 1:758456‑M2/36‑1 (MQ=255) ccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTcagc < 1:2506694‑M2/37‑1 (MQ=255) cgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAAtt > 1:87799‑M2/102‑129 (MQ=255) cgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTcagca > 1:2476160‑M2/102‑139 (MQ=255) agctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACt > 1:260163‑M2/95‑127 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaacccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGc > 1:666554‑M2/93‑136 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGa < 1:1641719‑M2/49‑1 (MQ=255) tttcaatattattgaagcatttaacagggttattgtctcatgagcggatacatatttgaatgtatttagaaaaataaacaaacctcgagacctattgacaattaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGACGCactgccc > 1:3830457‑M1/113‑136 (MQ=255) tcaatattatttaagcatttatcaaggttattgtctcatgagcggatacatatttgaatgtctttagaaaaataaacaaatctcgagacctattgaaaattaaaggctaaAATTCCACTCATCATGacgcacttcccga > 1:1904608‑M1/111‑133 (MQ=255) ttGAAGCATTTATCAGGGGTATTGTCTCATGAGCGGATACATTTTTGAATGTATTTAGAAAAATAACCAAATCTCGAGACCTATTGACCATTAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCACTCAGCAGCACGCACTGACCGAATTCACTAg > 1:2661607/1‑139 (MQ=18) ggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGaa > 1:724753‑M2/86‑139 (MQ=255) gggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTc > 1:3116612‑M2/83‑139 (MQ=255) attatagaagcatttatcagggttattgtctcatgagcggatacatattggaatgtatttagaaaaataaacaaatctcgagaccgattgacaattaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCgaatcca > 1:1422168‑M1/106‑136 (MQ=255) aGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCAGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATCAACAAATACCGAATCCTAATGCCAATCAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑AT‑‑TTCCCCTCAGCAGGACGCACTGCCCGAATTCACTAGATa < 1:3787789/138‑1 (MQ=9) gacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCa < 1:2923664‑M2/58‑1 (MQ=255) aTTTATCCGGGTTATTTTCTCCTGAGCGGATACATATTTGAATTTACTTAGAAAAATAAACCAATCTCGAGACCTATTGACAATTTAAGGCTAAAA‑GC‑‑‑‑‑‑‑CCCCTTAGCAGGACGCACTGACCGAATCCACGAGTTAAt < 1:4077399/137‑1 (MQ=12) ttgaagcatttatcagggttattgtctcatgagcggatacatatttgaatgtatttagaaaaataaacaaatctcgagacctattgacaattaaaggctaaAATTCCACACAGCAGGACGCACTGACCGAATtcacaag < 1:3862018‑M1/38‑4 (MQ=255) gctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGa > 1:515220‑M2/77‑117 (MQ=255) gctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGt > 1:1002742‑M2/77‑139 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGa < 1:2572146‑M2/53‑1 (MQ=255) aacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCa > 1:279993‑M2/68‑98 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAAtt > 1:4001372‑M2/63‑90 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAAtt < 1:1854850‑M2/77‑1 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAAtt < 1:1049583‑M2/77‑1 (MQ=255) cactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAAtt < 1:4095354‑M2/77‑1 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCa > 1:1241275‑M2/58‑102 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGtt < 1:224468‑M2/82‑1 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGtt < 1:792403‑M2/82‑1 (MQ=255) aGCGGATACATATTTGACTGTATTTAGAAAAATCCACAAATCTCGAGCCCTATTGACACTTAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCTACTCAGCAGCACGCACTGACCGCATTCACTAGTTAATATCAATAATTTTGtt > 1:3655388/1‑128 (MQ=19) gggATACATAGTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATAGCGAGACCTATTGACAATTAAAGGCTAAAA‑G‑‑‑TA‑‑‑‑CACTCAGAAGGGCGCACGGACCGAATTCAGGAGTTAATAGAAATAAGTTGGTTTAGCTTTAAACa < 1:2421444/137‑1 (MQ=16) tcatgagcggatacctatttgaatgtatttagaaaaataaacaaatctcgagacctattgacaattaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGCCGCACTGACCGAATTCACTAgttacta < 1:2756282‑M1/44‑4 (MQ=255) gATCCATATTTGAATGTATTTGGAACAATAAACAAATCTCGGGACCTATTGACAATTAAAG‑‑‑‑‑‑‑T‑CTATAATTACACTCAGCAGGACGCACTGCCCGAATTCACTAGTTAATAGTAGTAATTTTGTTTAACTTTAAACcaaa > 1:3028605/1‑139 (MQ=16) ttccttttttAATTTAATTAAAAAAAAAAACAAATCTCGAGACCTTTTTTCAATTAAAAGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCCCTCAGCCGGACGCACTTTCCCAATTCCCTATTTTATATAAATAATTTTTTTTAACTTTAAACAACATg < 1:939296/133‑1 (MQ=255) cctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTaa > 1:2879870‑M2/49‑139 (MQ=255) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATa > 1:3292390‑M2/46‑113 (MQ=255) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACa > 1:1205892‑M2/46‑139 (MQ=255) atatTTTAATGTATTTAAAAAAATAAACAAATCTCCAGCCCTAATGACAATTAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCTCTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGGTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTCAACAAAATtagg < 1:4043675/139‑1 (MQ=18) atatTTGACTGTATTTAGAAAAATCAACAAATCTCGTGCCCTATTGACAATTAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCACATAACAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATATAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATgatg < 1:3320395/139‑3 (MQ=18) atatGTGAAAGGAGTTAGAAAAAAAAAAAAAACTCGAGACCTATTGACAAATAAAGGCGAAAAGG‑‑‑‑‑A‑‑‑CACTCAGCAGGACGCAATGACCGAACTCACGAGGTAAAAGAAAAAAGGTTGGGTAACCTTAAACAAAATgagg < 1:487038/139‑1 (MQ=255) tatTTGACTGTATTTAGAAAAATAAACCAACCTCGACACCTATTGACAATCAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCCCTCAGCAGGTCGCTCTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAACTACCTTGGTTCACCTTTAAACAAAAtt < 1:4341076/135‑2 (MQ=12) gAAGGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCGAATGACAATTAAAGTGTAAA‑‑‑‑‑‑‑AATT‑AGCTCAGCAGGACACACTGACCAAATTCACTAGTTAATAGAAATATTTTGGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTat > 1:4025315/1‑138 (MQ=12) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATga > 1:4268521‑M2/40‑139 (MQ=255) acatatttgaatgtatttagaaaaataaacaaatctcgagacctattgccaattaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGCCGCCCTGCCCGAATTCACTATTTAATAGAAAAAATTTTGtttacct < 1:1464208‑M1/63‑4 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatccccGACAATTAAAGGGTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTTACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATgagg < 1:21082‑M2/102‑1 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATgagg > 1:1382799‑M2/38‑139 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATgagg < 1:1724901‑M2/102‑1 (MQ=255) aTGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGCCCTATTGACAATTAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCCCTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCa < 1:3554256/87‑1 (MQ=21) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGa > 1:1686032‑M2/37‑77 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCa < 1:556921‑M2/31‑1 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTaaa > 1:1139854‑M2/35‑126 (MQ=255) tATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGATGCCTATTTACAATTAAAGTCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCACTTATCAGGTCGCACTGACCAAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTCTTTAACTTTAAACAAAATGACGAGGTACTtaga < 1:3250567/139‑1 (MQ=16) catacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGAcc < 1:1556712‑M2/51‑1 (MQ=255) aTTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGGCCTATTGACAATTAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCAACTCAGCAGGACGGACTGACCGAATTCACTAGTTAATa > 1:3572687/1‑93 (MQ=16) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACt < 1:2280‑M2/87‑1 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTa < 1:2202100‑M2/107‑1 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATgagg < 1:2033724‑M2/102‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCa < 1:3458556‑M2/31‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAgg < 1:4124348‑M2/40‑1 (MQ=255) tatttagaaaaataaacaaatctcgagacctattgacaattaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGaacttag < 1:1985750‑M1/88‑4 (MQ=255) taaatcagtaaattggcagcatcaccGACAATTTAAGGCCAAAATGCTATAAATCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTaaa < 1:1810459‑M2/92‑1 (MQ=255) aaaaTAAACAAATCTCGATACCTATTGACAATTAAAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCCCTCAGCAGGACCCACTGACCGAATTCACTATTTAATAGAAATAATTTTGTTCAACTTTAAACAAAATGAAGAGGTACTGAGATGcatcat < 1:4300064/139‑1 (MQ=21) aaatcagtaagttggcagcctcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGAt < 1:3916208‑M2/114‑1 (MQ=255) aatcagtaagttggcatcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCTCTCAGCAGGACGCACTGAACGAGTTCACTAGTTAATCGTCATAATTTTGGTTAACTTTACACAACATGAGGAGGTACTGatat > 1:3499049‑M2/25‑138 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCa > 1:842575‑M2/25‑55 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGa > 1:3706985‑M2/25‑65 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGAt > 1:3593474‑M2/25‑138 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATg < 1:3753635‑M2/115‑1 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATg < 1:3428053‑M2/115‑1 (MQ=255) aatcagtaagtaggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGtt > 1:4319889‑M2/25‑88 (MQ=255) atcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAAt > 1:3967916‑M2/24‑78 (MQ=255) atcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTa > 1:3727474‑M2/24‑84 (MQ=255) tcagtaagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCa < 1:1514915‑M2/58‑1 (MQ=255) tacaCAAATCTCGATACCTATTGACAATTACAGGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCTCCCAGCAGGACGCACTGACCGACTTCCCTAGTTAATAGAAATTATTTTGTTTCCCTTTAAACAAAATGAGGAGTTa > 1:4196757/4‑121 (MQ=9) taagttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGa > 1:1287252‑M2/19‑59 (MQ=255) aaaataaacaaatctcgagacctattgacaattaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGatgcataat > 1:3155805‑M1/43‑136 (MQ=255) agttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACa < 1:2181235‑M2/94‑1 (MQ=255) ttggcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCa < 1:2368448‑M2/58‑1 (MQ=255) gcagcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGcatc < 1:4231747‑M2/119‑1 (MQ=255) agcatcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATa > 1:1592311‑M2/10‑77 (MQ=255) atcaccGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATcatcaccatcac < 1:2069024‑M2/130‑1 (MQ=255) aaTTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATgagg < 1:416583/99‑1 (MQ=255) ctattacaattaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAAtt > 1:3204992‑M1/21‑73 (MQ=255) ttAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCAtcaccatcacca < 1:1331396/127‑1 (MQ=255) attgacaattaaaggcgaaAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATagaaatactt < 1:3894528‑M1/53‑4 (MQ=255) caattaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTTATTAACGTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATCACCATCACCACGCTAAAGttctgttcg > 1:2708433‑M1/15‑136 (MQ=255) aattaaaGGCTAAAATTCCACTGAGCAGGACGCAAAGACCGAATTCCCTAGTTAATAGAAATAATTTTTTTAAACTTTAACAAAAATGAGGAGGAGCTGAGATGCATCATCACCATCACCAGACAAAAGTTCTGTCCGt > 1:232035/5‑139 (MQ=21) ttaaaggctaaAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTCAACAAAATGAGGAGGTACTGAGAtgcctcatcaccatcaccccgtta < 1:3846814‑M1/113‑7 (MQ=255) tAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATgag > 1:2144209/1‑88 (MQ=255) tAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATCACCATCACCACGCTAAAGTTCTGTGCGt > 1:600384/1‑137 (MQ=255) aaggctaaAATTCCACTCAGCAGGACGCGCTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGtacttag < 1:2952115‑M1/88‑4 (MQ=255) aaTGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACt > 1:353042/1‑93 (MQ=255) cTAAAATTCCACTCAGCAGGACGCGCTGACCGCATTCAATGGTTAATAGAAATAATTTTGtt < 1:3390318/62‑1 (MQ=17) tataATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATg < 1:2983339/78‑1 (MQ=255) tataATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATCCCCATCCCCACGCTAAAGTTCtgt < 1:3085809/125‑1 (MQ=255) aaTCCCTCTCAGCAGGACGCACTGACCGTATTCACTCGTTAATAGAAATAATTTTGtt < 1:1943378/58‑1 (MQ=11) | ATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATCACCATCACCACGCTAAAGTTCTGTGCGTTCTGTACGACGAC > Exported/791‑1061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |