Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,406,257 | 0 | C | T | 24.0% | 147.9 / 21.2 | 75 | A190T (GCC→ACC) | acrS | acrAB operon transcriptional repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/14); new base T (1/17); total (44/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTTAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCTTGTTGCTGACACGCCT > CP009273/3406121‑3406391 | gTTAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCtt > 1:21100/1‑139 (MQ=255) gTTAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCtt > 1:4137742/1‑139 (MQ=255) gTTAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCtt > 1:1568288/1‑139 (MQ=255) gTTAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCtt > 1:1572876/1‑139 (MQ=255) gTTAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTAATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATAGACCAGAGCGGGGGCtt > 1:1707525/1‑139 (MQ=255) gTTAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATAACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCtt > 1:3148079/1‑139 (MQ=255) ttAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTg > 1:46190/1‑139 (MQ=255) ttAACTGTGACCAACTGAATTTTCAGGTAAGAAATTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATTAATTAATTTCGTTTTGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACTTTATCGCCCAGAGCGGGGGCtt < 1:976204/138‑1 (MQ=255) gtgACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTtata < 1:4098273/139‑1 (MQ=255) gACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATCCGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATaa < 1:3877965/138‑1 (MQ=255) gAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGAt < 1:3076806/139‑1 (MQ=255) cTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCAt > 1:607191/1‑139 (MQ=255) aaTTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATaa > 1:12617/1‑138 (MQ=255) ttCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTGTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCt < 1:984884/116‑1 (MQ=255) ggACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCata > 1:1259265/1‑139 (MQ=255) aaTGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATaaa > 1:3156747/1‑116 (MQ=255) gtgATTTTACATGACATTTAATTCTTTCTTGTGATAAATTATTTTGTTTAGTTTTTCATCTGAA‑ATAAACATTATAAATACGTTATCGACCAGAGAGGGGGCTTGTTTATAAAGATAATAACCCGCCATATTCATTAAc < 1:276767/139‑1 (MQ=255) gtgAATTTACATGACATTTAATTCATTCGTTTGATGAATAAATTTCTTTATTTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTACCGCCCAGGGGGGGGGCTTGTTTAAAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAAc < 1:1967872/139‑1 (MQ=255) tttACATGACATTTAATTCATTCTTTTGATGAATTAATTTCGTTTTGTTTTCATCTGGT‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGCCCAGAGCGGGGGCTTTTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGtt < 1:1780762/139‑1 (MQ=255) gctcTTAATCCATTCGTTTAATTAATTATTTTTTTTTGTTTTTTACTTGGC‑ATAAACACTCTTAAATCTTTATCCACCAGAGGGGGTGTTTTTTTAAAAATTTAATAACCCGCCATATTCATTAACCATTTTTGAACaa < 1:1731966/136‑1 (MQ=255) acacTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTtata > 1:2972712/1‑98 (MQ=255) acacTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACaa > 1:373793/1‑139 (MQ=255) atttAATTCTTTGATTTGAGAAATAATTTTTGTTTTGTTTTCATCGGAC‑TAAAACATTTTAAATTCTTTCTCACCAAGCGGGGGGGTTTGTTAATAAATCCCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAAtt < 1:3806250/137‑1 (MQ=255) cTTAATTAATTCTTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCGGGC‑ATAAACATTCTTAATCCTTTACCGACAAGAGCGGGGGTTTGTTTAAAAAGATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGaa < 1:1505964/133‑1 (MQ=255) tcattcGTTAAATAATTTATTTTGTTTTTTTTTTCATCTGGT‑TTAAAATTTCTTAATACCTTAAAGCCCAGAGCGGGGTTTTTTTTATAAAGATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGa < 1:3980760/139‑1 (MQ=255) attcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAg > 1:1635619/1‑139 (MQ=255) ttcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAGCATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAg > 1:3420329/1‑138 (MQ=255) ttcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAg > 1:2255548/1‑138 (MQ=255) ttcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAg > 1:2495725/1‑138 (MQ=255) ttcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAg > 1:1820971/1‑138 (MQ=255) tcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCt > 1:3676829/1‑133 (MQ=255) ttttATGATTTAATTTCGTTTTTTTTTAAT‑TGGCAAACAACATTCTTACTCCGTAAGCACCCAGGGCGGGTGTTTGTTAAAAAAGCCAATATCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCAcc < 1:2546549/139‑1 (MQ=255) tttGATAAATTATTTTCTTTTTTTTTTCATCTGGA‑AAGAACTTTTTAAAACCGTTACCGACGAGGGGGGGGGTTTGTTTAAAAAGACCAAACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCAcc < 1:3991209/139‑1 (MQ=255) tttAATGAATTAATTTCTTTATGTTTTCATCTGGC‑ATAAACATTCTTAATCCGTTATCGACCAGAGCGGGGGTTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCAcc < 1:82351/139‑1 (MQ=255) ttatgaATTATTTTCTTTATTTTTTCATCTGCC‑ATAATCTTTTTTAATCCTTTTTCCCCCAGCGCGGGGGTTTTTTTAAAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCAt < 1:9621/137‑1 (MQ=255) tgatgaATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTACAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCa > 1:1549915/1‑138 (MQ=255) ataattaattTCGTTATTTTTTCATCTGTC‑TGAAACATTCTAAATACTTCACAGCCCAGGGGGGGGTTTTTTTTACAAAGATCAAAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaa < 1:3720688/137‑1 (MQ=255) aattatttTCGTTATTTTTTCATCTGGC‑ATGAAAATTTTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTAAAAAGATCAAAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCAt < 1:1479234/134‑1 (MQ=255) ttCGTTATGTTGTCATCTGGC‑ATGAACATTCTGAATACGGTATCTACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACAAGGTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAatca > 1:4085198/1‑139 (MQ=255) tctttATTTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGCCCAGAGCGGGGGCTTTTTTAAAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAatcat < 1:322871/136‑1 (MQ=255) gTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaataataat > 1:3650157/1‑134 (MQ=255) tATTTTTTCTTCTGCA‑ATAAAAATTCTAAATCCGTTAGCACCCAGGGGGGGGGTTTTTTTAAAAAGCACACAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATcac < 1:3290498/138‑1 (MQ=255) ttttCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACACGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCacaa < 1:2434054/136‑1 (MQ=255) ttttCATCGGGC‑ATGAACATTCTTAATCCGTTATCGACCGGAGCGGGGGCTTTTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCa < 1:1529803/114‑1 (MQ=255) tCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTa > 1:2919802/1‑139 (MQ=255) tGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTtata > 1:4040896/1‑51 (MQ=255) gggC‑AGGAACATTCTTAAAACGTTATCGACAAGGGGGGGGGTTTGTTTATAAAAATAATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCg < 1:1248954/138‑1 (MQ=255) gC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaataa > 1:3700613/1‑114 (MQ=255) gC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACACGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATc > 1:261119/1‑136 (MQ=255) aaCATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaataata > 1:1863334/1‑111 (MQ=255) tCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCt > 1:2354959/1‑139 (MQ=255) cTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCt > 1:1646439/1‑138 (MQ=255) ttAATATGTTATCGCCCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaata < 1:609499/101‑1 (MQ=255) ttAATACTTTATCGACCAGAGCGGGGGTTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATcac < 1:809336/112‑1 (MQ=255) ttAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGTTTGTTTATAAAGATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATcac < 1:2045815/112‑1 (MQ=255) aaTACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATAACAACATCTaaa > 1:2627731/1‑120 (MQ=255) aTACGTTATCGACCAGGGGGGGGGTTTTTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATcac < 1:1756524/109‑1 (MQ=255) cGTTACCGACCAGGGCGGGGGTTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAAcc < 1:629694/139‑1 (MQ=255) ttATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCtt > 1:581209/1‑139 (MQ=255) ttATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATCAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTAATTTGCTACACAACCtt > 1:101181/1‑139 (MQ=255) ttAGCGAACAGAGCGGGGGCTAGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACAAGTTTTGAACAATTCAGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAAAATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAAACtt > 1:3570085/1‑139 (MQ=255) atggaacAGAGCGGAGGTTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGAACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACAttgt > 1:3177338/7‑139 (MQ=255) aTCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAAtcatca > 1:2781926/1‑101 (MQ=255) aTCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTaaa > 1:4215557/1‑112 (MQ=255) aTCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTaaa > 1:2981449/1‑112 (MQ=255) aTCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCttgt > 1:2802082/1‑139 (MQ=255) gACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTaaa > 1:3926852/1‑109 (MQ=255) cAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAatcatc > 1:634933/1‑94 (MQ=255) cAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCTTGTTGCTg > 1:2515639/1‑138 (MQ=255) ttcGGGGGCGTGTTAAAAAAACTCATCACCCCCCCTTTTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCCGAAGGCTCCATCAATAATAATCCTCCCAACTACTAAATCGAAGTTATTTCCTTCACAACCTTGTTGCTGacac < 1:1005510/137‑1 (MQ=255) agCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCTTGTTGCTGacac > 1:1650199/1‑139 (MQ=255) gggggggTTTTTTTAAAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCTTGTTGCTGacac < 1:747613/136‑1 (MQ=255) gCGGGGGTTTGTTTAAAAAGATAATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCTTGTTGCTGacac < 1:342825/138‑1 (MQ=255) gggCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACaa > 1:1452481/1‑119 (MQ=255) gggCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCTTGTTGCTGACACGCCt > 1:3887332/1‑138 (MQ=255) | GTTAACTGTGACGAACTGAATTTTCAGGACAGAATGTGAATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGC‑ATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGCGGGGGCTTGTTTATAAAGATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCACAACATCTAAATCGAGGTTATTTGCTACACAACCTTGTTGCTGACACGCCT > CP009273/3406121‑3406391 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |