New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | Exported | = 905 | 1201 (0.050) | 25 (0.000) +AAATGCTAAAATTCCAC |
19/194 | 4.4 | 1.3% | intergenic (‑113/‑106) | aadA/fdh | aminoglycoside adenylyltransferase (Murphy, 1985)/formate dehydrogenase from Pseudomonas sp. 101 with an N‑terminal his‑tag |
? | KX077536 | 4030 = | 3070 (1.410) | intergenic (+631/‑74) | unknown/unknown | transposase/cbbM | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 425 total aligned reads displayed.
CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/768‑905 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAAGTTAAGAGGCAAGAATGCATCATCACCATCACCACATGGACCAGTCATCTCGTTACGTCAATCTGGCGCTCAAGG > KX077536/4030‑4164 ||||||||||||||||| CTTCTGCGATCACCGCTTCCCTCTTCCTCTTCCTTTTTCAATATTATTGGAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGACGGTATTTAGAAAAATAAACAAATCGCGAGTCCTATTGACAATTA < 1:2450654/139‑1 CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATAGATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:1807074/139‑1 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CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:2672125/139‑1 CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:293820/139‑1 CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:1189116/139‑1 CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:530698/139‑1 CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:664961/139‑1 CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:77559/139‑1 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TCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGGCTCATGAGCGGATGCATATTTGGATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGCGACCTATTGACAATTAAA < 1:1372633/139‑1 TCGGCGATCACCGCTACCCTCATACTCTTCCTCTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGTATACATATATGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCGCGAGACCTATTGACAATTAAA < 1:2044919/139‑1 CGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAA > 1:1501066/1‑137 CGGCGAGCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTCGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:2521474/1‑138 GCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA < 1:1341759/136‑1 CGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:572285/133‑1 tttCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGATCCATTTACACTTAAATGCTAAAACTCCc < 1:1795009/135‑2 CCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTTACAATTA < 1:1316128/120‑1 CCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA < 1:1573737/122‑1 CCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:464651/120‑1 TCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:914574/118‑1 ATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTTTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAATGCTAAAATTCCACTCAGCAG > 1:2219939/1‑139 ATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA > 1:47949/1‑116 ACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAATGCTAAAATTCCACTCAGCAGGA < 1:1720094/139‑1 CTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:824295/1‑115 TCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAA < 1:1394354/113‑1 TTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:1164740/1‑112 CCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGCCCTATTGACAATTA < 1:1123806/108‑1 CCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAATGCTAAAATTCCACTCAGCAGGACGC > 1:2346169/1‑136 CCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:1933748/1‑110 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< 1:1265349/99‑1 TATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:1065031/95‑1 TTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:351167/1‑95 TTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:2242064/93‑1 GCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:1603353/1‑90 GCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:2193920/1‑90 ATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA < 1:2585546/88‑1 TTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:37052/1‑87 TTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAA > 1:1482360/1‑86 ATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:2460942/82‑1 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1:2494783/1‑88 CATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:2111837/1‑68 CATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:2816345/1‑68 GAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCGAGAGACCTATTGACTATTAAATTCTAAAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTATAACTTTAAA < 1:2769901/139‑1 GGATCCATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAATGCTAAAATTCCACTCAGCAGGACGCAC < 1:1222621/89‑1 GGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTAAA > 1:888598/1‑61 ATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:1421991/45‑1 ATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:1014592/45‑1 TATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATTA < 1:1000627/42‑1 CTATTGACAATTAATTGCTAAAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATA > 1:1787099/1‑65 TCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAA > 1:5023/1‑65 CACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAA > 1:2542653/1‑63 CACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTT < 1:717277/59‑1 CACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAA > 1:2373091/1‑56 CACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATA > 1:1469158/1‑39 ACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAGATAATTTTGTTTAACTTTAAA > 1:2751311/1‑62 CTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAA < 1:331371/60‑1 CTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATT < 1:2719003/46‑1 CTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATA > 1:1550603/1‑43 CTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATA > 1:2300411/1‑37 CTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAAT < 1:397386/36‑1 CTCAGCAGGACGCACTGACCGAATGCACTAGTTAATAGAAATAATT < 1:1820583/46‑1 ||||||||||||||||| CTTCGGCGATCACCGCTTCCCTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGACAATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/768‑905 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAAGTTAAGAGGCAAGAATGCATCATCACCATCACCACATGGACCAGTCATCTCGTTACGTCAATCTGGCGCTCAAGG > KX077536/4030‑4164 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |