| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 567,750 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+43/‑70) | ybcM → / → ylcH | DLP12 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator/uncharacterized protein, DLP12 prophage |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 567750 = | 0 (0.000) | 51 (1.010) | 37/234 | 0.2 | 100% | noncoding (974/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 1463497 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | CP009273 | = 567754 | 0 (0.000) | 83 (1.650) | 47/234 | 0.1 | 100% | noncoding (978/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | CP009273 | 1462167 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/567621‑567754‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATG > CP009273/1462167‑1462288 TATACGTGTACTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAGGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGAT > 1:2636792/1‑139TATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGTTTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGATTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGAT > 1:1706110/1‑139 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atgTTTCATAACCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAAAAAAGCTTCCCGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTAGCGATTTTGATTTTGGGAAATGGGATTTGCCCCTATAGTTCCAGACGTCTGTT < 1:1880570/136‑1 TCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:1749773/1‑126 CATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATCTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 1:23925/139‑1 TTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCAT > 1:2090301/1‑139 TTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA < 1:473133/126‑1 TTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 1:472190/119‑1 TTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGC < 1:237367/101‑1 TATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTA < 1:1526538/101‑1 TATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGC < 1:892000/96‑1 TAACCCCAAGAGAGATAATAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCTCTTACCCCATTACAAGCC < 1:2571114/139‑1 TAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 1:1159589/139‑1 TAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 1:1980640/139‑1 ACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC > 1:1897365/1‑126 ACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 1:2772486/110‑1 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1:101950/1‑101 AGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTT > 1:2315686/1‑96 AGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCA > 1:2277400/1‑139 GAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGC < 1:584217/137‑1 AGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC > 1:1349558/1‑110 GATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGAT > 1:2453537/1‑139 ATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 1:1553930/1‑139 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AGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGC < 1:383160/139‑1 TGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCC < 1:2269637/105‑1 GTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG < 1:666273/137‑1 GTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG < 1:1128225/137‑1 TTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG < 1:2034796/121‑1 TTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG‑CCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCA > 1:20798/1‑137 TTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:504808/1‑90 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AATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATG > 1:158791/1‑125 AATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG < 1:2598402/97‑1 TATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/567621‑567754‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATG > CP009273/1462167‑1462288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |