| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 900 | NA (NA) | 38724 (1.510) | 134/134 | -0.0 | 99.9% | intergenic (‑108/‑111) | aadA/fdh | aminoglycoside adenylyltransferase (Murphy, 1985)/formate dehydrogenase from Pseudomonas sp. 101 with an N‑terminal his‑tag |
| ? | Exported | 906 = | 44 (0.000) | intergenic (‑114/‑105) | aadA/fdh | aminoglycoside adenylyltransferase (Murphy, 1985)/formate dehydrogenase from Pseudomonas sp. 101 with an N‑terminal his‑tag | |||||
Only 100 of 38724 total aligned reads displayed.
ATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/834‑900‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAA > Exported/906‑973 TGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTTTTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAA > 1:5204134/1‑68 TGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAA > 1:1404984/1‑68 TGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAA > 1:1803093/1‑68 GTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAAG < 1:2275254/68‑1 GTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATAGAAAAG > 1:3191179/1‑68 GTCCCATGAGCGGATACATATTTGACTGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAAG < 1:5504792/68‑1 TCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAAcg > 1:3811398/1‑66 TCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAAGGCT < 1:4186567/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |