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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
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ACGC‑CCGC‑GATGTGCAAATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTG < 1:1016786/232‑1 ACGC‑CCGC‑GATGTGCAAATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTAT < 1:1016776/193‑1 ACGC‑CCGC‑GATGTGCAAATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑‑AACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGC < 1:1016774/224‑1 C‑CCGC‑GATGTGCAAATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAG‑TCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAAC < 1:1016783/163‑1 CCGC‑GATGTGCAAATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGA‑CGCGGCGTATGAAGCACATGAAGAGAAGGGCGAAGTCCCGGTGATGATCACCAAGCATTGTCTGCGCTTTGCCTTTTAATCTGTGCCCGA < 1:232589/331‑1 CCGC‑GATGTGCAAATTAA‑‑TT‑C‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑‑AACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGA‑CGCGGCGTATGAAGCACATGAAGAG < 1:1016785/264‑1 GC‑GATGTGCAAATTAA‑‑TT‑CCGGGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTTAATCCGCAAAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGA‑CGCGGCGTAT < 1:1016800/252‑1 ATGTGCAAATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCGAAACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTAT < 1:1016803/220‑1 GCAAATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACC‑GTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG < 1:232697/172‑1 GCAAATT‑A‑‑TT‑C‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGA‑CGCGGCGTATGAAGCACATGAAGAGAAGGGCGAAGTCCCGGTGATGATCACC < 1:1016794/282‑1 AATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGA‑CGCGGCGTATGAAGCACATGAAGAGAAGGGCGAAGTCCCGGTGATG < 1:1016798/275‑1 AATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑‑AACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGA‑CGCGGCGTATGAAGCACATGAAGAGAAGGGCGAAGTCCCGGTG < 1:1016799/271‑1 AATTAA‑‑TT‑C‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑‑AACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGA‑CGCGGCGTATGAAGCACATGAAGAGAAGGGCGAAGTCCCGGTG < 1:1016797/270‑1 ATTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC < 1:232605/178‑1 TTAA‑‑TTGC‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCC < 1:232634/128‑1 tTT‑C‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TT‑AACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCTAGACATGCT‑GGATGCTGCTGCGT‑CTTGCCAGGTT‑ACCA < 1:232669/95‑1 T‑C‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCTCGGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCGACGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGACCGCGGCGTATGAAGCACATGAAGAG < 1:1016815/249‑1 ATGCCAGCAGATTTGCACAAAATTCGTCCACATCACCCACTAAACCGTAATCTTGATCATAACTGGCAGCAGGCACTGACAAAAACCTCCAGCGAACGTCGGGTGGCGGTAGACATTGAACTGGGCGGCTGGCAGGAACAACTGATTCTGACCCTCACCA‑GTGAAGAGGGTGTC‑AGCATCACG‑CATAC‑GCT‑GGAC‑GGG‑CAGTTCGACG‑AAGCCAAT‑AACGCCG‑‑AAAAAGCAATG‑AAC‑AATCTGAAGGATGGTCT‑GG‑C‑AAAA‑‑CT‑GGGG‑CAAACCCTCTATT‑ACGC‑CCGC‑GATGTGCAAATTAA‑‑TT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1507909‑1508212‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑C‑‑GGGGGCGCTG‑TTTGTA‑CC‑AAACAGTCTG‑TTAAACCAGTTCCGCCGTGAAGCTGCT‑GACATGCT‑GGATGCTGC‑GCGT‑CTTGCCA‑GTT‑ACCAGCGCGGCAGCCGT‑AAACCGGTTGCTGATCCTGCGCCGGTTT‑ATCCGC‑AAACGCATCTGAGTTTCCTCGCG‑AACGTATAC‑AACCAGAAAGCG‑CGTGAA‑TTTTATCATCGCTATGGTGTGCAGCTGATTGA‑CGCGGCGTATGAAGCACATGAAGAGAAGGGCGAAGTCCCGGTGATGATCACCAAGCATTGTCTGCGCTTTGCC‑TTTAATCTGTGCCCGA > NC_000913/1508216‑1508524 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |