New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 366315 = | 4436 (71.480) | 850 (22.790) +AATTCATTAAAGAGGAGAAATTAACTATGAGAGGATCTCACCATCACCATCACCATACGGATCCGGCCCTGAGGGCC |
161/234 | 0.0 | 38.7% | intergenic (‑10/+113) | lacZ/lacI | beta‑galactosidase/DNA‑binding transcriptional repressor LacI |
? | NC_000913 | = 2933013 | 49 (0.790) | coding (1/1149 nt) | fucO | L‑1,2‑propanediol oxidoreductase |
Only 100 of 3121 total aligned reads displayed.
TGGTCACTTCTGCCGCAGTACCTGCTGTGGTAGGAATTGCCAGAATCGGTACACTGGGTTTATTGGTCGGGGAAAGCCCTTCCAGGCTACGCACATCGGCAAACTCCGGGTTGTTGCTGATAA‑TGCCAATCGCTTTACAAGTATCCTGTGGAGAACCACCACCAAT‑AGCGATCAGGTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑GCGTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATCATCCTTCTCCTTGTTGCTTTACGAAATTACTCTTCAATTCGTAACCCATAGGTTTTGAATTTCTCCAGCACTACGGCAATCTCTTCATCGCTCAGCACTGGCACCGGGTCCGTAATCGCCAGGGTCGTCAGGTAAAGTTGCGCCAGCACTTCAACTTCATGCGCCAGCCATAACGCTTTTTCCAGATTCACCTCACAAGCGATAAGCCCATGATGTTGTAACAAAGTTGCCTTACGATTTTTGAGAGCCAGCGCAACATGTTCAGAAAGTTCGCGTGTTCCAAAGGTCGCATAAGGCGCGCAAGGAATAGAATTACCGCCAGCCGCCGCAATCATGTAGTGAATAGCGGGGATCGATCGGTTAAGAATGGAAACTGCCGTGCAATGAACG > NC_000913/2932569‑2933404 | 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cGCTTTACAAGTATCCTGTGGAGAACCACCACCAAT‑AGCGATCAGGTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑‑CGTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctca < 1:494456‑M2/322‑9 (MQ=255) gCTTTACAAGTATCCTGTGGAGAACCACCACCAATTAGCGATCAGGTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGC‑GTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCA‑G‑GCGTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTTTCGTTCAGAATCATTTCTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgta > 1:494256‑M2/1‑315 (MQ=255) tCCTGTGGAGAACCACCACCAAT‑AGCGATCAGGTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑CGTTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAAAG‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtatgg < 1:494597‑M2/328‑26 (MQ=255) gagaACCACCACCAAT‑AGCGATCAGGTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑GCGTTTTC‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggc < 1:494708‑M2/299‑4 (MQ=255) gagaACCACCACCAAT‑AGCGATCAGGTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑GCGTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATgg > 1:1369313‑M2/1‑295 (MQ=255) caAT‑AGCGATCAGGTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑GCGTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgta > 1:1369545‑M2/1‑283 (MQ=255) 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gTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑GCGTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctc > 1:1369782‑M2/1‑270 (MQ=255) cgcgCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTCTTTG‑GACGACAGTAAT‑GTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑GCGTT‑‑C‑ACCT‑CAT‑‑CCGGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgaga > 1:1369978‑M2/1‑263 (MQ=255) 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1:1370486‑M2/1‑228 (MQ=255) acgacAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑GCGTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccct > 1:1370565‑M2/1‑227 (MQ=255) aGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACG‑‑TCAGCG‑CCT‑CTGATAACCACG‑GCGTTTTC‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAAAG‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctctttaatgaattctgtgtgaaattgtt < 1:495720‑M2/314‑93 (MQ=255) 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1:762633‑M2/1‑52 (MQ=255) aGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTT‑‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtatgtgatggtgatggtgagatcctctcattagt < 1:497775‑M2/104‑55 (MQ=255) aCCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCAT‑‑CTGTT‑AGCC‑Agccctcagggccggatccgtatggtgagtggtgaggtgagatcctct > 1:1623307‑M2/1‑47 (MQ=255) cccc‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtat < 1:1373104‑M2/70‑24 (MQ=255) gACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtatg < 1:1373152‑M2/67‑25 (MQ=255) cAAACCATTG‑CCGTTTTCGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCCCATggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctctttaatgaattctgtgtgaaattgttatccgctcacaattga > 1:42838‑M2/1‑43 (MQ=255) t‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccct > 1:1373025‑M2/1‑33 (MQ=255) t‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggcgatcgtatggtgatggtgatggtgag < 1:1373225‑M2/64‑39 (MQ=255) t‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagg < 1:1373260‑M2/36‑11 (MQ=255) aGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctcttttaatgaattctgtgtgaaattgttatccgctcac > 1:42730‑M2/1‑20 (MQ=255) tCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggcggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctctttaatgaattctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaagcctggggtg < 1:1373304‑M2/167‑152 (MQ=255) cTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctctttaatgaattctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacaca < 1:497987‑M2/124‑114 (MQ=255) cTGTT‑AGCC‑ATggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctctttaatgaattctgtgtga > 1:702457‑M2/1‑11 (MQ=255) tGTT‑AGCC‑Agcctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagtt > 1:692669‑M2/1‑10 (MQ=255) | TGGTCACTTCTGCCGCAGTACCTGCTGTGGTAGGAATTGCCAGAATCGGTACACTGGGTTTATTGGTCGGGGAAAGCCCTTCCAGGCTACGCACATCGGCAAACTCCGGGTTGTTGCTGATAA‑TGCCAATCGCTTTACAAGTATCCTGTGGAGAACCACCACCAAT‑AGCGATCAGGTAATCCGCGCCGCTATTCTGGAATACACC‑GAGCCCTTCTTT‑GACGACAGTAATTGTTGGGTTGGGCACTACGCCGTCGTAAATCGCCC‑ATGCCAGCCCTGCAGCATCCATCTT‑ATCGGTCACTTT‑CGCCACCACGCCGCATTGCACCAGCGTTTT‑ATCGGT‑GACGA‑TCAGCG‑CCTTCTGATAACCACG‑GCGTTT‑C‑ACCT‑CAT‑‑C‑GGTTAAA‑G‑CCCCAA‑CAGCACCCC‑GACCAAACCAT‑G‑CCGTTT‑CGTTCAGAATCATT‑CTGTT‑AGCC‑ATCATCCTTCTCCTTGTTGCTTTACGAAATTACTCTTCAATTCGTAACCCATAGGTTTTGAATTTCTCCAGCACTACGGCAATCTCTTCATCGCTCAGCACTGGCACCGGGTCCGTAATCGCCAGGGTCGTCAGGTAAAGTTGCGCCAGCACTTCAACTTCATGCGCCAGCCATAACGCTTTTTCCAGATTCACCTCACAAGCGATAAGCCCATGATGTTGTAACAAAGTTGCCTTACGATTTTTGAGAGCCAGCGCAACATGTTCAGAAAGTTCGCGTGTTCCAAAGGTCGCATAAGGCGCGCAAGGAATAGAATTACCGCCAGCCGCCGCAATCATGTAGTGAATAGCGGGGATCGATCGGTTAAGAATGGAAACTGCCGTGCAATGAACG > NC_000913/2932569‑2933404 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |