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gtAAAAACGA‑GGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTG‑‑‑AAATTGTTATCCGCTCAC‑AATTCCAC‑AC‑AACAT‑ACGAGCCGGAAGCAT‑AAAGTGTAAAGCCT‑GGGGTGCCTAATGAGTGAGCT‑AACTTACATT‑AATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGGCGGTTTGCGTATTGGGCG < 1:26130/250‑1 tAAAAACGACGGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGA‑‑AAATTGTTATCCGCTCAC‑AATTCCAC‑AC‑AACAT‑ACGAGCCGGAAGCAT‑AAAagtg < 1:387109/108‑5 tAAAAACGACGGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTG‑‑‑AAATTGTTATCCGCTCAC‑AATTCCAC‑AC‑AACAT‑ACGAGCCGGAAGCAT‑AAAGTGTAAAGCCT‑GGGGTGCCTAATGAGTGAGCT‑AACTTACATT‑AATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCC‑ACGCGC < 1:26115/222‑1 tAAAAACGA‑GGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGA‑‑AAATTGTTATCCGCTCAC‑AA‑TCCAC‑AC‑AACAT‑ACGAGCCGGAAGCAT‑AAAGTGTAAAGCCT‑GGGGTGCCTAATGAGTGAGCT‑AACTTACATT‑AATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATT < 1:26111/203‑1 AAAAAACGACGGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCT < 1:971345/48‑1 AAAAACGACGGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTG‑‑‑AAATTGTTATCCGCTCAC‑AATTCCACAAC‑AACAT‑ACGAGCCGGAAGCATAAAAGTGTAAAGCCT‑G < 1:1065778/117‑1 AAAAACGACGGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTG‑‑‑AAATTGTTATCCGCTCAC‑AATTCCAC‑AC‑AACAT‑ACGAGCCGGAAGCAT‑AAAagtg < 1:387138/107‑5 AAAAACGA‑GGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTG‑‑‑AAAATGTTATCC < 1:1162966/63‑1 ||| AGTATCGGCCTCAGGAAGATCGCACTCCAGCCAGCTTTCCGGCACCGCTTCTGGTGCCGGAAACCAGGCAAAGCGCCATTCGCCATTCAGGCTGCGCAACTGTTGGGAAGGGCGATCGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGC‑AAGGCGATT‑AAGTTGGGT‑AACGCC‑AGGGTTTT‑CCCAGTC‑ACGACGTTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/366054‑366270 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAACGACGGCC‑AGTG‑AATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTG‑‑‑AAATTGTTATCCGCTCAC‑AATTCCAC‑AC‑AACAT‑ACGAGCCGGAAGCAT‑AAAGTGTAAAGCCT‑GGGGTGCCTAATGAGTGAGCT‑AACTCACATT‑AATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGA‑GGCGGTTTGCGTATTGGGCGCC > NC_000913/366271‑366521 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |