New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 3969 total aligned reads displayed.
CGGCCTCAGGAAGATCGCACTCCAGCCAGCTTTCCGGCACCGCTTCTGGTGCCGGAAACCAGGCAAAGCGCCATTCGCCATTCAGGCTGCGCAACTGTT‑GGGAA‑GGGCGATCGGTGC‑GGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGCTGGCGAAA‑GGGGGATGT‑GCTGCAAGGCGATT‑AAGTT‑GGGTAACGCCA‑GGG‑TTTT‑CCCAGTCACGACGTTG‑T‑AAAACGACGGC‑‑C‑AG‑TGAAT‑CCGTAATCA‑TGGTCATAGCTG‑TTTCC‑TGT‑GT‑G‑AAA‑TTGTTATCC‑G‑CTC‑AC‑AATTCC‑AC‑AC‑AACATACGAG‑CCGGAAGCAT‑AAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCT‑AACTCACATTAATTGCG‑TTGCGCT‑CACTG‑CCCGC‑TTTCCAGTC‑GGG‑AAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAAT‑CGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGC‑GCCAGGGTGG‑TTTTTCTTTTCACCAGTGAGA‑CGGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGG > NC_000913/366059‑366684 | 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catcttatcggtcacttttcgccaccacgccgcattgcaccagcgttttatcggtgacgatcagcgccttctgataaccacggcgttttcacctcatcggttaaagccccaacagcaccccgaccaaaccatgccgtttcgttcagaatcattctgttagccatggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctctttaatgaattC‑TGT‑GT‑G‑AAA‑TTGTTATCC‑G‑CTC‑Ac‑aattgaa < 1:726052‑M1/32‑4 (MQ=255) catcttatcggtcactttcgccaccacgccgcattgcaccagcgttttatcggtgacgatcagcgccttctgataaccacggcgtttcacctcatcggttaaagccccaacagcacccccgaccaaaccatgccgtttcgttcagaatcattctgttagccatggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctctttaatgaattC‑TGT‑GT‑G‑AAA‑TTGTTAtcc‑g‑ctc‑ac‑aattgaatctattat > 1:211079‑M1/241‑269 (MQ=255) caccacgccgcattgcaccacgttttatcggtgacgatcagcgccttctgataaccacggcgtttccacctcatcggttaaagccccaacagccaccccgaccaaaccatgccgtttcgttcagaatcattctgttagccatggccctcagggccggatccgtatggtgatggtgatggtgagatcctctcatagttaatttctcctctttaatgaattC‑TGT‑GT‑G‑AAA‑TTGtt > 1:26609‑M1/220‑234 (MQ=255) 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c‑GGGCCTCTTCGCTA‑TACG‑CAGCTGGCGAAA‑GGGGGATGT‑GCTGCAAGGCGATT‑AAGTT‑GGGTAACGCCA‑GGG‑TTTT‑CCCAGTCACGACGTTG‑T‑AAAACGACGGC‑‑C‑AG‑TGAAT‑CCGTAATCA‑TGGTCATAGCTG‑TTTCC‑TGT‑GT‑G‑AAA‑TTGTTATCC‑GTCTC‑AC‑AATTCC‑AC‑AC‑AACATACGAG‑CCGGAAGCAT‑AAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCT‑AACTTACATTAATTGCG‑TTGCGCT‑CACTG‑CCCGC‑tt > 1:25405/1‑265 (MQ=255) ttCGCTATTACG‑CAGCTGGCGAAA‑GGGGGATGT‑GCTGCAAGGCGATT‑AAGTTGGGGTAACGCCAGGGG‑TTTT‑CCCAGTCACGACGTTG‑T‑AAAACGACGGC‑‑C‑AG‑TGAAT‑CCGTAATCA‑TGGTCATAGCTG‑TTTCC‑TGT‑GT‑G‑AAA‑TTGTTATCC‑G‑CTC‑AC‑AATTCC‑AC‑AC‑AACATACGAG‑CCGGAAGCAT‑AAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCT‑AACTtaca > 1:385997/1‑231 (MQ=255) cgctgtACGCCAGCTGGCGAAA‑GGGGGATGT‑GCTGCAAGGCGATT‑AAGTTGGGGTAACGCCAGGGG‑TTTT‑CCCAGTCACGACGTTG‑T‑AAAACGACGGC‑‑C‑AG‑TGAAT‑CCGTAATCA‑TGGTCATAGCTG‑TTTCC‑TGT‑GT‑G‑AAA‑TTGTTATCC‑G‑CTC‑AC‑AATTCC‑AC‑AC‑AACATACGAG‑CCGGAAGCAT‑AAAGTGTAAAGCCTGGGGTg > 1:386049/6‑206 (MQ=255) 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NC_000913/366059‑366684 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |