Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 2163325 2163331 7 2 [1] [1] 2 baeS sensory histidine kinase BaeS

TCAACGGTGCGGAAGTTGGCGCGGTGATCGCCTCCCCCGTTGAGCGGTT  >  NC_000913/2163279‑2163327
                                             |   
tCAACGGTGCGGAAGTTGGCGCGGTGATCGCCTCCCCCGTTGAGCg     >  1:71267/1‑46 (MQ=255)
   aCGGTGCGGAAGTTGGCGCGGTGATCGCCTCCCCCGTTGAGCGGtt  <  2:71266/46‑1 (MQ=255)
                                             |   
TCAACGGTGCGGAAGTTGGCGCGGTGATCGCCTCCCCCGTTGAGCGGTT  >  NC_000913/2163279‑2163327

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: